两株副溶血弧菌基因组序列分析及其在不同盐度下毒力相关基因表达差异和转录组学研究

发布时间：2021-03-21 15:53

　　副溶血弧菌（Vibrio parahaemolyticus）是一种广泛存在于海水、半咸水环境中的人畜共患菌,会引发人腹泻呕吐等胃肠疾病,也会导致鱼虾蟹贝等水生生物疾病。因凡纳滨对虾盐度适应性广,抗病能力强,目前我国淡水养殖凡纳滨对虾发展迅速,随着养殖动物引入,原海水病原随宿主进入淡水水域,引发了淡水养殖对虾的新疾病。随着环境盐度的改变,海水病原菌通过提高细菌增殖能力以及对宿主的粘附能力来适应低盐环境并引发疾病。本文以两株不同环境下分离的致病性副溶血弧菌为研究对象,对两株副溶血弧菌进行了全基因组测序,检测了两株副溶血弧菌的毒力因子和致病力,并在不同盐度下对其生长速率和毒力基因的定量表达做了研究,结合不同盐度下两株副溶血弧菌的转录组学信息,探讨了盐度对副溶血弧菌转录和生长的影响,为探究环境因素与副溶血弧菌致病力的关系提供了科学依据。本文利用Illumina Hiseq测序平台对本实验中的两株副溶血弧菌进行全基因组测序,结果显示副溶血弧菌V9株基因组大小为5489686bp,GC含量45.23%,预测得到5202个基因,总长度为4645029bp,包括108个tRNA,1个rRNA。菌株38... 

【文章来源】：上海海洋大学上海市

【文章页数】：99 页

【学位级别】：硕士

【部分图文】：

菌株V9CGView基因组圈图

17图 2-2 菌株 383chr1CGView 基因组圈图Figure 2-2 CG View genomic map of strain 383 chr1

18图 2-2 菌株 383chr2CGView 基因组圈图Figure 2-2 CG View genomic map of strain 383 chr2

【参考文献】：
期刊论文
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[3]盐度对副溶血性弧菌生物特性的影响[J]. 沈津宇,倪莹,高璐.  现代食品. 2018(06)
[4]2016年河北省唐山市淡水养殖环节中副溶血性弧菌监测结果分析[J]. 秦磊,王建红,高静,李成林.  医学动物防制. 2018(04)
[5]T3SS1和T3SS2影响副溶血弧菌生物学特性及细胞致病性的比较[J]. 白雪瑞,王权,凌娇,万莹,陈永军,方维焕,孙卫东,蒋蔚.  微生物学报. 2018(03)
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[7]温度对副溶血弧菌T3SS中相关基因表达的影响[J]. 丁晓燕,曲凌云,王琛,田欣欣,孙承君,王敏强.  海洋科学进展. 2016(02)
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博士论文
[1]酸耐受副溶血性弧菌生物学特性及转录组、蛋白组分析[D]. 马月姣.上海海洋大学 2016
[2]基于RNA-Seq技术的米曲霉RIB40转录组学研究[D]. 王斌.华南理工大学 2010
[3]迟缓爱德华氏菌Ⅲ型分泌系统（T3SS）输送器蛋白及分子伴侣的研究[D]. 王波.中国科学院研究生院（海洋研究所） 2009

硕士论文
[1]霍乱弧菌T6SS针状蛋白VgrG3及其免疫蛋白的结构和功能研究[D]. 张九龙.中国科学技术大学 2014



本文编号：3093136