扬州地区乙型肝炎病毒不同基因型C基因区特征及突变分析

发布时间：2021-03-24 06:23

　　目的:研究扬州地区乙型肝炎病毒（hepatitis B virus, HBV）C基因区的基因特征,分析不同基因型间突变差异,为临床提供参考。方法:扩增HBV核酸C基因区并测序,Clustal W比对构建距离矩阵,MegAlign比对突变位点,分析不同基因型间核苷酸同源性和相似度;比较不同基因型间突变比例和突变频率间的差异,分析引起血清转换的突变。结果:测序成功31条序列,基因B型20例,C型11例,总突变率为77.4%,同源相似度分别为:96.1%～99.7%和98.1%～100.0%;基因B型有2例核苷酸G1896A和G1899A联合突变;氨基酸替换频率分别为:8.7/序列、3.3/序列;不同基因型突变比例和氨基酸替换频率的差异有统计学意义（χ2=5.10, P=0.023, 95%CI:1.14～49.26;χ2=21.65, P<0.001, 95%CI:1.816～4.650）。结论:扬州地区HBV C基因区同源相似度高,遗传距离小;HBV突变率高,存在产生血清学转换的核苷酸联合突变株,对病毒免疫学检验产生影响。 

【文章来源】：南通大学学报(医学版). 2020,40(05)

【文章页数】：4 页

【部分图文】：

基因C区PCR产物凝胶电泳

研究样本和参考序列的系统发生树


本文编号：3097234