桃树PpADC基因克隆及逆境胁迫表达分析

发布时间：2021-03-30 04:29

　　多胺广泛参与植物生长、发育等生理生化进程和植物逆境应答反应,精氨酸脱羧酶（ADC）是植物多胺生物合成途径中的关键酶.为研究桃树ADC基因的结构和逆境胁迫转录表达情况,试验利用同源序列法克隆桃树PpADC基因,对基因序列、编码蛋白结构等进行生物信息学分析,应用qRT-PCR检测基因PpADC在不同逆境胁迫过程中的转录表达量.结果表明,桃树PpADC基因含有一个2 178 bp的开放阅读框,编码725个氨基酸,基因序列中不含有内含子结构;该基因编码蛋白与白梨精氨酸脱羧酶相似值高达90.14%,系统进化树分析表明PpADC基因与白梨、苹果和湖北海棠等蔷薇科果树ADC基因亲缘关系较近;低温、脱水、盐和乙烯处理能不同程度上调PpADC基因的转录表达水平,表明该基因在桃树应答逆境胁迫过程中发挥重要作用. 

【文章来源】：西南师范大学学报(自然科学版). 2020,45(07)北大核心

【文章页数】：8 页

【部分图文】：

桃树PpADC基因编码蛋白质的功能结构域

桃树PpADC基因编码蛋白质的二级结构

图3 桃树PpADC基因编码蛋白质的二级结构利用NCBI数据库, 将PpADC基因编码的氨基酸序列与其他物种ADC基因编码氨基酸进行比对, 发现它们具有较高的相似性, 其中与白梨PbADC基因编码氨基酸相似值为90.14%, 与苹果MdADC基因编码氨基酸的相似值为89.84%, 与湖北海棠MhADC基因编码氨基酸相似值为89.56%, 与葡萄VvADC基因编码氨基酸的相似值为78.55%, 与杧果MiADC基因编码氨基酸的相似值为74.49%, 与枳PtADC基因编码氨基酸的相似值为73.58%, 与拟南芥AtADC1和AtADC2基因编码氨基酸的相似值分别为74.28%和72.12%(图5).


本文编号：3108864