百脉根Hsp70s基因家族的生物信息学分析

发布时间：2021-04-03 03:53

　　热激蛋白（HSPs）是细胞受逆境诱导产生的一类具有稳定蛋白质结构、修复变性蛋白和维护生物膜稳定等功能的分子伴侣,同时,在缓解植物高温伤害和提高热耐受性等方面有重要的调控作用。根据百脉根基因组数据,利用生物信息学方法对百脉根Hsp70基因（LjHsp70s）家族的基因结构、染色体分布、选择压力、顺式作用元件、表达特性和系统进化等进行分析。结果表明,LjHsp70s家族有18个成员,分为4类,它们的内含子和外显子数量为1～8,含有多个保守基序,分布在6条染色体上,编码602～703个氨基酸,均编码酸性亲水蛋白;含有激素、光照及胁迫等响应顺式作用元件,LjHsp70s在百脉根的根、茎、叶等部位均有表达,但其表达量不同;该家族基因在进化过程中主要受负选择作用,进化上较为保守,家族成员与拟南芥和烟草的Hsp70基因可分为6组,但是百脉根LjHsp70s基因仅存在于4个亚族中,表明其与拟南芥、烟草的Hsp70s基因家族成员之间进化关系密切,同时也存在一定差异。LjHsp70s基因在百脉根的各个部位均有表达,对百脉根生长发育过程起着重要的作用,研究结果为解析百脉根LjHsp70s基因功能提供了依据。 

【文章来源】：山地农业生物学报. 2020,39(05)

【文章页数】：8 页

【部分图文】：

百脉根、拟南芥和烟草的Hsp70s基因家族成员的系统发育树

为充分了解百脉根LjHsp70s基因家族的组成和分布形式,根据其在染色体上的定位信息,制作染色体分布图(图4),以 Chr0 代表对所有不能定位到染色体的基因所虚构的一条染色体[17]。百脉根LjHsp70s基因家族18个成员分布于6条染色体内,在染色体中分布的位置有所不同,大多数分布于染色体的两端;其中每条染色体中的LjHsp70s基因个数有所差异,1号染体上分布最多,含有7个家族成员,并且LjHsp70-5、LjHsp70-6、LjHsp70-7、LjHsp70-8四个基因以串联重复出现;6号染色体上含有3个家族成员,4号染色体上含有2个家族成员,2号和3号染色体上分布最少,仅有1个基因家族成员,将4个不能确定位置的成员归纳于Chr0染色体上。图3 百脉根LjHsp70s基因保守结构域蛋白分析

百脉根LjHsp70s基因保守结构域蛋白分析


本文编号：3116566