谷子和青狗尾草bZIP基因家族鉴定与谷子SibZIP8基因的功能研究
发布时间：2021-04-05 14:50
干旱是影响粮食作物产量的主要逆境因素之一。谷子及其野生种青狗尾草抗旱耐瘠,是植物抗逆性研究的理想模型。bZIP转录因子在植物抵抗非生物胁迫方面发挥重要作用。bZIP转录因子在多种植物中已被鉴定,然而在谷子和青狗尾草中还未见相关报道。本研究利用生物信息学和分子生物学的方法,对谷子Setaria italica bZIP（SibZIP）和青狗尾草Setaria viridis bZIP（SvbZIP）的蛋白理化性质、染色体定位、同源性关系、基因结构、保守域等进行全面的分析,并利用转录组测序的数据对谷子SibZIP和青狗尾草SvbZIP基因的表达谱进行了分析,为后续功能研究提供信息。主要研究结果如下:（1）利用HMMER在全基因组水平共鉴定了90个谷子SibZIP基因和89个青狗尾草SvbZIP基因,参考之前模式植物拟南芥的命名方法,根据基因在染色体的位置,分别命名为SibZIP1-SibZIP90和SvbZIP1-SvbZIP89。另外通过构建谷子、青狗尾草、拟南芥和水稻的342条bZIP氨基酸序列的系统进化树,将谷子和青狗尾草bZIP基因各分成10个亚族,分别是A、B、C、D、E、F、G...
【文章来源】：山西农业大学山西省
【文章页数】：59 页
【学位级别】：硕士
【部分图文】：
谷子和青狗尾草bZIP基因家族染色体定位比较分析
-19-图2-2谷子SibZIP，青狗尾草SvbZIP，拟南芥AtbZIP和水稻OsbZIP系统发育树Fig.2-2PhylogenetictreeofMilletSibZIP,GreenfoxtailSvbZIP,ArabidopsisAtbZIPandriceOsbZIP图2-3谷子SibZIP和青狗尾草SvbZIP系统发育树Fig.2-3PhylogenetictreeofMilletSibZIPandGreenfoxtailSvbZIP
-19-图2-2谷子SibZIP，青狗尾草SvbZIP，拟南芥AtbZIP和水稻OsbZIP系统发育树Fig.2-2PhylogenetictreeofMilletSibZIP,GreenfoxtailSvbZIP,ArabidopsisAtbZIPandriceOsbZIP图2-3谷子SibZIP和青狗尾草SvbZIP系统发育树Fig.2-3PhylogenetictreeofMilletSibZIPandGreenfoxtailSvbZIP
【参考文献】：
期刊论文
[1]谷子抗旱性鉴定研究进展[J]. 崔纪菡,范佳兴,李顺国,赵宇,刘猛,宋世佳,任晓利,刘斐,南春梅,夏雪岩. 东北农业大学学报. 2017(01)
[2]不同品种谷子幼苗对干旱胁迫的生理响应及SiZFP252基因的表达分析[J]. 张耀元,张彬,马芳芳,丁美娇,胡韬光,李萍,韩渊怀. 山西农业大学学报(自然科学版). 2016(09)
[3]谷子萌芽期对干旱胁迫的响应及抗旱性评价[J]. 代小冬,杨育峰,朱灿灿,鲁晓民,王春义,杨晓平,杨国红,李君霞. 华北农学报. 2015(04)
[4]不同品种谷子种子萌发期对干旱胁迫的生理响应及其抗旱性评价[J]. 裴帅帅,尹美强,温银元,黄明镜,张彬,郭平毅,王玉国,原向阳. 核农学报. 2014(10)
[5]谷子抗旱研究进展[J]. 张雁明,刘晓东,马建萍,温琪汾,韩渊怀. 山西农业科学. 2013(03)
[6]不同生态区主要育成谷子品种芽期耐旱性鉴定[J]. 秦岭,杨延兵,管延安,张华文,王海莲,刘宾,陈二影. 植物遗传资源学报. 2013(01)
[7]谷子孕穗期一些生理性状与品种抗旱性的关系[J]. 张文英,智慧,柳斌辉,李伟,王永芳,李海权,贾冠清,栗雨勤,刁现民. 华北农学报. 2011(03)
[8]干旱胁迫对谷子孕穗期光合特性的影响[J]. 张文英,智慧,柳斌辉,李明哲,李伟,谢俊雪,宋庆荣,刁现民. 河北农业科学. 2011(06)
[9]植物bZIP转录因子的生物学功能[J]. 张计育,渠慎春,郭忠仁,杜小丽,都贝贝,章镇. 西北植物学报. 2011(05)
[10]Genome-wide Expansion and Expression Divergence of the Basic Leucine Zipper Transcription Factors in Higher Plants with an Emphasis on Sorghum[J]. Jeevanandam Vanitha,Srinivasan Ramachandran. Journal of Integrative Plant Biology. 2011(03)
硕士论文
[1]二氧化硫在谷子和拟南芥干旱胁迫过程中的生理作用[D]. 刘佳.山西大学 2015
[2]不同谷子品种抗旱性比较及干旱相关基因表达分析[D]. 张雁明.山西农业大学 2014
[3]谷子耐旱资源筛选及其遗传多样性分析[D]. 朱学海.中国农业科学院 2008
本文编号：3119836
【文章来源】：山西农业大学山西省
【文章页数】：59 页
【学位级别】：硕士
【部分图文】：
谷子和青狗尾草bZIP基因家族染色体定位比较分析
-19-图2-2谷子SibZIP，青狗尾草SvbZIP，拟南芥AtbZIP和水稻OsbZIP系统发育树Fig.2-2PhylogenetictreeofMilletSibZIP,GreenfoxtailSvbZIP,ArabidopsisAtbZIPandriceOsbZIP图2-3谷子SibZIP和青狗尾草SvbZIP系统发育树Fig.2-3PhylogenetictreeofMilletSibZIPandGreenfoxtailSvbZIP
-19-图2-2谷子SibZIP，青狗尾草SvbZIP，拟南芥AtbZIP和水稻OsbZIP系统发育树Fig.2-2PhylogenetictreeofMilletSibZIP,GreenfoxtailSvbZIP,ArabidopsisAtbZIPandriceOsbZIP图2-3谷子SibZIP和青狗尾草SvbZIP系统发育树Fig.2-3PhylogenetictreeofMilletSibZIPandGreenfoxtailSvbZIP
【参考文献】：
期刊论文
[1]谷子抗旱性鉴定研究进展[J]. 崔纪菡,范佳兴,李顺国,赵宇,刘猛,宋世佳,任晓利,刘斐,南春梅,夏雪岩. 东北农业大学学报. 2017(01)
[2]不同品种谷子幼苗对干旱胁迫的生理响应及SiZFP252基因的表达分析[J]. 张耀元,张彬,马芳芳,丁美娇,胡韬光,李萍,韩渊怀. 山西农业大学学报(自然科学版). 2016(09)
[3]谷子萌芽期对干旱胁迫的响应及抗旱性评价[J]. 代小冬,杨育峰,朱灿灿,鲁晓民,王春义,杨晓平,杨国红,李君霞. 华北农学报. 2015(04)
[4]不同品种谷子种子萌发期对干旱胁迫的生理响应及其抗旱性评价[J]. 裴帅帅,尹美强,温银元,黄明镜,张彬,郭平毅,王玉国,原向阳. 核农学报. 2014(10)
[5]谷子抗旱研究进展[J]. 张雁明,刘晓东,马建萍,温琪汾,韩渊怀. 山西农业科学. 2013(03)
[6]不同生态区主要育成谷子品种芽期耐旱性鉴定[J]. 秦岭,杨延兵,管延安,张华文,王海莲,刘宾,陈二影. 植物遗传资源学报. 2013(01)
[7]谷子孕穗期一些生理性状与品种抗旱性的关系[J]. 张文英,智慧,柳斌辉,李伟,王永芳,李海权,贾冠清,栗雨勤,刁现民. 华北农学报. 2011(03)
[8]干旱胁迫对谷子孕穗期光合特性的影响[J]. 张文英,智慧,柳斌辉,李明哲,李伟,谢俊雪,宋庆荣,刁现民. 河北农业科学. 2011(06)
[9]植物bZIP转录因子的生物学功能[J]. 张计育,渠慎春,郭忠仁,杜小丽,都贝贝,章镇. 西北植物学报. 2011(05)
[10]Genome-wide Expansion and Expression Divergence of the Basic Leucine Zipper Transcription Factors in Higher Plants with an Emphasis on Sorghum[J]. Jeevanandam Vanitha,Srinivasan Ramachandran. Journal of Integrative Plant Biology. 2011(03)
硕士论文
[1]二氧化硫在谷子和拟南芥干旱胁迫过程中的生理作用[D]. 刘佳.山西大学 2015
[2]不同谷子品种抗旱性比较及干旱相关基因表达分析[D]. 张雁明.山西农业大学 2014
[3]谷子耐旱资源筛选及其遗传多样性分析[D]. 朱学海.中国农业科学院 2008
本文编号：3119836
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