基于二代测序技术检测肺肉瘤样癌患者的基因突变与肿瘤突变负荷的研究

发布时间：2021-04-06 05:05

　　目的:探求肺肉瘤样癌（Pulmonary Sarcomatoid Carcinomas,PSC）可能的靶向基因,为寻找有效的靶向药物提供线索。研究PSC的肿瘤突变负荷（Tumor Mutation Burden,TMB）变化水平,为免疫检查点抑制剂治疗提供可行的依据。材料与方法:我们利用二代测序技术（Next Generation Sequencing,NGS）检测32例PSC组织标本中416种癌症相关基因和肿瘤突变负荷。结果:我们共发现216种癌症相关基因共有516种突变类型。其中较为常见的突变基因为TP53（69%）,EGFR（28%）,RB1（25%）,KRAS（22%）,ARID1A（22%）,KMT2B（22%）,RET（22%）。PSC患者EGFR突变中敏感突变占25%,罕见突变为75%。PSC患者MET阳性率为16%。其中外显子14跳跃突变率为60%。TMB范围是7到45个突变/Mb,TMB中位数为15个突变/Mb。当BRCA2、SMARCA4突变时,TMB显著升高。多因素回归分析认为肿瘤分期是影响PSC患者预后的独立因素。KRAS阳性的III-Ⅳ期PSC患者,OS时间较... 

【文章来源】：苏州大学江苏省

【文章页数】：46 页

【学位级别】：硕士

【部分图文】：

例PSC患者所有的突变情况

图 2 32 例 PSC 患者突变频率较高的基因 (A-B) ；每个 PSC 患者 TMB 数目 (C)其中 EGFR、KRAS 和 MET 突变频率最高的三种分子驱动基因 (图 2.A)。具体突变情况可见附录。我们在 9 例 PSC 患者，共发现 11 个 EGFR 点突变，1 个 EGFR外显子 19 缺失。11 个点突变，其中 1 个位于外显子 12（G485S）、1 个位于外显子13（G544D）、1 个位于外显子 18（G724S）、2 个位于外显子 19（A750P、K757R）、1 个位于外显子 20（T790M）、4 个位于外显子 21（V845M、L858R、L858R、L861Q）、1 个位于外显子 25（D1014G）。其中 4 例位于外显子 21 的点突变中仅有 2 例为 L858R突变。有 1 例 PSC 患者同时存在 L858R 和 T790M 突变。EGFR-TKI 敏感突变占 25%。EGFR 罕见突变为 75%。7 例患者（22%）检测出 KRAS 错义突变，且均为激活突变，包括 6 例为外显2( G12C/V 突变)，1 例为外显子 3 (Q61K 突变)。5 例患者（16%）出现 MET 突变。包括 3 例外显子 14 (D1028N)，1 例内含子 13(c.2942-28_2942-13 缺失突变)，另外 1 例外显子 12 H904N 是一种首次发现的突变类

图 3.TMB 和不同基因突变的关系析访结束，共有 11 例患者存活，其中 1 例 T2aN0M0 PSCs 患者无进展生存期长达 10.6 个月。32 例患者生存时间为 1.5 个月至为 7.9 个月，1 年生存率达到 50%。 例 PSC 患者的生存进行多因素 Cox 回归分析，对总生存期的多


本文编号：3120818