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中药火麻仁基原植物大麻LBD基因家族成员的鉴定与表达分析

发布时间:2021-04-08 03:02
  LBD(lateral organ boundaries)转录因子在植物生长发育和次生代谢调控中起着重要作用。为了发掘大麻LBD基因的功能,该研究在基因组和转录组水平上利用生物信息学手段,对大麻LBD基因家族进行系统鉴定,并对其表达模式进行分析。结果表明,大麻LBD基因家族含有32个成员,可分成2大类,7亚族,ClassⅠ分为5个亚族分别是ClassⅠa至ClassⅠe,ClassⅡ分为2个亚族分别是ClassⅡa和ClassⅡb;理化性质分析显示,大麻LBD基因家族编码的氨基酸数目为172~356,等电点为4.92~9.43,相对分子质量为18 862.92~40 081.33,大部分成员定位于细胞核中;染色体定位显示32个成员不均一地分布在大麻的10条染色体上;LBD转录因子结构域、基因结构和Motifs相对保守,不同类成员特征相近;基因上游启动子区含有多种植物激素及环境因子相关的顺式作用元件,表明LBD基因的表达可能会受到激素和外界环境因素的诱导;大麻LBD基因在ZYS品种(低四氢大麻酚,高二... 

【文章来源】:中国中药杂志. 2020,45(22)北大核心CSCD

【文章页数】:10 页

【部分图文】:

中药火麻仁基原植物大麻LBD基因家族成员的鉴定与表达分析


大麻LBD基因在染色体上的分布

分布图,转录因子,大麻,基序


大麻LBD转录因子保守基序和基因结构分析

序列,转录因子,基序,家族


LBD转录因子家族的3个保守基序

【参考文献】:
期刊论文
[1]高大麻二酚(CBD)含量药用大麻的新品种选育及生产[J]. 张际庆,陈士林,尉广飞,宁康,王超群,王磊,陈华,董林林.  中国中药杂志. 2019(21)
[2]药用大麻种质资源分类与研究策略[J]. 李秋实,孟莹,陈士林.  中国中药杂志. 2019(20)
[3]中国工业大麻品种选育研究进展[J]. 曹焜,王晓楠,孙宇峰,韩承伟,张晓艳,赵越,姜颖,韩喜财,郭永霞.  中国麻业科学. 2019(04)
[4]葡萄LBD基因家族的鉴定与表达分析[J]. 何红红,马宗桓,张元霞,张娟,卢世雄,张志强,赵鑫,吴玉霞,毛娟.  中国农业科学. 2018(21)
[5]萝卜全基因组中LBD基因家族成员的鉴定与分析[J]. 刘同金,张晓雪,张晓辉,王海平,邱杨,宋江萍,李锡香.  植物遗传资源学报. 2019(01)
[6]大麦ASYMMETRIC LEAVES2/LATERAL OR-GAN BOUNDARIES(AS2/LOB)基因家族的全基因组分析(英文)[J]. Bao-jian GUO,Jun WANG,Shen LIN,Zheng TIAN,Kai ZHOU,Hai-ye LUAN,Chao LYU,Xin-zhong ZHANG,Ru-gen XU.  Journal of Zhejiang University-Science B(Biomedicine & Biotechnology). 2016(10)
[7]辣椒全基因组中LBD转录因子的鉴定与表达分析[J]. 郑忠凡,张亚利,胡灿,戴雄泽,刘峰,袁祖华.  园艺学报. 2016(04)
[8]蒺藜苜蓿LBD转录因子基因家族全基因组分析[J]. 贾喜涛,刘文献,谢文刚,刘志鹏,刘志敏,王彦荣.  西北植物学报. 2014(11)
[9]番茄LBD基因家族的全基因组序列鉴定及其进化和表达分析[J]. 王小非,刘鑫,苏玲,孙永江,张世忠,郝玉金,由春香.  中国农业科学. 2013(12)
[10]汉麻—一种高值特种生物质资源及应用[J]. 张华,张建春,张杰.  高分子通报. 2011(08)

博士论文
[1]巨桉、毛果杨、雷蒙德氏棉LBD基因家族的研究[D]. 芦强.中国林业科学研究院 2017

硕士论文
[1]不同工业大麻品种耐镉性及原花青素缓解镉胁迫功能分析[D]. 黄玉敏.中国农业科学院 2019



本文编号:3124722

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