桃果实PpTIFY10b基因的克隆与表达分析

发布时间：2021-04-09 19:44

　　采用同源克隆方法从‘京红’桃及其晚熟芽变果实中克隆出PpTIFY10b基因,初步分析了该基因的理化性质,并利用荧光定量PCR（RT-PCR）分析了该基因在‘京红’桃以及其突变体中的表达情况,以期揭示桃果实成熟机制提供基本数据支持。结果表明:该基因开放阅读框为639 bp,编码213个氨基酸,等电点为9.04,为以丝氨酸为主的亲水性不稳定蛋白。同源性比对和结构分析表明,该基因与其它植物TIFY10b蛋白具有较高的相似性,其中与梅的一致性最高,均含有1个TIFY功能结构域和1个CCT基序。荧光定量PCR结果表明,该基因在桃及其晚熟芽变果实的生理成熟期表达量最高,但二者的表达规律有显著差异,即晚熟芽变在S1、S4时期的基因表达量上调,且明显高于‘京红’,表明PpTIFY10b基因参与了果实成熟调控。该研究为了解桃果实成熟期调控机制提供了新颖的理论数据。 

【文章来源】：北方园艺. 2020,(22)北大核心

【文章页数】：8 页

【部分图文】：

电泳检测图

PpTIFY10b蛋白中TIFY结构域分析

利用TMHMM预测表明,该蛋白的213个氨基酸都位于胞外,并不存在跨膜结构域,可推断PpTIFY10b是一种非跨膜蛋白,不发生跨膜运动(图4A)。SingalP预测表明,该蛋白信号肽剪切位点的概率仅为0.1,故不存在信号肽(图4B)。该蛋白的二级结构以α-螺旋(h)和无规则卷曲(c)为主要结构,分别占24.41%和62.91%,其次为延长链(e)和转角(t),分别占7.51%、5.16%,具体氨基酸位置见图4C。利用同源建模方法对一级氨基酸序列搜索靶序列,预测出PpTIFY10b蛋白的三级结构为一个α-螺旋的模型(图4E),是拟南芥Myc3 N-末端结构域(44～242)与JAZ10 Jas结构域(166～192)的复合体的模板,由PpTIFY10b蛋白一级结构中的第154～170位氨基酸构成(图4D)。图4 PpTIFY10b蛋白的结构预测图

【参考文献】：
期刊论文
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博士论文
[1]高羊茅春化和光周期调控相关基因的克隆及差异表达研究[D]. 王小利.四川农业大学 2010

硕士论文
[1]苹果醛脱氢酶（ALDH）和TIFY基因家族的鉴定、系统进化及表达分析[D]. 李肖琴.西北农林科技大学 2014
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[3]水稻逆境应答基因OsTIFY10b的克隆与分析[D]. 刘跃林.四川农业大学 2012



本文编号：3128209