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基于RNAi干扰美国白蛾神经肽F及其受体基因功能分析

发布时间:2021-04-09 20:40
  美国白蛾(Hyphantria cunea Drury)是一种世界性检疫害虫,危害多种植物,给社会经济发展、生态环境造成严重损失。昆虫神经肽能够激活G蛋白偶联受体(G Protein coupled receptors,GPCRs),从而调控多种生理功能,破坏昆虫神经肽信号转导可以达到控制害虫的目的。本研究以美国白蛾为研究对象,克隆获得神经肽(Neuropeptides F,NPF)和短神经肽(Short neuropeptide F,sNPF)及其受体基因cDNA全长,并利用RNAi技术(dsRNA和siRNA)进行基因功能研究,对NPF/NPFR基因功能和对美国白蛾取食及生殖、饥饿胁迫进行了功能分析,具体结论如下:1、成功鉴定出 HcNPF、HcsNPF、HcNPFR、HcsNPFR-A10 与 HcsNPFR-A11 基因,获得其全长基因序列,基因阅读框(ORF)长246~1401bp,编码81~466个氨基酸,蛋白的分子质量为9.25kDa~52.94kDa,pI为6.73~9.25,HcsNPFR-A10为酸性蛋白,其余为碱性蛋白。HcNPF和HscNPF均含信号肽。成熟肽的... 

【文章来源】:东北林业大学黑龙江省 211工程院校 教育部直属院校

【文章页数】:77 页

【学位级别】:硕士

【部分图文】:

基于RNAi干扰美国白蛾神经肽F及其受体基因功能分析


图2-2美国白蛾各组织总RNA??Fig.?2-2?Total?RNA?of?different?tissues?in?H.?cunca??注:1:头;2:中肠;3:卵巢;4:精巢

序列,保守区,序列,蛋白


ale程序计??算美国白蛾NPF蛋白的疏水性图谱,HcNPFR的疏水性较强,最大值达到3.456,且位??于N端的信号肽剪切处,最小值为-3.133。氨基酸疏水性较强位在75,85,111,150,??185,?247,?276位附近,而氨基酸亲水性较强位在59,265,354位附近。HcNPF蛋白??中亮氨酸Leu?(48个)的相对含量最多占氨基酸总数的12.28%。信号肽预测结果显??示,HcNPFR不含信号肽序列。跨膜结构分析结果显示,HcNPFR蛋白拥有7个跨膜螺??旋结构(图2-6)。HcNPFR蛋白的保守结构域分析结果显示,HcNPFR蛋白具有G蛋??白偶联受体家族典型的结构特点7个跨膜结构域,属于GPCRs家族(图2-7)。??TMHMM?posterior?probabilities?for?HcNPFR??1.2??.?.?■???■?.?.???"OffiE??50?100?150?200?250?300?350??transmembrane???inside??outside????图2-6?TMHMM软件分析HcNPFR跨膜区结果??Fig.?2-6?Prediction?of?transmembrane?regions?of?HcNPFR?using?TMHMM?software??I?.?.?,?.?T?,?.?.?.?y?.?.?.?,?,?T?.?.?>?F?"f?.?w???■.?y?■?...?y?T??^?B?balls?I?v?■?kails??b?b?ib?m?hath??Superfanilies?7t-nj_fIPnR!=:

序列,昆虫,进化树,蛋白


?,?NP_001127739.1?);小菜蛾(尸;cv/o^//g,XP_011565078.1?);黑脉金斑蝶(Z).?p/打抑ws,??OWR47452.1);美国白蛾(//?〇//瓶z)。??黑色横线表示跨膜结构域。??通过BLASTP多序列比对,选择8种昆虫的NPFR蛋白与HcNPFR蛋白进行多序??列比对分析。结果显示HcNPFR与其它昆虫NPFR蛋白具有一定的序列保守性,同源性??为67.32%?93.46%,且在各种昆虫的NPFR的跨膜结构域具有最高的保守性(图2-??8)。构建的9种昆虫的NPFR的系统进化树如图2-9所示,美国白蛾NPFR蛋白与斜??纹夜蛾(S.?///wra)、棉铃虫(//??wm/gera)、烟芽夜蛾(//.?v/msrmsO神经肽亲缘关系??近而聚为一支,但与家蚕的关系较远。??92?Helicoverpa?armigera???Zf_??He?Hot?his?virescens??72???—??Spodoptera?litura??31??A?Hyphantria?cunea???Plutella?xylostella????42??Papilio?xuthus??37?Danaus?plexippus???Chilo?suppressalis???Bombyx?mori??图2-9?9种昆虫NPFR蛋白系统进化树??Fig.?2-9?Phylogenetic?analysis?of?NPFR?proteins?from?9?insects??注:棉铃虫(//.?arw/gera,XP_021189905.1);烟芽夜蛾(//??v/m

【参考文献】:
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博士论文
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[2]桔小实蝇Tachykinin和Natalisin信号系统的生理功能及其药靶潜力评估[D]. 桂顺华.西南大学 2017

硕士论文
[1]棉铃虫神经肽allatotropin G蛋白偶联受体的克隆和鉴定[D]. 王郡.合肥工业大学 2016



本文编号:3128278

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