小麦抗赤霉病QTL Qfhb.yzu-4B候选基因TaG3LEA的克隆和生物信息学分析

发布时间：2021-04-11 19:28

　　本课题组前期的蛋白组学研究发现一个小麦赤霉病抗性相关基因,该基因编码三型胚胎发育晚期丰富蛋白（G3LEA）,该蛋白只在抗病品种中富集。已有研究表明,该基因在高等植物中广泛的参与了生长、发育及各种逆境抵御的调控过程。本研究利用美国国立生物技术信息中心数据库（NCBI）获取小麦TaG3LEA基因CDS序列并和测序小麦品种“中国春”参考序列进行比对,该基因位于4B染色体上已知抗赤霉病QTL区间。根据前期关联分析结果,日本小麦品种TOKAII66在4B染色体上已知抗赤霉病QTL上携带有利变异,而美国小麦品种Clark携带不利等位变异,然后设计了扩增的引物并分别扩增小麦品种TOKAII66和Clark的TaG3LEA基因,将扩增的特异片段回收、克隆和测序,根据碱基差异开发了可区别抗、感等位变异的基因特异性标记并利用开发的功能标记对244个小麦品种构成的自然群体进行基因型分析,明确不同等位变异在自然群体中的分布。接着对接种赤霉菌和接种绿豆汤的小麦TOKAII66和苏麦3号（在目标位点上携带不利等位变异）做不同时期的表达模式分析;采用生物信息学方法解析了小麦TaG3LEA家族基因的进化。主要结果如下... 

【文章来源】：扬州大学江苏省

【文章页数】：75 页

【学位级别】：硕士

【部分图文】：

图１：在中国春预测的的基因结构

PCR检测DNAFigZAgarose酬electroPhoresls

３０?扬州大学硕士学位论文测序结果表明ＴＯＫＡＩＩ６６和Ｃｌａｒｋ之间仅存在１个ＳＮＰ变异，该ＳＮＰ位于起始密码上游约１?ｋｂ的位置，是顺式作用元件ＥＢＯＸＢＮＮＡＰＡ?ＡＢＲＥ?（ＡＢＡ响应元件）的核心基。随后，我们将该ＳＮＰ转化为ＣＡＰＳ标记，标记交由华大基因公司合成。??中国春参考序列??

【参考文献】：
期刊论文
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硕士论文
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本文编号：3131829