基于基因芯片技术的大肠癌差异甲基化分析

发布时间：2021-04-12 13:18

　　背景大肠癌是严重危害人类生命健康、降低人类生存质量的下消化道恶性肿瘤,包括结肠癌和直肠癌。早期识别、诊断和治疗大肠癌对改善疾病预后有着重要的意义。然而,目前大肠癌的发病机制尚未明确阐述,DNA甲基化作为表观遗传学修饰的重要组成部分,与包括大肠癌在内的多种肿瘤的发生发展密切相关。筛选疾病特异性甲基化基因、构建疾病特异甲基化表达谱是当前研究的热点之一。目的应用基因芯片技术对大肠癌和癌旁正常黏膜组织标本进行差异甲基化分析,初筛样本中差异甲基化位点和区域,构建大肠癌特异性甲基化基因表达谱。对筛选出的差异甲基化位点和区域进行GO和KEGG分析,为进一步阐明大肠癌发生发展的分子机制、寻找潜在的特异性早期大肠癌诊断分子标志物及可能的基因靶向治疗位点提供理论依据。方法应用美国Illumina公司基因甲基化450k芯片对上海交通大学医学院附属仁济医院6例大肠癌患者的癌组织和癌旁正常黏膜组织标本进行差异甲基化分析,包括差异甲基化位点分析、差异甲基化区域分析及亚组差异甲基化位点分析,共分析位点431467个,按P值筛选出差异甲基化位点和区域,按甲基化β差值区分高甲基化和低甲基化。并对筛选出的差异甲基化位点和... 

【文章来源】：上海交通大学上海市 211工程院校 985工程院校 教育部直属院校

【文章页数】：52 页

【学位级别】：硕士

【部分图文】：

各样本的电泳图谱

上海交通大学硕士学位论文表 2 各样本过滤掉的探针比例Table 2 The proportion of probes filtered out in samples称 过滤探针比例 样本名称 过滤探针C 0.00024 04-P 0.0002C 0.00017 31-P 0.0001C 0.00062 36-P 0.0007C 0.00056 46-P 0.0005C 0.00020 68-P 0.0002C 0.00067 82-P 0.0006

0.00017 31-P 0.00016 0.00062 36-P 0.00070 0.00056 46-P 0.00056 0.00020 68-P 0.00021 0.00067 82-P 0.00062图 2-1 各样本原始 β 值的探针密度分布Fig. 2-1 The probe density plot of raw data of each sample

【参考文献】：
期刊论文
[1]非编码RNA在Barrett食管中作用的研究[J]. 余捷,薛寒冰.  胃肠病学. 2017(07)
[2]肿瘤的表观遗传学研究[J]. 孙树汉.  中国肿瘤生物治疗杂志. 2008(01)



本文编号：3133364