膨大弯颈霉基因组进化及交配型基因的初步研究

发布时间：2021-04-24 07:17

　　膨大弯颈霉（Tolypocladium inflatum）隶属子囊菌门（Ascomycota）、粪壳菌纲（Sordariomycetes）、肉座菌目（Hypocreales）、线虫草科（Ophiocordycipitaceae）、弯颈霉属（Tolypocladium）。膨大弯颈霉是甲虫幼虫的病原菌,也是免疫抑制药物环孢菌素（Cyclosporins）的生产菌^[1]。以往对膨大弯颈霉的研究工作主要集中在优化环孢菌素的生产工艺上,而分子生物学方面的研究相对较少,GenBank中收录的膨大弯颈霉基因组数据十分有限。我们首次完成膨大弯颈霉线粒体基因组的组装和注释工作。到目前为止,它的线粒体基因组是线虫草科中最小的,全长仅25 kb。整个基因组排列紧凑,包含了所有标准的线粒体编码基因,还含有一个内含子。转录分析验证了多数保守基因的表达。序列分析还发现线粒体基因向细胞核转移的证据。通常认为,动物的mtDNA比nrDNA进化快,真菌中是否也如此还不确定。本课题组装了5株膨大弯颈霉菌株的线粒体基因组,并且比较分析了线粒体基因组和核基因组核苷酸的变异情况。结果表明,5株菌线粒体基因... 

【文章来源】：山西大学山西省

【文章页数】：60 页

【学位级别】：硕士

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中文摘要
ABSTRACT
第一章 绪论
    1.1 线粒体
        1.1.1 线粒体概述
        1.1.2 线粒体基因组概述
        1.1.3 真菌线粒体基因组组成与特征
        1.1.4 真菌线粒体基因组研究进展
    1.2 膨大弯颈霉概述
    1.3 研究目的和意义
    1.4 技术路线
第二章 膨大弯颈霉线粒体基因组测序及数据分析
    2.1 前言
    2.2 实验材料、仪器和试剂
        2.2.1 实验材料
        2.2.2 实验仪器
        2.2.3 实验试剂
    2.3 实验方法
        2.3.1 菌株培养
        2.3.2 DNA的提取
        2.3.3 引物设计
        2.3.4 DNA片段的扩增
        2.3.5 转录组测序
        2.3.6 线粒体与细胞核间基因转移验证
        2.3.7 数据分析
    2.4 结果分析
        2.4.1 膨大弯颈霉线粒体基因组概述
        2.4.2 线粒体基因组核苷酸序列的碱基组成
        2.4.3 PCG氨基酸使用分析
        2.4.4 膨大弯颈霉线粒体基因组的重复元件
        2.4.5 膨大弯颈霉线粒体基因转录分析
        2.4.6 膨大弯颈霉线粒体基因组与核基因组的共有片段
        2.4.7 系统发育分析
    2.5 小结与讨论
第三章 膨大弯颈霉比较基因组学分析
    3.1 前言
    3.2 实验方法
        3.2.1 菌株培养
        3.2.2 原始数据处理
        3.2.3 可用数据分析
    3.3 实验结果
        3.3.1 膨大弯颈霉线粒体基因组比较分析
        3.3.2 膨大弯颈霉核基因组比较分析
    3.4 小结与讨论
第四章 膨大弯颈霉交配型的检测与分析
    4.1 前言
    4.2 实验材料
    4.3 实验方法
        4.3.1 菌株培养
        4.3.2 基因组DNA提取
        4.3.3 引物设计
        4.3.4 交配型基因检测
    4.4 实验结果
        4.4.1 单子囊孢子菌株培养
        4.4.2 菌株交配型检测结果
        4.4.3 交配型基因测序结果分析
    4.5 小结与讨论
参考文献
攻读学位期间取得的硏究成果
致谢
个人简况及联系方式


【参考文献】：
期刊论文
[1]子囊菌交配型基因MAT1-1的系统发育[J]. 王雪亮,史洋,张艳华,孙凤杰,潘洪玉.  菌物学报. 2015(06)
[2]真菌线粒体基因组计划的研究进展[J]. 刘沐桑,郑楠,张原,刘维达.  国际皮肤性病学杂志. 2012 (05)
[3]线粒体基因组:结构特点和基因含量进化[J]. 陈念,赖小平.  生物学杂志. 2011(01)
[4]蛹虫草（Cordyceps militaris）的交配型研究[J]. 高新华.  食用菌学报. 2008(01)
[5]线粒体基因组（mtDNA）的研究进展[J]. 汪泰初,刘朝良,肖林珍.  安徽农业科学. 2006(10)
[6]线粒体基因组的遗传与进化研究进展[J]. 潘宝平,卜文俊.  生物学通报. 2005(08)
[7]线粒体DNA的研究与应用[J]. 熊庆,刘作易,喻子牛.  西南农业学报. 2002(03)
[8]植物的线粒体基因组研究[J]. 崔萍,霍丽云.  山东轻工业学院学报(自然科学版). 2000(01)



本文编号：3156933