幽门螺杆菌抗生素耐药基因突变位点鉴定与幽门螺杆菌感染相关胃癌ceRNA调控网络分析

发布时间：2021-04-25 06:39

　　目的:幽门螺杆菌（Helicobacter pylori,H.pylori）感染是多种胃疾病的重要病因,截止目前其致病机制仍不十分清楚。近年来,随着根除治疗的广泛实施,H.pylori对抗生素的耐药性逐年增加。本研究在前期工作基础之上主要聚焦于两个方面,1.筛选鉴定与H.pylori克拉霉素（clarithromycin,CAM）,左氧氟沙星（levofloxacin,LVX）和甲硝唑（metronidazole,MNZ）耐药相关基因突变位点;2.构建H.pylori感染相关胃癌差异基因ceRNA调控网络,探讨相关分子的生物学功能和预后相关性。本研究将为H.pylori感染相关耐药性与致病性的进一步深入研究提供线索和理论依据。研究方法:1.利用分子对接模拟分析本组前期研究获得的9个23S rRNA耐药相关突变位点、35个rdxA耐药相关突变位点、4个gyrA耐药相关突变位点与CAM,LVX和MNZ之间的相互作用,以明确可能的耐药相关突变位点。进一步利用自然转化方法对筛选出的部分位点进行体外验证。2.从TCGA数据库中提取有或无H.pylori感染的胃癌患者RNA表达数据,包括20例H.... 

【文章来源】：中国医科大学辽宁省

【文章页数】：62 页

【学位级别】：硕士

【文章目录】：
摘要
Abstract
英文缩略语
第一部分 :幽门螺杆菌抗生素耐药基因突变位点分析鉴定
    1 前言
    2 材料与方法
        2.1 主要试剂耗材和仪器设备
            2.1.1 主要试剂耗材
            2.1.2 主要仪器设备
        2.2 方法
            2.2.1 研究对象
            2.2.2 抗生素与耐药相关基因的分子对接分析
            2.2.3 耐药相关突变位点的自然转化验证
    3 结果
        3.1 H.pylori23Sr RNA突变位点分子对接分析
        3.2 H.pylori rdx A突变位点分子对接分析
        3.3 H.pylori gyr A突变位点分子对接分析
        3.4 H.pylori耐药相关突变位点的自然转化验证
    4 讨论
    5 结论
第二部分 :幽门螺杆菌感染相关胃癌ceRNA调控网络分析
    1 前言
    2 材料与方法
        2.1 主要试剂耗材和仪器设备
            2.1.1 主要试剂耗材
            2.1.2 主要仪器设备
        2.2 方法
            2.2.1 研究对象
            2.2.2 生物信息学分析
            2.2.3 H.pylori感染的判定
            2.2.4 组织总RNA提取、反转录及实时荧光定量PCR
        2.3 统计学分析
    3 结果
        3.1 H.pylori感染相关胃癌DElnc RNA,DEmi RNA和 DEm RNA的筛选鉴定
        3.2 H.pylori感染相关胃癌ce RNA网络的建立
        3.3 参与ce RNA网络的m RNA细胞功能和通路富集分析
        3.4 参与ce RNA网络的lnc RNA和 mi RNA的预后分析
        3.5 差异表达lnc RNA的 q RT-PCR验证
    4 讨论
    5 结论
本研究创新性的自我评价
参考文献
综述
    参考文献
攻读学位期间取得的研究成果
致谢
个人简历



本文编号：3158900