基于线粒体和核基因序列分析单环刺螠（Urechis unicinctus）种群遗传多样性

发布时间：2021-04-25 07:06

　　单环刺螠是一种身体不分节,两侧对称,并有体腔的软体海洋蠕虫,具有丰富的营养价值和药用价值。隶属螠虫动物门（Echiurioidea）、螠纲（Echiurida）、无管螠目（Xenopneusta）、刺螠科（Urechidae）、刺螠属（Urechis）,是无管螠目在我国沿海分布的唯一种类。其分布区狭窄,主要分布于中国渤海湾、韩国和日本海域。由于海洋污染导致单环刺螠栖息地减少,再加上过度捕捞致使其种群数量的大范围缩减。然而,对于单环刺螠种群的遗传多样性和结构都没有采取过系统性研究。在本研究,我们收集了中国渤海湾（烟台、大连、莱州、秦皇岛、葫芦岛）、韩国庆尚道南海郡共6个地区105个单环刺螠样品,并结合GenBank中9个COI和1个28S-rRNA日本样品的基因序列,通过线粒体COI（457 bp）,16S-rRNA（451bp）与核基因28S-rRNA（680 bp）基因片段,对单环刺螠种群遗传多样性和遗传结构进行分析。基于COI序列,单环刺螠遗传多样性仍居于较高程度（单倍型多样性:0.9595,核苷酸多样性:0.0101）。在3个基因标记中,由28S-rRNA序列所定义的遗传多样性最... 

【文章来源】：鲁东大学山东省

【文章页数】：64 页

【学位级别】：硕士

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致谢
摘要
Abstract
第1章 引言
    1.1 单环刺螠的研究概况
        1.1.1 形态特征
        1.1.2 分布及分类地位
        1.1.3 生殖和发育
        1.1.4 营养价值与药用价值
        1.1.5 研究现状
        1.1.6 待解决问题
    1.2 种群遗传多样性概述与研究方法
        1.2.1 种群遗传多样性概述
        1.2.2 种群遗传多样性研究方法
            1.2.2.1 形态学方法
            1.2.2.2 细胞方法
            1.2.2.3 分子标记方法
        1.2.3 分子系统树的构建
            1.2.3.1 距离矩阵法（Distance-matrixmethods）
            1.2.3.2 最大简约法（Maximumparsimony）
            1.2.3.3 最大似然法（MaximumLikelihoodmethod）
            1.2.3.4 贝叶斯法（Bayesianmethod）
    1.3 线粒体与核基因在海洋生物群体遗传学的应用
        1.3.1 线粒体COI基因在海洋生物群体遗传学的应用
        1.3.2 线粒体16S-rRNA基因在海洋动物群体遗传学的应用
        1.3.3 核基因28S-rRNA在海洋动物群体遗传学的应用
    1.4 本研究的目的与意义
第2章 材料与方法
    2.1 供试材料
    2.2 DNA的提取
    2.3 PCR扩增
    2.4 PCR扩增产物检测
    2.5 序列测定
    2.6 数据处理
        2.6.1 序列分析
        2.6.2 单倍型系统进化关系
        2.6.3 种群遗传结构
        2.6.4 种群历史动态
第3章 结果分析
    3.1 单环刺螠遗传多样性
    3.2 单环刺螠种群遗传结构
    3.3 单环刺螠群体历史动态
第4章 讨论
    4.1 单环刺螠遗传多样性和种群遗传结构
    4.2 单环刺螠种群历史动态
第5章 总结
参考文献
作者简历



本文编号：3158943