基于多数据库分析外泌体基因在肝细胞癌中的表达及其意义

发布时间：2021-04-27 00:29

　　目的通过对多个数据库中筛选出的肝细胞癌（HCC）患者癌组织和血液中外泌体差异表达基因的分析,挖掘与HCC预后密切相关的外泌体关键基因,并揭示HCC发展的分子机制。方法应用GEO、TCGA以及exoRbase数据库筛选出HCC患者癌组织和血液中差异表达的外泌体基因,并通过Survival R语言程序获得与预后密切相关的关键基因,通过构建CeRNA网络对关键基因进行可视化分析,并应用基因富集分析（GSEA）对关键基因进行功能预测。结果从GEO、TCGA及exoRbase数据库中筛选出HCC癌组织及血液中差异表达的外泌体mRNA 38个,lncRNA 23个,miRNA 274个,进一步确定了与预后密切相关的8个外泌体关键基因,即lncRNA GTF2IRD2P1、hsa-miR-23b-3p、hsa-miR-206、hsa-miR-613、PTMA、CDC42、HNRNPA3、STK4;通过构建CeRNA网络,发现hsa-miR-613可分别竞争性结合lncRNA GTF2IRD2P1、CDC42、PTMA、HNRNPA3,hsa-miR-206可分别竞争性结合lncRNA GTF2IRD... 

【文章来源】：精准医学杂志. 2020,35(04)

【文章页数】：5 页

【文章目录】：
1 材料和方法
    1.1 数据库中差异表达的外泌体基因的筛选
    1.2 与预后密切相关的关键基因的筛选及可视化分析
    1.3 外泌体关键基因的功能富集分析
2 结 果
    2.1 数据库中筛选出的差异表达的外泌体基因
    2.2 差异表达的外泌体基因的预后分析结果
    2.3 关键基因的功能富集分析结果
3 讨 论



本文编号：3162410