罗汉果3-羟基-3-甲基戊二酰辅酶A还原酶基因的克隆及表达分析
发布时间:2021-05-01 01:06
3-羟基-3-甲基戊二酰辅酶A还原酶(3-hydroxy-3-methylglutaryl coenzyme A reductase, HMGR)是萜类甲羟戊酸途径(mevalonic acid pathway,MVA)中的第一个限速酶,是细胞质中萜类代谢途径中的重要调控位点。该研究以授粉后0,1,3,15,30 d的罗汉果为实验材料,基于转录组数据,从罗汉果cDNA中克隆得到2个HMGR基因,分别命名为SgHMGR2(GenBank登录号MT270447)和SgHMGR3(GenBank登录号MT270448)。基因包含开放阅读框(ORF)分别为1 746,1 782 bp,编码582,594个氨基酸,生物信息学分析推测其分子质量分别为62.7,63.2 kDa,等电点(theoretical pI)为8.34,7.47,均不含信号肽,为非分泌型蛋白,并且存在2个跨膜结构。结合蛋白质保守结构域以及进化树分析,证实该基因确为HMGR家族基因。利用实时荧光定量PCR检测SgHMGRs在授粉后不同时间的罗汉果中的表达模式,结果表明SgHMGRs均在授粉后15 d表达量最高。该研究首次从罗汉...
【文章来源】:中国中药杂志. 2020,45(20)北大核心CSCD
【文章页数】:7 页
【文章目录】:
1 材料
1.1 植物
1.2 试剂
1.3 仪器
2 方法
2.1 罗汉果总RNA的提取及cDNA的制备
2.2 罗汉果HMGRs基因的全长克隆
2.3 罗汉果HMGRs的生物信息学分析
2.4 罗汉果HMGRs基因的表达模式分析
3 结果与分析
3.1 罗汉果总RNA的提取及HMGRs基因的克隆
3.2 罗汉果HMGRs蛋白的生物信息学分析
3.3 罗汉果HMGRs蛋白的序列比对及系统进化树的构建
3.4 罗汉果HMGRs系统进化树的构建
3.5 不同授粉时间后罗汉果HMGRs基因表达模式的分析
4 讨论
本文编号:3169838
【文章来源】:中国中药杂志. 2020,45(20)北大核心CSCD
【文章页数】:7 页
【文章目录】:
1 材料
1.1 植物
1.2 试剂
1.3 仪器
2 方法
2.1 罗汉果总RNA的提取及cDNA的制备
2.2 罗汉果HMGRs基因的全长克隆
2.3 罗汉果HMGRs的生物信息学分析
2.4 罗汉果HMGRs基因的表达模式分析
3 结果与分析
3.1 罗汉果总RNA的提取及HMGRs基因的克隆
3.2 罗汉果HMGRs蛋白的生物信息学分析
3.3 罗汉果HMGRs蛋白的序列比对及系统进化树的构建
3.4 罗汉果HMGRs系统进化树的构建
3.5 不同授粉时间后罗汉果HMGRs基因表达模式的分析
4 讨论
本文编号:3169838
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