高粱GRF基因家族鉴定及SbGRF4原核表达分析

发布时间：2021-05-05 18:55

　　为研究高粱生长调控因子（growth-regulating factor,GRF）在高粱生长过程中的功能,采用生物信息学分析方法对高粱GRF基因家族进行鉴定,并以高粱BTx623品种为材料,利用PCR技术扩增获得SbGRF4基因cDNA全长序列,构建pET-28a-SbGRF4重组质粒,采用原核表达技术分别对表达菌株、诱导温度以及异丙基-β-D-硫代半乳糖苷（isopropyl-β-D-thiogalactopyranoside,IPTG）诱导浓度进行优化,最后用Western blot技术对原核表达的SbGRF4蛋白进行验证。结果表明,在高粱中共鉴定到10个GRF基因SbGRF1～SbGRF10;亚细胞定位预测结果显示均定位于细胞核中;分布于高粱的6条染色体上,所有家族成员均含有QLQ和WRC保守结构域;系统进化结果显示,高粱GRF蛋白分为Class 2、Class 3、Class 4a、Class 4b四个亚家族;相同亚家族各个成员间外显子和内含子的数量差异较小;同一亚家族的高粱GRF蛋白保守基序具有相似性;克隆到的SbGRF4基因c DNA序列全长为1 221 bp,并成功构建p... 

【文章来源】：植物保护学报. 2020,47(04)北大核心CSCD

【文章页数】：10 页

【文章目录】：
1 材料与方法
    1.1 材料
    1.2 方法
        1.2.1 高粱GRF基因家族鉴定及生物信息学分析
        1.2.2 高粱GRF基因家族的系统进化分析
        1.2.3 高粱SbGRF4基因的克隆及测序
        1.2.4 SbGRF4蛋白的可溶性表达条件筛选
        1.2.5 SbGRF4蛋白的Western blot检测
2 结果与分析
    2.1 高粱GRF基因家族鉴定及其生物信息学分析
    2.2 高粱GRF基因家族系统进化分析
    2.3 高粱SbGRF4基因的克隆
    2.4 高粱SbGRF4蛋白的原核表达条件
        2.4.1 SbGRF4表达菌株的筛选
        2.4.2 SbGRF4蛋白表达的诱导温度筛选
        2.4.3 SbGRF4蛋白表达的诱导剂IPTG浓度筛选
    2.5 SbGRF4蛋白的Western blot检测结果
3 讨论


【参考文献】：
期刊论文
[1]龙眼GRF家族全基因组鉴定及表达模式[J]. 刘蒲东,张舒婷,陈晓慧,苏立遥,姚德恒,李汉生,张梓浩,陈裕坤,林玉玲,赖钟雄.  应用与环境生物学报. 2020(02)
[2]藜麦GRF转录因子家族的鉴定及表达分析[J]. 时丕彪,何冰,费月跃,王军,王伟义,魏福友,吕远大,顾闽峰.  作物学报. 2019(12)
[3]海岛棉生长调控因子GRF基因家族的全基因组及表达分析[J]. 赵柯柯,范蓉,刘亚丽,石颖颖,姜梦辉,陈全家.  新疆农业大学学报. 2019(03)
[4]茶树GRF基因家族的全基因组鉴定及表达分析[J]. 王鹏杰,郑玉成,林浥,周珍,杨江帆,叶乃兴.  西北植物学报. 2019(03)
[5]WRKY转录因子在植物抗病反应中的功能研究进展[J]. 禹阳,贾赵东,马佩勇,郭小丁,谢一芝,边小峰.  分子植物育种. 2018(21)
[6]毛竹GRF转录因子家族的全基因组鉴定与分析[J]. 何龙燕,刘武阳,娄永峰,肖复明.  植物科学学报. 2018(05)
[7]沉默转录因子OsERF7提高水稻对褐飞虱和白背飞虱的抗性[J]. 陈梦婷,周书行,张月白,杨丽娟,吕静,娄永根.  植物保护学报. 2018(05)
[8]油菜GRF基因家族的鉴定和基本特征分析[J]. 阮先乐,王俊生,刘红占,赵锦慧.  分子植物育种. 2018(08)
[9]桃GRF基因家族的序列及其组织特异性表达分析[J]. 曹珂,薛灵姿,王蛟,方伟超,朱更瑞,陈昌文,王新卫,王力荣.  植物遗传资源学报. 2018(03)
[10]GRF转录因子对植物生长发育及胁迫响应调控的分子机制[J]. 马超,原佳乐,张苏,贾琦石,冯雅岚.  核农学报. 2017(11)

硕士论文
[1]利用原核系统表达富含二硫键蛋白质的探索与改进[D]. 刘开泉.山东农业大学 2011



本文编号：3170406