陆地棉蔗糖转运蛋白基因家族的鉴定及表达分析

发布时间：2021-05-10 15:08

　　蔗糖转运蛋白（SUT）在蔗糖从"源"到"库"的运输与分配过程中发挥着重要作用。该研究基于最新公布的陆地棉基因组数据,利用生物信息学和荧光定量PCR等方法,对陆地棉SUT基因家族进行全基因组鉴定,并对他们的表达特性进行系统分析。结果显示:（1）在陆地棉基因组中,共鉴定到18个GhSUT基因（GhSUT1-GhSUT18）,他们不均匀地分布在陆地棉11条染色体上。（2）GhSUT蛋白间序列一致性很高,均具有11～12个跨膜结构域,且都定位于质膜。（3）进化关系分析表明,陆地棉GhSUT蛋白主要分布在双子叶植物特有的SUT1亚组,以及单、双子叶植物共有的SUT2亚组和SUT4亚组,其中SUT1亚组成员最多,包含8个GhSUT基因。（4）位于同一亚组的GhSUT基因具有相似的内含子-外显子分布模式,不同亚组间GhSUT基因内含子/外显子数目差异很大。（5）转录组分析表明,GhSUT基因在表达水平上存在差异,GhSUT1和GhSUT10在被检测的组织不表达,GhSUT5、GhSUT14、GhSUT7和GhSUT16在被检测的组织表达量较低,其他GhSUT基因在被检测的组织具有较高的表达水平;另外... 

【文章来源】：西北植物学报. 2020,40(08)北大核心CSCD

【文章页数】：10 页

【文章目录】：
1 材料和方法
    1.1 实验材料
    1.2 方 法
        1.2.1 陆地棉SUT家族成员的鉴定
        1.2.2 蛋白序列分析和亚细胞定位预测
        1.2.3 系统进化树分析
        1.2.4 基因结构和染色体定位分析
        1.2.5 基因表达特性的转录组分析
        1.2.6 RNA的提取和cDNA反转录
        1.2.7 荧光定量PCR(qRT-PCR)分析
2 结果与分析
    2.1 陆地棉SUT基因家族的全基因组鉴定
    2.2 陆地棉SUT家族成员的蛋白序列分析
    2.3 陆地棉SUT家族成员的系统进化树分析
    2.4 陆地棉SUT家族成员的基因结构分析
    2.5 陆地棉SUT家族成员的染色体分布
    2.6 陆地棉SUT家族基因表达特性的转录组分析
    2.7 陆地棉GhSUT基因组织表达特性分析
3 讨 论


【参考文献】：
期刊论文
[1]陆地棉蔗糖磷酸合成酶基因家族的鉴定及表达分析[J]. 晁毛妮,胡海燕,付丽娜,温青玉,胡根海,骆雨锋,李娅楠,王清连.  棉花学报. 2020(01)
[2]植物蔗糖转运蛋白研究进展[J]. 张清,胡伟长,张积森.  热带作物学报. 2016(01)
[3]水稻蔗糖转运蛋白研究进展[J]. 孙学武,谭炎宁,孙志忠,袁定阳,段美娟.  生命科学研究. 2014(02)
[4]拟南芥蔗糖转运蛋白（SUTs）的功能研究进展[J]. 高蕾,肖文芳,李文燕,彭昌操.  分子植物育种. 2011(02)



本文编号：3179577