水稻YEATS结构域包含基因OsYAF9的克隆及材料创制
发布时间：2021-05-20 02:03
抽穗期作为重要的农艺性状,是水稻适应季节、气温变化,保证产量的关键。水稻抽穗期同时受遗传和环境的影响。目前,拟南芥作为长日照模式植物,对其开花时间的调控机制研究已经非常深入。但是,水稻作为短日照模式植物,深入的抽穗期分子调控机制还有待进一步发掘。已有研究表明,YEATS结构域在进化上保守,在超过100个不同的真核蛋白中被发现,参与转录与染色质修饰。在酵母中,Yaf9,Taf14和Sas5组成YEATS结构域蛋白家族,其中Yaf9是组蛋白H4乙酰转移酶复合体NuA4和染色质重塑复合体SWR1的共同亚基,介导NuA4和SWR1复合物的聚合和分离,从而影响其功能。YEATS结构域是Yaf9行使功能所必须的,酵母菌缺失Yaf9时,对DNA损伤、冷害等较敏感。酵母Yaf9蛋白在拟南芥中有两个同源物YAF9a和YAF9b（TAF14）,其功能结构域YEATS在酵母,水稻,苜蓿,人和果蝇中的序列保守。研究发现,YAF9a和YAF9b功能冗余,双重突变体表现出包括早花在内的多种表型缺陷。其中YAF9a通过影响FLC组蛋白H4乙酰化水平控制开花时间。但是,水稻中YEATS结构域包含基因的功能至今未见报道...
【文章来源】：沈阳农业大学辽宁省
【文章页数】：52 页
【学位级别】：硕士
【文章目录】：
摘要
ABSTRACT
第一章 文献综述
1.1 表观遗传学的概述
1.2 染色质重塑的研究进展
1.2.1 染色质重塑的分子机制
1.2.2 染色质重塑复合体
1.2.3 染色质重塑复合体在植物体中的功能
1.3 组蛋白乙酰化修饰的研究进展
1.3.1 组蛋白乙酰化对基因转录的调控作用
1.3.2 植物中的组蛋白乙酰化转移酶基因与乙酰化作用位点
1.3.3 植物中的组蛋白去乙酰化的作用机制
1.4 水稻抽穗期的调控机理
1.5 YEATS结构域在真核生物中的功能分析
1.6 研究的目的和意义
第二章 材料与方法
2.1 试验材料
2.1.1 植物材料及生长条件
2.1.2 试验中用到的菌种
2.1.3 试验中用到的载体
2.1.4 试验中所用到的试剂
2.1.5 试验中所用到的仪器
2.2 试验方法
2.2.1 OsYAF9 基因序列的获取
2.2.2 OsYAF9 基因的进化分析
2.2.3 YEATS结构域序列保守性及蛋白结构预测
2.2.4 OsYAF9 基因的克隆及载体构建
2.2.5 农杆菌介导的水稻遗传转化
2.2.6 水稻材料T1 代阳性植株检测
2.2.7 瞬时转化水稻原生质体并观察
2.2.8 转基因植株编辑位点的检测
2.2.9 不同组织器官中的表达模式分析
第三章 结果与分析
3.1 水稻YEATS结构域包含基因OsYAF9 的生物信息学分析
3.1.1 OsYAF9 基因的进化分析
3.1.2 Os YAF9 与其他真核生物中YAF9 的序列保守性分析
3.1.3 OsYAF9与YAF9a、YAF9b三级结构预测
3.2 水稻YEATS结构域包含基因OSYAF9 的载体构建和遗传转化
3.2.1 片段的PCR扩增
3.2.2 连接载体并鉴定
3.2.3 水稻的遗传转化
3.2.4 水稻遗传转化材料的阳性率检测
3.2.5 基因编辑位点检测
3.3 水稻中OSYAF9 基因的功能分析
3.3.1 水稻中OsYAF9 基因的表达模式分析
3.3.2 水稻中OsYAF9 基因的亚细胞定位
第四章 结论与讨论
4.1 全文结论
4.2 讨论
4.2.1 OsYAF9 基因的保守性分析
4.2.2 OsYAF9 基因的功能研究
参考文献
附录
致谢
【参考文献】：
博士论文
[1]INO80染色质重塑复合物通过从p21启动子移除H2A.Z来激活doxorubicin诱导的p21表达[D]. 丁健.吉林大学 2018
[2]水稻OsTIPs的功能及其分子机理研究[D]. 杨贤莉.沈阳农业大学 2017
[3]水稻OsFBHs的功能及其分子机理研究[D]. 闫志强.沈阳农业大学 2017
[4]水稻染色质重塑复合体SWR1的功能研究[D]. 崔志波.沈阳农业大学 2015
[5]基因表达调控相关蛋白的结构和功能的研究[D]. 张稳.中国科学技术大学 2011
[6]组蛋白乙酰化对水稻花期、基因表达以及杂种优势的表观调控机制[D]. 李晨.华中农业大学 2011
硕士论文
[1]水稻组蛋白去乙酰化酶OsHDA706和OsHDA714的功能研究[D]. 刘源.华中农业大学 2018
本文编号：3196863
【文章来源】：沈阳农业大学辽宁省
【文章页数】：52 页
【学位级别】：硕士
【文章目录】：
摘要
ABSTRACT
第一章 文献综述
1.1 表观遗传学的概述
1.2 染色质重塑的研究进展
1.2.1 染色质重塑的分子机制
1.2.2 染色质重塑复合体
1.2.3 染色质重塑复合体在植物体中的功能
1.3 组蛋白乙酰化修饰的研究进展
1.3.1 组蛋白乙酰化对基因转录的调控作用
1.3.2 植物中的组蛋白乙酰化转移酶基因与乙酰化作用位点
1.3.3 植物中的组蛋白去乙酰化的作用机制
1.4 水稻抽穗期的调控机理
1.5 YEATS结构域在真核生物中的功能分析
1.6 研究的目的和意义
第二章 材料与方法
2.1 试验材料
2.1.1 植物材料及生长条件
2.1.2 试验中用到的菌种
2.1.3 试验中用到的载体
2.1.4 试验中所用到的试剂
2.1.5 试验中所用到的仪器
2.2 试验方法
2.2.1 OsYAF9 基因序列的获取
2.2.2 OsYAF9 基因的进化分析
2.2.3 YEATS结构域序列保守性及蛋白结构预测
2.2.4 OsYAF9 基因的克隆及载体构建
2.2.5 农杆菌介导的水稻遗传转化
2.2.6 水稻材料T1 代阳性植株检测
2.2.7 瞬时转化水稻原生质体并观察
2.2.8 转基因植株编辑位点的检测
2.2.9 不同组织器官中的表达模式分析
第三章 结果与分析
3.1 水稻YEATS结构域包含基因OsYAF9 的生物信息学分析
3.1.1 OsYAF9 基因的进化分析
3.1.2 Os YAF9 与其他真核生物中YAF9 的序列保守性分析
3.1.3 OsYAF9与YAF9a、YAF9b三级结构预测
3.2 水稻YEATS结构域包含基因OSYAF9 的载体构建和遗传转化
3.2.1 片段的PCR扩增
3.2.2 连接载体并鉴定
3.2.3 水稻的遗传转化
3.2.4 水稻遗传转化材料的阳性率检测
3.2.5 基因编辑位点检测
3.3 水稻中OSYAF9 基因的功能分析
3.3.1 水稻中OsYAF9 基因的表达模式分析
3.3.2 水稻中OsYAF9 基因的亚细胞定位
第四章 结论与讨论
4.1 全文结论
4.2 讨论
4.2.1 OsYAF9 基因的保守性分析
4.2.2 OsYAF9 基因的功能研究
参考文献
附录
致谢
【参考文献】：
博士论文
[1]INO80染色质重塑复合物通过从p21启动子移除H2A.Z来激活doxorubicin诱导的p21表达[D]. 丁健.吉林大学 2018
[2]水稻OsTIPs的功能及其分子机理研究[D]. 杨贤莉.沈阳农业大学 2017
[3]水稻OsFBHs的功能及其分子机理研究[D]. 闫志强.沈阳农业大学 2017
[4]水稻染色质重塑复合体SWR1的功能研究[D]. 崔志波.沈阳农业大学 2015
[5]基因表达调控相关蛋白的结构和功能的研究[D]. 张稳.中国科学技术大学 2011
[6]组蛋白乙酰化对水稻花期、基因表达以及杂种优势的表观调控机制[D]. 李晨.华中农业大学 2011
硕士论文
[1]水稻组蛋白去乙酰化酶OsHDA706和OsHDA714的功能研究[D]. 刘源.华中农业大学 2018
本文编号：3196863
本文链接：https://www.wllwen.com/kejilunwen/jiyingongcheng/3196863.html
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