基于BSA-seq法的油菜野芥胞质雄性不育恢复基因的分析

发布时间：2021-05-22 23:26

　　细胞质雄性不育是利用杂种优势创制油菜杂交种的重要途径之一。而恢复系的选育及恢复基因的研究有利于提高细胞质雄性不育系的应用价值。该研究以甘蓝型油菜细胞质雄性不育系1193A和恢复系15-R1为亲本,以F₂群体构建了2个极端性状混池,采用BSA-seq技术方法,对恢复基因进行定位分析。结果表明:（1）不育系1193A与恢复系15-R1之间共获得非同义突变的SNPs共33 883个,混池间共有7 996个非同义编码突变。（2）InDel检测与注释结果表明,亲本间引起移码突变的有2 918个,混池间引起移码突变的有840个。（3）综合SNP和InDel的关联分析结果,将恢复基因定位于C09染色体上的0～880000区域,总长度为880 kb。（4）对候选区域的SNP和InDel注释发现,亲本间存在非同义突变的SNP共40个,混池间存在非同义突变的SNP共65个,亲本间存在移码突变的InDel共7个,混池间存在移码突变的InDel共11个;对候选区间内的编码基因进行注释,结果共注释到162个基因,其中存在非同义突变基因11个,移码突变基因5个,这些基因可能与育性恢复有关。 

【文章来源】：西北植物学报. 2020,40(07)北大核心CSCD

【文章页数】：9 页

【文章目录】：
1 材料和方法
    1.1 材料来源
    1.2 极端混合池构建与测序
    1.3 关联分析
    1.4 候选区域的功能注释
2 结果与分析
    2.1 F2群体育性分离情况
    2.2 测序数据分析
    2.3 关联分析与候选区域的筛选
        2.3.1 SNP关联分析
        2.3.2 InDel关联分析
        2.3.3 候选区域的筛选
    2.4 候选区域基因注释与分析
3 讨 论


【参考文献】：
期刊论文
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[2]利用重测序–BSA分析鉴定金柑油胞发育相关基因[J]. 刘梦雨,刘小丰,江东,朱世平,申晚霞,余歆,薛杨,赵晓春.  园艺学报. 2019(05)
[3]基于极端混合池（BSA）全基因组重测序的甘蓝型油菜有限花序基因定位[J]. 张尧锋,张冬青,余华胜,林宝刚,华水金,丁厚栋,傅鹰.  中国农业科学. 2018(16)
[4]甘蓝型油菜细胞质雄性不育系1193A的选育及分析[J]. 尹明智,官春云.  西南农业学报. 2017(09)
[5]油菜Nsa CMS候选恢复基因的来源及表达[J]. 张洪,付丽,李云昌,刘佳,梅德圣,彭鹏飞,陈玉峰,胡琼.  作物学报. 2012(07)
[6]油菜野芥细胞质雄性不育恢复基因候选片段的克隆[J]. 郝建轶,李云昌,胡琼,梅德圣,李英德,徐育松.  中国油料作物学报. 2011(05)
[7]甘蓝型油菜NCa胞质不育系的不育胞质类型鉴定[J]. 危文亮,王汉中,刘贵华.  中国油料作物学报. 2005(04)
[8]属间体细胞杂交创建甘蓝型油菜细胞质雄性不育系及其鉴定[J]. 胡琼,李云昌,梅德圣,方小平,Lise N. Hansen,Sven B. Andersen.  中国农业科学. 2004(03)



本文编号：3201843