白斑综合征病毒wsv-pol和wsv006的变异分析及与宿主互作基因的筛选
发布时间：2021-05-31 13:29
白斑综合征病毒（White Spot Syndrome Virus,WSSV）作为对虾养殖中存在的代表性病原之一,一直受到全球对虾养殖产业的广泛关注,但其致病分子机制却未明确。本文以2016-2017年从我国部分地区的对虾养殖病害区采集到的患病对虾为样本,以WSSV DNA聚合酶基因—wsv-pol和wsv006基因为研究对象,从其变异情况以及与宿主互作基因的筛选两个方面进行研究。主要研究结果如下:第一部分:为研究wsv-pol、wsv006基因的变异情况,本研究通过特异性扩增wsv-pol功能区以及wsv006全长核苷酸序列,比较核苷酸及氨基酸的变化情况,分析WSSV在不同地区的分子流行病学变异特征。本实验取用2016和2017年1-7月在全国18个地区的WSSV病害爆发区采集的91份患病样本,用特异性引物扩增目的片段,继而连接转化后进行测序,并对测序结果进行分析。wsv-pol扩增结果显示,2016年的47份样本中,只在山东日照、河北沧州和河北唐山三个地区的样本中出现目的条带,检出率为17%;在2017年的44份样本中,只在福建霞美镇、广东湛江、山东东营和上海四个地区的样本中检测出...
【文章来源】：上海海洋大学上海市
【文章页数】：90 页
【学位级别】：硕士
【部分图文】：
wsv-pol在2017年样本中的扩增结果
图 2-2 wsv-pol 在 2017 年样本中的扩增结果。M：DNA 分子标准量；1-44：2017 年样本；+：阳性对照；－：阴图 2-1 wsv-pol 在 2016 年样本中的扩增结果。M：DNA 分子标准量；1-47：2016 年样本；+：阳性对照；－：阴gure 2-1 Amplification result of wsv-pol target fragment from samples ie: M: DNAMaker ; 1-47: samples in 2016;+:positive control;－:negativ
图 2-3 wsv006 在 2016 年样本中的扩增结果。：M：DNA 分子标准量；1-47：2016 年样本；+：阳性对照；－：阴性对照Figure 2-3 Amplification result of wsv006 target fragment from samples in 2016.ote: M: DNAMaker ; 1-47: samples in 2016;+:positive control;－:negative contr
【参考文献】：
期刊论文
[1]拟南芥CARK4与RCAR12相互作用的研究[J]. 陈静波,李小意,李晶祥,黄琪,李旭锋,杨毅. 四川大学学报(自然科学版). 2018(02)
[2]酵母双杂交技术在病原生物蛋白质研究中的应用[J]. 刘绍伟,王洋,田喜凤. 中国病原生物学杂志. 2018(02)
[3]线粒体:能量、信号、功能的调控枢纽[J]. 郑铭. 生理科学进展. 2018(01)
[4]应用酵母双杂交系统筛选LKB1相互作用蛋白[J]. 徐卿,李洪涛,林峰,姚阳. 安徽医科大学学报. 2018(02)
[5]杆状病毒经口感染因子之间相互作用分析[J]. 郑秦,范颖,王海萍,许伟凡,孔祥硕,吴小锋. 病毒学报. 2018(01)
[6]丹参均一化酵母双杂交文库的构建及与SmJAZ8互作蛋白的筛选[J]. 杨梦丹,赵英,麻鹏达. 中国中药杂志. 2018(03)
[7]线粒体遗传系统与线粒体疾病概述[J]. 范艳艳,吴姣榕,肖义军. 生物学教学. 2018(01)
[8]应用同源重组技术快速构建乙型流感M蛋白通用疫苗的表达载体[J]. 高承刚,杨伟,李卫东,伍胤杰,郑俊杰,李开伟,钏鸿云,赵卫中,郑勇,史小军,廖国阳. 西部医学. 2017(08)
[9]氨氮胁迫下白斑综合征病毒对凡纳滨对虾的致病性[J]. 方金龙,王元,房文红,李新苍,陈甜甜,周俊芳. 南方水产科学. 2017(04)
[10]对虾养殖现状、发展趋势与对策的思考[J]. 李海波. 旅游纵览(下半月). 2017(01)
博士论文
[1]利用酵母双杂交解析WSSV感染凡纳滨对虾途径的研究[D]. 谢世筠.中国科学院研究生院(海洋研究所) 2016
[2]中国对虾（Fenneropenaeus chinensis）抗白斑综合征病毒（WSSV）候选基因分析[D]. 李旭鹏.中国海洋大学 2014
[3]对虾白斑综合症病毒性质和蛋白激酶wsv083的研究[D]. 秦崇涛.福建农林大学 2012
[4]同源重组技术在酿酒酵母表达载体构建中的应用[D]. 陈向岭.复旦大学 2005
硕士论文
[1]日本对虾类甲壳肽（crustin-like）基因在溶藻弧菌和白斑综合征病毒感染过程中的作用机制研究[D]. 孙保贞.浙江农林大学 2017
[2]COP9信号亚基5在日本囊对虾中的抗病毒功能研究[D]. 张强.山东大学 2017
[3]对虾白斑综合征病毒（WSSV）三个基因的变异、克隆表达及其在WSSV感染中的作用[D]. 秦梦雪.上海海洋大学 2017
[4]WSSV流行变异比较及不同毒株致病差异分析[D]. 孙新颖.上海海洋大学 2016
[5]HD-3复方中草药对凡纳滨对虾免疫酶影响和抗WSSV感染分析[D]. 景亚运.大连海洋大学 2016
[6]基于细胞培养筛选抗对虾白斑综合征病毒（WSSV）中草药及其实验效果评价[D]. 国子娟.上海海洋大学 2014
[7]乳链菌肿瘤特异性标记系统及跨界thyA同源重组载体的构建[D]. 陈雅莹.广州医科大学 2014
[8]利用酵母双杂交系统筛选家蚕BR-C转录因子的相互作用蛋白[D]. 王永虎.西南大学 2013
[9]齐墩果酸衍生物的合成与表征及其抑菌活性的研究[D]. 贺兴隆.辽宁师范大学 2011
本文编号：3208353
【文章来源】：上海海洋大学上海市
【文章页数】：90 页
【学位级别】：硕士
【部分图文】：
wsv-pol在2017年样本中的扩增结果
图 2-2 wsv-pol 在 2017 年样本中的扩增结果。M：DNA 分子标准量；1-44：2017 年样本；+：阳性对照；－：阴图 2-1 wsv-pol 在 2016 年样本中的扩增结果。M：DNA 分子标准量；1-47：2016 年样本；+：阳性对照；－：阴gure 2-1 Amplification result of wsv-pol target fragment from samples ie: M: DNAMaker ; 1-47: samples in 2016;+:positive control;－:negativ
图 2-3 wsv006 在 2016 年样本中的扩增结果。：M：DNA 分子标准量；1-47：2016 年样本；+：阳性对照；－：阴性对照Figure 2-3 Amplification result of wsv006 target fragment from samples in 2016.ote: M: DNAMaker ; 1-47: samples in 2016;+:positive control;－:negative contr
【参考文献】：
期刊论文
[1]拟南芥CARK4与RCAR12相互作用的研究[J]. 陈静波,李小意,李晶祥,黄琪,李旭锋,杨毅. 四川大学学报(自然科学版). 2018(02)
[2]酵母双杂交技术在病原生物蛋白质研究中的应用[J]. 刘绍伟,王洋,田喜凤. 中国病原生物学杂志. 2018(02)
[3]线粒体:能量、信号、功能的调控枢纽[J]. 郑铭. 生理科学进展. 2018(01)
[4]应用酵母双杂交系统筛选LKB1相互作用蛋白[J]. 徐卿,李洪涛,林峰,姚阳. 安徽医科大学学报. 2018(02)
[5]杆状病毒经口感染因子之间相互作用分析[J]. 郑秦,范颖,王海萍,许伟凡,孔祥硕,吴小锋. 病毒学报. 2018(01)
[6]丹参均一化酵母双杂交文库的构建及与SmJAZ8互作蛋白的筛选[J]. 杨梦丹,赵英,麻鹏达. 中国中药杂志. 2018(03)
[7]线粒体遗传系统与线粒体疾病概述[J]. 范艳艳,吴姣榕,肖义军. 生物学教学. 2018(01)
[8]应用同源重组技术快速构建乙型流感M蛋白通用疫苗的表达载体[J]. 高承刚,杨伟,李卫东,伍胤杰,郑俊杰,李开伟,钏鸿云,赵卫中,郑勇,史小军,廖国阳. 西部医学. 2017(08)
[9]氨氮胁迫下白斑综合征病毒对凡纳滨对虾的致病性[J]. 方金龙,王元,房文红,李新苍,陈甜甜,周俊芳. 南方水产科学. 2017(04)
[10]对虾养殖现状、发展趋势与对策的思考[J]. 李海波. 旅游纵览(下半月). 2017(01)
博士论文
[1]利用酵母双杂交解析WSSV感染凡纳滨对虾途径的研究[D]. 谢世筠.中国科学院研究生院(海洋研究所) 2016
[2]中国对虾（Fenneropenaeus chinensis）抗白斑综合征病毒（WSSV）候选基因分析[D]. 李旭鹏.中国海洋大学 2014
[3]对虾白斑综合症病毒性质和蛋白激酶wsv083的研究[D]. 秦崇涛.福建农林大学 2012
[4]同源重组技术在酿酒酵母表达载体构建中的应用[D]. 陈向岭.复旦大学 2005
硕士论文
[1]日本对虾类甲壳肽（crustin-like）基因在溶藻弧菌和白斑综合征病毒感染过程中的作用机制研究[D]. 孙保贞.浙江农林大学 2017
[2]COP9信号亚基5在日本囊对虾中的抗病毒功能研究[D]. 张强.山东大学 2017
[3]对虾白斑综合征病毒（WSSV）三个基因的变异、克隆表达及其在WSSV感染中的作用[D]. 秦梦雪.上海海洋大学 2017
[4]WSSV流行变异比较及不同毒株致病差异分析[D]. 孙新颖.上海海洋大学 2016
[5]HD-3复方中草药对凡纳滨对虾免疫酶影响和抗WSSV感染分析[D]. 景亚运.大连海洋大学 2016
[6]基于细胞培养筛选抗对虾白斑综合征病毒（WSSV）中草药及其实验效果评价[D]. 国子娟.上海海洋大学 2014
[7]乳链菌肿瘤特异性标记系统及跨界thyA同源重组载体的构建[D]. 陈雅莹.广州医科大学 2014
[8]利用酵母双杂交系统筛选家蚕BR-C转录因子的相互作用蛋白[D]. 王永虎.西南大学 2013
[9]齐墩果酸衍生物的合成与表征及其抑菌活性的研究[D]. 贺兴隆.辽宁师范大学 2011
本文编号：3208353
本文链接：https://www.wllwen.com/kejilunwen/jiyingongcheng/3208353.html
最近更新
教材专著
