中国汉族人群酒精性肝病候选基因单核苷酸多态性的关联分析研究
发布时间:2021-06-08 04:42
目的:酒精性肝病(Alcoholic Liver Disease,ALD)是一种由大量饮酒引起的慢性肝病,遗传机制在其发病中起重要作用。近期新英格兰杂志中发现HSD17B13rs72613567等位基因减轻了由PNPLA3 P.I148M变异体遗传易感性对肝损伤造成的风险,由于ALD患者种族之间的差异性,有必要在中国汉族人群验证,本研究的目的是探讨基因多态性候选基因HSD17B13、ALDH2以及OAS1的单核苷酸多态性(Single-Nucleotide Polymorphisms,SNP)与中国汉族人群ALD患者的遗传易感性。方法:本研究为多中心大样本研究,共有769例ALD患者和767例健康对照参与其中,采用基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱(Matrix-Assisted Laser Desor ption/Ionization Time of Flight Mass Spectrometry,MALDI-TOF MS)方法对以下基因的5个SNP位点进行基因分型:HSD17B13(rs72613567、rs117111943、rs6834314),ALDH2 rs671,OAS1...
【文章来源】:吉林大学吉林省 211工程院校 985工程院校 教育部直属院校
【文章页数】:51 页
【学位级别】:硕士
【文章目录】:
中文摘要
abstract
英文缩略词
第1章 绪论
第2章 文献综述
2.1 酒精性肝病的流行病学
2.2 酒精性肝病发生的影响因素
2.3 脂质代谢候选基因
2.3.1 HSD17B
2.3.2 PNPLA
2.4 酒精代谢候选基因
2.4.1 ALDH2
2.4.2 CYP2E
2.4.3 OAS1
2.5 总结和展望
第3章 材料与方法
3.1 研究对象
3.2 实验材料
3.2.1 主要实验仪器
3.2.2 主要试剂
3.3 主要分析软件和电子数据库
3.4 实验方法
3.4.1 DNA样本收集与保存
3.4.2 基因组DNA提取
3.4.3 DNA样本质量检测
3.4.4 采用NanodroP2000 超微量分光光度计检测DNA
3.5 SNP位点的选择
3.6 Sequenom MassARRAY基因分型
3.6.1 MALDI-TOFMS实验原理
3.6.2 引物设计与合成
3.6.3 扩增引物的稀释和UEP引物质量检测
3.6.4 DNA样品准备
3.6.5 PCR反应
3.6.6 PCR产物SAP处理
3.6.7 单碱基延伸反应
3.6.8 树脂纯化
3.6.9 芯片点样
3.6.10 MADI-TOF MS质谱检测与结果分析
3.7 统计分析
第4章 实验结果
4.1 疾病组和对照组的基本资料
4.2 Hardy-Weinberg遗传平衡检验结果
4.3 各个SNP位点的等位基因和基因型频率
4.4 在三种遗传模型下对各个基因SNP位点的分析
第5章 讨论
第6章 结论
参考文献
作者简介及在学期间所取得的科研成果
致谢
【参考文献】:
期刊论文
[1]宁夏回、汉族人群乙醇代谢关键酶ALDH2基因多态性[J]. 安建芳,万艳,万春梅,詹福寿. 基础医学与临床. 2019(02)
[2]江苏、山西、湖南三省份汉族人群ALDH2基因多态性分布研究[J]. 谢钰珍,覃鸿妮,梅啸,吴凡,张宇. 甘肃科技纵横. 2018(10)
[3]CYP2E1调控酒精性肝病发病机制的研究进展[J]. 陈丹,林秀贤,陈尧. 中国临床药理学与治疗学. 2017(02)
[4]武汉地区536名体检人群ALDH2的基因多态性分布[J]. 姜树朋,李艳,童永清. 海南医学. 2016(23)
[5]乙醛脱氢酶-2基因及其rs671多态性与相关疾病[J]. 姜树朋,李艳. 微循环学杂志. 2016(03)
[6]Non-invasive assessment of liver fibrosis in patients with alcoholic liver disease[J]. Rosa Lombardi,Elena Buzzetti,Davide Roccarina,Emmanuel A Tsochatzis. World Journal of Gastroenterology. 2015(39)
[7]CYP2E1在酒精性肝病中的作用[J]. 韩露,陈真. 安徽医药. 2014(06)
[8]血清肿瘤标记物联合检测对原发性肝癌患者诊断价值[J]. 王梅,唐静悦,毛立新,赵玮. 河北中医. 2013(09)
[9]酒精性肝病诊疗指南[J]. 厉有名,范建高,王炳元,陆伦根,施军平,牛俊奇,沈薇,徐有青,曾民德,贾继东,袁平戈. 临床肝胆病杂志. 2010(03)
[10]汉族人群酒精性肝病ALDH2和CYP2E1基因多态性研究[J]. 冷爱民,王德强,袁伟建. 重庆医科大学学报. 2008(09)
硕士论文
[1]酒精性肝病遗传易感性与CYP2E1基因多态性研究[D]. 郭艳梅.兰州大学 2007
本文编号:3217719
【文章来源】:吉林大学吉林省 211工程院校 985工程院校 教育部直属院校
【文章页数】:51 页
【学位级别】:硕士
【文章目录】:
中文摘要
abstract
英文缩略词
第1章 绪论
第2章 文献综述
2.1 酒精性肝病的流行病学
2.2 酒精性肝病发生的影响因素
2.3 脂质代谢候选基因
2.3.1 HSD17B
2.3.2 PNPLA
2.4 酒精代谢候选基因
2.4.1 ALDH2
2.4.2 CYP2E
2.4.3 OAS1
2.5 总结和展望
第3章 材料与方法
3.1 研究对象
3.2 实验材料
3.2.1 主要实验仪器
3.2.2 主要试剂
3.3 主要分析软件和电子数据库
3.4 实验方法
3.4.1 DNA样本收集与保存
3.4.2 基因组DNA提取
3.4.3 DNA样本质量检测
3.4.4 采用NanodroP2000 超微量分光光度计检测DNA
3.5 SNP位点的选择
3.6 Sequenom MassARRAY基因分型
3.6.1 MALDI-TOFMS实验原理
3.6.2 引物设计与合成
3.6.3 扩增引物的稀释和UEP引物质量检测
3.6.4 DNA样品准备
3.6.5 PCR反应
3.6.6 PCR产物SAP处理
3.6.7 单碱基延伸反应
3.6.8 树脂纯化
3.6.9 芯片点样
3.6.10 MADI-TOF MS质谱检测与结果分析
3.7 统计分析
第4章 实验结果
4.1 疾病组和对照组的基本资料
4.2 Hardy-Weinberg遗传平衡检验结果
4.3 各个SNP位点的等位基因和基因型频率
4.4 在三种遗传模型下对各个基因SNP位点的分析
第5章 讨论
第6章 结论
参考文献
作者简介及在学期间所取得的科研成果
致谢
【参考文献】:
期刊论文
[1]宁夏回、汉族人群乙醇代谢关键酶ALDH2基因多态性[J]. 安建芳,万艳,万春梅,詹福寿. 基础医学与临床. 2019(02)
[2]江苏、山西、湖南三省份汉族人群ALDH2基因多态性分布研究[J]. 谢钰珍,覃鸿妮,梅啸,吴凡,张宇. 甘肃科技纵横. 2018(10)
[3]CYP2E1调控酒精性肝病发病机制的研究进展[J]. 陈丹,林秀贤,陈尧. 中国临床药理学与治疗学. 2017(02)
[4]武汉地区536名体检人群ALDH2的基因多态性分布[J]. 姜树朋,李艳,童永清. 海南医学. 2016(23)
[5]乙醛脱氢酶-2基因及其rs671多态性与相关疾病[J]. 姜树朋,李艳. 微循环学杂志. 2016(03)
[6]Non-invasive assessment of liver fibrosis in patients with alcoholic liver disease[J]. Rosa Lombardi,Elena Buzzetti,Davide Roccarina,Emmanuel A Tsochatzis. World Journal of Gastroenterology. 2015(39)
[7]CYP2E1在酒精性肝病中的作用[J]. 韩露,陈真. 安徽医药. 2014(06)
[8]血清肿瘤标记物联合检测对原发性肝癌患者诊断价值[J]. 王梅,唐静悦,毛立新,赵玮. 河北中医. 2013(09)
[9]酒精性肝病诊疗指南[J]. 厉有名,范建高,王炳元,陆伦根,施军平,牛俊奇,沈薇,徐有青,曾民德,贾继东,袁平戈. 临床肝胆病杂志. 2010(03)
[10]汉族人群酒精性肝病ALDH2和CYP2E1基因多态性研究[J]. 冷爱民,王德强,袁伟建. 重庆医科大学学报. 2008(09)
硕士论文
[1]酒精性肝病遗传易感性与CYP2E1基因多态性研究[D]. 郭艳梅.兰州大学 2007
本文编号:3217719
本文链接:https://www.wllwen.com/kejilunwen/jiyingongcheng/3217719.html
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