甘薯苯丙氨酸解氨酶基因IbPAL的克隆与表达分析

发布时间：2021-06-08 06:42

　　本研究基于甘薯（Ipomoea batatas（L.） Lam.）与绿原酸合成代谢相关的转录组数据克隆了苯丙氨酸解氨酶基因Ib PAL,通过蛋白序列比对、系统进化分析、二级和三维蛋白结构预测、跨膜结构域以及启动子分析,对该基因的氨基酸序列和启动子序列的结构特征进行了解析;通过qRT-PCR技术分析该基因在不同甘薯品种的根、茎、茎尖和叶中的表达情况,并对其进行亚细胞定位验证。结果显示,Ib PAL的CDS序列全长2130 bp,编码709个氨基酸。其氨基酸序列与已知物种的氨基酸序列同源性在80%以上。Ib PAL蛋白以α螺旋和随机卷曲为主,具有1个可能的跨膜螺旋区。该基因启动子中包含多个顺式作用元件。表达模式分析结果表明,Ib PAL主要在茎和茎尖中表达,其在甘薯品种‘EC16’4个组织器官中的表达量均显著高于其他品种。亚细胞定位结果显示该基因在细胞膜和细胞核上均可以表达。 

【文章来源】：植物科学学报. 2020,38(03)北大核心CSCD

【文章页数】：9 页

【部分图文】：

甘薯Ib PAL基因的克隆

本研究分别提取甘薯品种‘EC15’、‘EC16’、‘福菜薯18’和‘福薯7-6’的根、茎、茎尖和叶进行qRT-PCR分析。结果表明(图6)，在根和茎中，‘EC16’的IbPAL基因表达量极显著高于其他品种，‘EC15’与‘福菜薯18’、‘福薯7-6’之间没有显著差异;在茎尖中，‘EC16’极显著高于其他品种，‘福薯7-6’极显著低于其他品种;在叶中，4个品种之间均存在极显著差异。‘EC16’的4个组织器官中，IbPAL基因的表达量均显著高于其他品种。图4 Ib PAL蛋白的三级结构

Ib PAL蛋白的三级结构

【参考文献】：
期刊论文
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硕士论文
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本文编号：3217881