小黑杨与Alternaria alternata互作后基因表达模式分析
发布时间:2021-06-10 18:18
杨树叶枯病是由链格孢菌引起的叶部病害,本研究以杨树及叶枯病病原菌为研究对象,鉴定了叶枯病病原菌及其分子特性,分析了病原菌应答H202胁迫的转录水平变化,也分析了杨树应答叶枯病菌胁迫转录水平变化,希望今后鉴定抗病基因和改良杨树抗病性奠定基础,具体结果如下:首先,对叶枯病病原菌进行分离纯化,得到纯菌种,进而确定适合菌落生长的条件和温度。根据植物细胞受到胁迫产生大量活性氧的原理,用H2O2溶液模拟活性氧条件处理病原菌,将实验组和对照组样品进行转录组测序。结果表明,在活性氧胁迫条件下,病原菌基因表达量发生明显变化,将差异表达基因与GO、COG、KOG和KEGG数据库比对,发现差异表达基因功能涉及多种过程,在代谢、运输、膜结构等方面富集到的基因数量较多。用叶枯病病原菌对杨树叶片进行胁迫处理48小时,利用RNA-seq技术检测基因差异表达情况,结果是表明杨树叶片在胁迫下基因表达发生明显变化,主要涉及代谢过程、氧化还原酶、膜结构、发病机制相关蛋白等方面,参与到光合作用等14条代谢通路中。共发现27个转录因子,涉及到WRKY、MYB、bZIP等家族。分别在胁迫0、4、8、12、24、48和72小时进行...
【文章来源】:东北林业大学黑龙江省 211工程院校 教育部直属院校
【文章页数】:56 页
【学位级别】:硕士
【部分图文】:
图2-2?18S序列PCR产物胶图??-
2病原菌鉴定和转录组分析??Query?Cover和Per.?Ident均为100%,E?value值为0,从而确定本实验所用菌种为??Altemaria?aUernata?2-4)〇??Alternariaalternata属半知菌纲,链孢霉目,黑霉科真菌,现与其他四种亲缘关系较??近的链格孢菌做系统发育分析,了解他们之间的亲缘关系。链格孢菌中,??能引起白菜黑斑病,Zeww/似/廳能引起苍术黑斑病,??c/W麵cw/ar/6?能引起花舟叶斑病,能引起轴枯褐腐玻如图2-5所示,从??系统进化树可看出,a/化与」/如m/r/flf?亲缘关系最近,与其他三??种真菌亲缘关系较远。??i|gp=:??looobpr?,??750b£?■"?5,界:??图2-2?18S序列PCR产物胶图??Fig.2-2?Gel?map?of?the?18S?sequence?PCR?product??1?gcctgcggag?ggatcattac?acaaatatga?aggcgggctg?gaacctctcg?gggttacagc??61?cttgctgaat?tattcaccct?tgtcttttgc?gtacttcttg?tttccttggt?gggttcgccc??121?accactagga?caaacataaa?ccttttgtaa?ttgcaatcag?cgtcagtaac?aaattaataa??181?ttacaacttt?caacaacgga?tctcttggtt?ctggcatcga?tgaagaacgc?agcgaaatgc??241?gataagtagt?gtgaattgca?gaattcagtg?aatcat
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【参考文献】:
期刊论文
[1]植物转录因子研究方法及应用[J]. 樊松乐,王纪坤,覃碧,王立丰. 分子植物育种. 2019(15)
[2]Bt蛋白对杨扇舟蛾连续世代存活与发育的影响[J]. 王留成,刘洁,高佳敏,孟丹阳,姚彤,孙天骅,高宝嘉. 西北农业学报. 2019(06)
[3]小黑杨基因组的初步组装及SSR信息分析[J]. 周玉敏,王遂,刘轶,李开隆,由香玲. 植物研究. 2019(01)
[4]深绿木霉对山新杨生长及抗叶枯病能力的影响[J]. 遇文婧,杨帅,刁桂萍. 东北林业大学学报. 2019(01)
[5]瞬时表达葡萄病毒A外壳蛋白基因对烟草中病毒转录的影响[J]. 王建辉,刘建军,陈克玲,李洪雯,何建,关斌,何礼,王东. 核农学报. 2018(09)
[6]杨树灰斑病的识别和防治方法[J]. 许晶,王东涛. 农民致富之友. 2018(03)
[7]茉莉酸信号通路中的转录因子对药用植物次生代谢调控的研究进展[J]. 姚娜,荆礼,郑汉,陈敏,申业. 中国中药杂志. 2018(05)
[8]转录因子研究方法进展[J]. 刘相莲,乔芳,黄德玉,袁宗辉,王旭. 生理科学进展. 2017(01)
[9]WRKY transcription factors in plant responses to stresses[J]. Jingjing Jiang,Shenghui Ma,Nenghui Ye,Ming Jiang,Jiashu Cao,Jianhua Zhang. Journal of Integrative Plant Biology. 2017(02)
[10]2种木霉菌对杨树叶枯病致病菌的抑菌活性研究[J]. 梁丹,沈威,刘璐,杨子健,先文娟,殷娇,熊静. 防护林科技. 2017(01)
博士论文
[1]柑橘褐斑病菌比较基因组和转录组分析及柑橘绿霉病菌产孢中心调控途径和高渗甘油途径的功能基因研究[D]. 王明爽.浙江大学 2016
硕士论文
[1]杨属五大派树种苗期形态与生理性状的遗传变异[D]. 栾鹖慧.中国林业科学研究院 2011
本文编号:3222885
【文章来源】:东北林业大学黑龙江省 211工程院校 教育部直属院校
【文章页数】:56 页
【学位级别】:硕士
【部分图文】:
图2-2?18S序列PCR产物胶图??-
2病原菌鉴定和转录组分析??Query?Cover和Per.?Ident均为100%,E?value值为0,从而确定本实验所用菌种为??Altemaria?aUernata?2-4)〇??Alternariaalternata属半知菌纲,链孢霉目,黑霉科真菌,现与其他四种亲缘关系较??近的链格孢菌做系统发育分析,了解他们之间的亲缘关系。链格孢菌中,??能引起白菜黑斑病,Zeww/似/廳能引起苍术黑斑病,??c/W麵cw/ar/6?能引起花舟叶斑病,能引起轴枯褐腐玻如图2-5所示,从??系统进化树可看出,a/化与」/如m/r/flf?亲缘关系最近,与其他三??种真菌亲缘关系较远。??i|gp=:??looobpr?,??750b£?■"?5,界:??图2-2?18S序列PCR产物胶图??Fig.2-2?Gel?map?of?the?18S?sequence?PCR?product??1?gcctgcggag?ggatcattac?acaaatatga?aggcgggctg?gaacctctcg?gggttacagc??61?cttgctgaat?tattcaccct?tgtcttttgc?gtacttcttg?tttccttggt?gggttcgccc??121?accactagga?caaacataaa?ccttttgtaa?ttgcaatcag?cgtcagtaac?aaattaataa??181?ttacaacttt?caacaacgga?tctcttggtt?ctggcatcga?tgaagaacgc?agcgaaatgc??241?gataagtagt?gtgaattgca?gaattcagtg?aatcat
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【参考文献】:
期刊论文
[1]植物转录因子研究方法及应用[J]. 樊松乐,王纪坤,覃碧,王立丰. 分子植物育种. 2019(15)
[2]Bt蛋白对杨扇舟蛾连续世代存活与发育的影响[J]. 王留成,刘洁,高佳敏,孟丹阳,姚彤,孙天骅,高宝嘉. 西北农业学报. 2019(06)
[3]小黑杨基因组的初步组装及SSR信息分析[J]. 周玉敏,王遂,刘轶,李开隆,由香玲. 植物研究. 2019(01)
[4]深绿木霉对山新杨生长及抗叶枯病能力的影响[J]. 遇文婧,杨帅,刁桂萍. 东北林业大学学报. 2019(01)
[5]瞬时表达葡萄病毒A外壳蛋白基因对烟草中病毒转录的影响[J]. 王建辉,刘建军,陈克玲,李洪雯,何建,关斌,何礼,王东. 核农学报. 2018(09)
[6]杨树灰斑病的识别和防治方法[J]. 许晶,王东涛. 农民致富之友. 2018(03)
[7]茉莉酸信号通路中的转录因子对药用植物次生代谢调控的研究进展[J]. 姚娜,荆礼,郑汉,陈敏,申业. 中国中药杂志. 2018(05)
[8]转录因子研究方法进展[J]. 刘相莲,乔芳,黄德玉,袁宗辉,王旭. 生理科学进展. 2017(01)
[9]WRKY transcription factors in plant responses to stresses[J]. Jingjing Jiang,Shenghui Ma,Nenghui Ye,Ming Jiang,Jiashu Cao,Jianhua Zhang. Journal of Integrative Plant Biology. 2017(02)
[10]2种木霉菌对杨树叶枯病致病菌的抑菌活性研究[J]. 梁丹,沈威,刘璐,杨子健,先文娟,殷娇,熊静. 防护林科技. 2017(01)
博士论文
[1]柑橘褐斑病菌比较基因组和转录组分析及柑橘绿霉病菌产孢中心调控途径和高渗甘油途径的功能基因研究[D]. 王明爽.浙江大学 2016
硕士论文
[1]杨属五大派树种苗期形态与生理性状的遗传变异[D]. 栾鹖慧.中国林业科学研究院 2011
本文编号:3222885
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