基于肿瘤数据库分析SOX基因家族在肝癌中的表达及预后意义

发布时间：2021-06-12 23:53

　　目的通过肿瘤数据库分析SOX基因家族在肝癌中的表达,及其对肝癌患者预后的影响。方法采用cBioPortal数据库检索分析SOX基因家族中12个基因在肝癌组织中的突变频率及变异情况;利用Ualcan数据库比较分析肝癌组织及癌旁组织中12个基因mRNA的表达;结合Kaplan-Meier plotter数据库的临床信息进一步分析SOX基因家族中12个基因在肝癌患者中潜在的预后价值。结果 SOX基因家族大多数成员扩增突变,SOX15为缺失突变。SOX4、SOX8、SOX11、SOX12、SOX15、SOX17、SOX18及SOX21基因在肝癌组织中mRNA表达均高于癌旁组织（P <0.05）,SOX1、SOX3、SOX14及SRY基因差异无统计学意义（P> 0.05）。SOX1、SOX3、SOX8、SOX14、SOX15、SOX17、SOX18、SOX21及SRY基因在肝癌患者中的表达均上调（HR <1,Logrank P <0.05）,利于患者预后;SOX4、SOX11及SOX12基因高表达与患者不良预后相关（HR> 1,Logrank P <0.05）... 

【文章来源】：中国生物制品学杂志. 2020,33(11)CSCD

【文章页数】：6 页

【部分图文】：

SOX家族基因在不同类型肝癌中的突变频率

SOX家族基因在肝癌中变异情况

SOX1及SOX3在1、2和3期肝癌组织中的表达均明显上调（HR<1,Logrank P<0.05），利于预后，与乙肝病毒感染和酒精摄取无关。SOX4在2和3期肝癌组织中的表达均明显下调（HR>1,Logrank P<0.05），不利于预后，而在1期非酒精性及非病毒性肝癌组织中的表达明显上调（HR<1,Logrank P<0.05），利于预后，SOX4与酒精性及病毒性肝癌患者预后相关性差异无统计学意义（Logrank P>0.05）。SOX8在1、2和3期乙肝病毒性、非病毒性及非酒精性肝癌组织中的表达均明显上调（HR<1,Logrank P<0.05），利于预后，而SOX8与酒精性肝癌患者预后差异无统计学意义（Logrank P>0.05）。SOX11在1和3期肝癌组织中的表达均明显下调（HR>1,Logrank P<0.05），与预后不良相关，与2期患者预后差异无统计学意义（Logrank P>0.05），与乙肝病毒感染及酒精摄取无关。SOX12在3期非乙肝病毒性、酒精性及非酒精性肝癌组织中的表达均明显下调（HR>1,Logrank P<0.05），与预后不良相关，而在1和2期病毒性肝癌患者预后差异无统计学意义（Logrank P>0.05）。SOX14及SRY在肝癌组织中的表达均明显上调（HR<1,Logrank P<0.05），利于预后，与乙肝病毒感染、酒精摄及肿瘤分期无关。SOX15在2和3期乙肝病毒性、非病毒性及非酒精性肝癌组织中的表达均明显上调（HR<1,Logrank P<0.05），利于预后，而与1期乙肝病毒性肝癌患者预后差异无统计学意义（Logrank P>0.05）。SOX18在1期乙肝病毒性、非病毒性及非酒精性肝癌组织中的表达均明显上调（HR<1,Logrank P<0.05），利于预后，而与1和3期乙肝病毒性及酒精性肝癌患者预后差异无统计学意义（Logrank P>0.05）。SOX21在非乙肝病毒性肝癌中的表达明显上调（HR<1,Logrank P<0.05），利于预后，与乙肝病毒性肝癌患者预后差异无统计学意义（Logrank P>0.05），与肿瘤分期及酒精摄取无关。见表1～3和图4。图4 肝癌患者SOX家族基因的OS分析


本文编号：3226554