棉属3-羟基-3-甲基戊二酰辅酶A还原酶（HMGR）基因家族的全基因组鉴定及比较分析

发布时间：2021-06-18 00:16

　　萜类化合物是广泛于存在自然界的一种天然产物,在植物的生长发育和对环境的适应性方面起着重要的作用。萜类化合物在植物中主要通过两种途径合成,细胞质中的MVA途径和质体中的MEP途径。MVA途径第一个重要的限速酶是3-羟基-3-甲基戊二酰辅酶A还原酶（HMGR）,在细胞质萜类化合物生物合成过程中起着关键作用。前人研究表明,HMGR基因在雷蒙德氏棉中发生了扩增,但是HMGR基因家族在棉属植物中的特征和进化还不明确。基于棉属中多个棉种已完成全基因组测序,本研究从全基因组水平对雷蒙德氏棉、亚洲棉和陆地棉HMGR基因家族进行鉴定和比较分析,为进一步解析棉属植物细胞质萜类化合物合成提供了有用的信息。主要结果如下:1、利用棉属的基因组数据,在雷蒙德氏棉、亚洲棉和陆地棉中分别鉴定出9、9和18个HMGR基因,同时也鉴定了棉属MVA途径中其它基因,结果表明只有HMGR基因发生了显著的扩增,且均存在一个包括四个紧密相邻基因的HMGR基因簇。2、对雷蒙德氏棉、亚洲棉和陆地棉中HMGR基因的系统发育关系、染色体定位、基因结构和蛋白保守结构域进行了分析。结果表明,在雷蒙德氏棉和亚洲棉的祖先种中发生了片段复制和串联复... 

【文章来源】：河南农业大学河南省

【文章页数】：62 页

【学位级别】：硕士

【部分图文】：

植物细胞中MVA途径和MEP途径的酶促反应[16]

在线预测工具分别对雷蒙德氏棉 HMGR 蛋白质（图 4.2）、亚洲棉 HMGR 蛋白质（图 4.3）和陆地棉 HMGR 蛋白质（图 4.4）进行预测。结果显示，N 端的两次跨膜结构域出现在具有完整开放阅读框的所有 34 个 HMGR 蛋白质中，推测与别的植物中一样，棉属 HMGR 基因在进行催化反应时，也需要通过两次跨膜运动将 HMGR 蛋白锚定在内质网膜上。

雷蒙德氏棉HMGR蛋白质的跨膜区预测


本文编号：3236190