赣南柑桔黄龙病菌16S rDNA、16S/23S rDNA间隔区和核糖体蛋白基因的遗传多样性

发布时间：2021-06-20 11:41

　　为探究赣南地区柑桔黄龙病菌的遗传多样性,从赣南16个县（市、区）采集32份具典型柑桔黄龙病症状的脐橙叶片样品,运用PCR-RFLP（聚合酶链式反应-限制性长度多态性分析）技术研究柑桔黄龙病菌16SrDNA序列、16S/23SrDNA间隔区序列和核糖体蛋白基因的多态性,并对3个基因片段进行测序,分析序列的碱基含量、碱基转换率与颠换率、相似性、核苷酸遗传距离和系统进化特征。结果表明,供试赣南柑桔黄龙病菌样品在3个基因片段上的RFLP指纹图谱均一致,未表现出多态性,且序列相似性均在98%¹00%;序列碱基中的GC含量以16SrDNA最大,序列碱基的转换率/颠换率以16SrDNA最小;赣南柑桔黄龙病菌样品与亚洲种Candidatus Liberibacter asiaticus之间的序列相似性最大、核苷酸遗传距离最小,在系统进化中归属亚洲种。 

【文章来源】：中国南方果树. 2017,46(02)北大核心

【文章页数】：5 页

【文章目录】：
1 材料与方法
    1.1 材料
        1.1.1 供试样品
        1.1.2 主要试剂
        1.1.3 引物
    1.2 方法
        1.2.1 样品总DNA的提取
        1.2.2 目的基因的PCR扩增
        1.2.3 目的基因的RFLP分析
        1.2.4 序列分析及构建系统发育树
2 结果与分析
    2.1 PCR扩增结果
    2.2 PCR产物的RFLP分析
    2.3 序列分析
        2.3.1 序列的碱基含量
        2.3.2 序列碱基的转换率与颠换率
        2.3.3 序列的相似性
        2.3.4 核苷酸的遗传距离
    2.4 系统进化分析
3 小结与讨论


【参考文献】：
期刊论文
[1]基于SSR标记的赣南柑桔黄龙病菌遗传多样性分析[J]. 卢占军,刘映雪,丁鹏,赵培娅,黄爱军,苏华楠,钟八莲.  中国南方果树. 2016(05)
[2]基于16S rDNA序列比对分析赣南脐橙上柑橘黄龙病病原的分子特征[J]. 易龙,卢占军,钟八莲,赖晓桦,陈慈相.  果树学报. 2011(06)
[3]柑橘黄龙病菌核糖体蛋白基因的多态性及系统发育分析[J]. 鹿连明,范国成,姚锦爱,胡秀荣,陈国庆.  浙江大学学报(农业与生命科学版). 2011(02)
[4]柑橘黄龙病菌亚洲种16S rDNA和16S-23S rDNA间隔区的PCR-RFLP及序列分析[J]. 鹿连明,姚锦爱,张利平,胡秀荣,黄振东,陈国庆.  中国农学通报. 2010(24)
[5]中国不同地区亚洲韧皮杆菌遗传多样性分析[J]. 王中康,周彬彬,田圣超,石小刚,贤家旭,陈世伟,殷幼平.  植物病理学报. 2009(06)
[6]中国柑橘黄龙病病原16S rDNA序列研究[J]. 丁芳,洪霓,钟云,易干军,王国平.  园艺学报. 2008(05)
[7]柑桔黄梢（黄龙）病研究 Ⅰ.病情调查[J]. 林孔湘.  植物病理学报. 1956(01)

博士论文
[1]中国柑橘黄龙病病原调查、种群遗传分化及其原噬菌体溶菌酶蛋白原核表达[D]. 苏华楠.西南大学 2013



本文编号：3239126