基于生物信息学分析筛选肾上腺皮质癌核心基因

发布时间：2021-06-24 04:37

　　目的通过生物信息学方法研究肾上腺皮质癌发生、恶化的核心基因,探索可能的预后评估、筛选诊断的分子生物学标志物,为肾上腺皮质癌潜在治疗靶点提供了生物信息学证据支持。方法从GEO数据库下载GSE14922、GSE19750和GSE90713芯片数据,利用一系列生物信息学方法对GSE14922芯片进行处理、分析并筛选差异基因。再通过CytoHuhha插件筛选出核心基因,最后分别利用在线分析工具GEPIA和GSE19750、GSE90713芯片数据对核心基因进行生存分析与诊断试验分析。结果从GSE14922芯片获得90个差异基因。通过CytoHuhha插件获得了6个核心基因分别为BUB1、CDK1、CENPF、NDC80、ASPM和DLGAP5。Kaplan-Meier生存曲线分析的结果表明上述核心基因对肾上腺皮质癌患者的诊断及生存预后具有显著影响。ROC分析的结果表明上述核心基因对肾上腺皮质癌患者具有较好的诊断意义。结论通过生物信息学分析获得6个核心基因在肾上腺皮质癌的发生、进展中发挥重要作用,并为揭示肾上腺皮质癌潜在的诊断、预后标志物和治疗靶点提供了新的理论依据。 

【文章来源】：医学研究杂志. 2020,49(09)

【文章页数】：5 页

【文章目录】：
材料与方法
    1.原始芯片数据来源:
    2.芯片数据预处理和差异基因筛选:
    3.蛋白质相互作用网络的构建与核心基因的筛选:
    4.核心基因的生存预后分析:
    5.核心基因的诊断价值评价:
结 果
    1.芯片数据预处理和差异基因筛选的结果:
    2.蛋白质相互作用网络的构建与核心基因的筛选:
    3.核心基因的生存预后分析:
    4.核心基因的诊断价值评价:
讨 论


【参考文献】：
期刊论文
[1]基于生物信息学分析胰腺癌的关键基因[J]. 黎越,林丹丹,何晓琴,徐细明.  医学研究杂志. 2019(10)
[2]基于高通量芯片和生物信息学筛选系统性红斑狼疮核心基因及通路[J]. 朱晴,蔡昕添,洪静,李南方.  新疆医学. 2019(07)



本文编号：3246386