15位点重复单元-可变数目串联重复序列技术在河南地区结核分枝杆菌的基因分辨率的对比分析研究

发布时间：2021-06-25 22:14

　　目的比较15位点分枝杆菌散在重复单元-可变数目串联重复序列（MIRU-VNTR）对河南省结核分枝杆菌的分辨力与其他地区的区别。方法使用Spoligotyping和MIRU-VNTR对菌株进行分型,分析北京家族基因型在性别、年龄和地区间的分布情况。将15个位点对本省菌株的分辨率与其他地区结果相比较。结果本省东部地区患者感染北京家族结核的比例高于其他地区,尤其高于西部地区。本省55岁以上的人群更易感染北京型菌株。7个位点（Mtub04、MIRU10、MIRU39、MIRU31、Mtub21、MIRU26和Qub26）对河南菌株的分辨能力优于其他地区。15位点MIRU-VNTR结合Spoligotyping的分辨力高于我国其他大部分地区,但略低于上海和黑龙江。结论北京基因型在本省的分布存在地区和年龄的差异。15个位点MIRU-VNTR的分辨力在本省和其他地区间存在明显不同,因此需针对本省菌株指定合适的分型方案。 

【文章来源】：中国卫生检验杂志. 2020,30(13)

【文章页数】：5 页

【文章目录】：
1 材料与方法
    1.1 菌株
    1.2 方法
        1.2.1 DNA的提取
        1.2.2 基因分型
    1.3 统计学处理
2 结果
    2.1 河南地区北京家族基因型的地区和人口分布
    2.2 标准15位点VNTR对河南地区菌株的分辨能力
    2.3 15位点MIRU-VNTR在不同地区间的HGDI指数
    2.4 我国不同地区不同位点组合对结核分枝杆菌的分辨力
3 讨论


【参考文献】：
期刊论文
[1]甘肃省临床分离结核分枝杆菌MLVA分型初步研究[J]. 同重湘,赵秀芹,马建军,刘志广,曹文静,杨永红,吕冰,姜元,万康林.  中国人兽共患病学报. 2010(07)
[2]70株浙江省结核分枝杆菌临床分离株Spoligotyping基因分型研究[J]. 王晓萌,刘志广,柳正卫,刘洁,赵秀芹,张媛媛,吕冰,万康林.  中国预防医学杂志. 2008(11)
[3]MLVA技术用于福建105株结核分枝杆菌基因分型的初步研究[J]. 蒋毅,张丽水,赵秀芹,黄明翔,刘志广,王琳,董海燕,万康林.  中国人兽共患病学报. 2007(01)



本文编号：3250034