烟草Nt14-3-3基因参与耐受低钾和高盐胁迫的功能研究
发布时间：2021-06-26 09:54
14-3-3蛋白是存在于多细胞真核组织中高度保守的调节分子,通过与不同靶蛋白相互作用,在植物的生命进程中发挥着重要的调控功能。对植物14-3-3蛋白的研究集中在拟南芥中,在烟草中对14-3-3蛋白的研究较少,尤其是分子调控机制方面。所以本研究通过一系列生物信息学分析及生物技术手段研究了烟草Nt14-3-3基因响应低钾和高盐胁迫的分子机制,得到了七个主要结论:（1）通过同源克隆的方法,设计引物从普通烟草K326的cDNA中扩增得到2个14-3-3基因的CDS序列,命名为14-3-3a及14-3-3b,长度分别为783bp及759bp;并从K326的总DNA中扩增得到了2个14-3-3基因的基因组全长序列,长度分别为5111bp及3069bp。生物信息学分析发现2个14-3-3蛋白都含有多个磷酸化位点以及由9个相对保守的α螺旋组成的蛋白结构,是植物14-3-3蛋白典型的结构特征。（2）qRT-PCR分析结果表明,2个14-3-3基因在烟草的各个组织中均有表达,但在幼苗根部的表达水平最高。诱导表达分析表明,2个14-3-3基因的表达水平,受到逆境胁迫因子以及信号分子的显著诱导。其中,只有在A...
【文章来源】：四川农业大学四川省 211工程院校
【文章页数】：104 页
【学位级别】：硕士
【部分图文】：
图2.32个14-3-3蛋白的疏水性分析
四川农业大学硕士学位论文18图2.42个14-3-3蛋白的二级结构及三级结构预测Fig.2.4Predictionofsecondarystructureandtertiarystructureoftwo14-3-3proteins注：A:14-3-3a二级结构预测；B:14-3-3a三级结构预测；C:14-3-3b二级结构预测；D:14-3-3b三级结构预测；
四川农业大学硕士学位论文19Note:A:14-3-3asecondarystructureprediction;B:14-3-3atertiarystructureprediction;C:14-3-3bsecondarystructureprediction;D:14-3-3btertiarystructureprediction2.4.6信号肽预测蛋白质信号肽的分泌与蛋白质功能域划分及蛋白质在细胞中的定位有密切关系。信号肽通常是一段约由10-30个氨基酸残基组成的疏水性肽段。根据信号肽序列特征，对信号肽位置及剪切位点进行预测。对14-3-3a、14-3-3b、基因编码蛋白的信号肽进行预测，结果表明(如图2.5)，14-3-3a和14-3-3b预测结果中S平均值均小于0.5，表明它们都不能分泌，该蛋白自身没有信号肽。图2.52个14-3-3蛋白的信号肽预测Fig.2.5Signalpeptidepredictionoftwo14-3-3proteins注：A:14-3-3a信号肽预测；B:14-3-3b信号肽预测；红色、绿色和蓝色线条分别表示C-值、S-值和Y-值。Note:A:Signalpeptidepredictionof14-3-3a;B:Signalpeptidepredictionof14-3-3b;red,green,andbluelinesindicateC-score,S-scoreandY-score,respectively.2.4.7功能结构域分析利用预测的氨基酸序列，对其进行结构域分析，结果显示（图2.6），结果显示(如图5)，该14-3-3a、14-3-3b均属于14-3-3蛋白家族，并且均具有植物14-3-3蛋白典型结构域(Pfam00244)，说明它们可能属于植物14-3-3蛋白家族。AB
【参考文献】：
期刊论文
[1]烟草钾离子通道基因NtTPK的克隆及表达分析[J]. 许力,黄路平,鲁黎明,李立芹. 浙江农业学报. 2017(03)
[2]烟草重要基因篇:2.烟草钾吸收与转运相关基因[J]. 王倩,刘好宝. 中国烟草科学. 2014(02)
[3]林烟草钾离子通道基因NKT6的克隆与表达定位分析[J]. 靳义荣,宋毓峰,白岩,张良,董连红,刘朝科,冯祥国,胡晓明,王倩,刘好宝. 作物学报. 2013(09)
[4]植物14-3-3蛋白研究进展[J]. 崔娜,于志海,韩明利,董雪飞,曲波,李天来. 西北植物学报. 2012(04)
[5]14-3-3蛋白对植物发育的调控作用[J]. 周颖,李冰樱,李学宝. 植物学报. 2012(01)
[6]普通烟草K+通道基因NKT4的克隆、序列和表达分析[J]. 曲平治,刘贯山,刘好宝,司丛丛,胡晓明,冯祥国,刘朝科. 植物遗传资源学报. 2009(03)
[7]The role of calcium sensor-interacting protein kinases in plant adaptation to potassium-deficiency: new answers to old questions[J]. Anna Amtmann,Patrick Armengaud. Cell Research. 2007(06)
[8]14-3-3蛋白与植物细胞信号转导[J]. 肖强,郑海雷. 细胞生物学杂志. 2005(04)
[9]The crystal structure of the non-liganded 14-3-3σ protein: insights into determinants of isoform specific ligand binding and dimerization[J]. Anne BENZINGER,Grzegorz M. POPOWICZ,Joma K. JOY,Sudipta MAJUMDAR,Tad A. HOLAK,Heiko HERMEKING. Cell Research. 2005(04)
[10]番茄不同部位中糖含量和相关酶活性的研究[J]. 齐红岩,李天来,刘海涛,张洁. 园艺学报. 2005(02)
博士论文
[1]拟南芥转录因子ARF2响应低钾胁迫的分子机制研究[D]. 赵帅.中国农业大学 2016
硕士论文
[1]杉木14-3-3蛋白基因的克隆和表达分析[D]. 倪点乐.福建农林大学 2013
本文编号：3251126
【文章来源】：四川农业大学四川省 211工程院校
【文章页数】：104 页
【学位级别】：硕士
【部分图文】：
图2.32个14-3-3蛋白的疏水性分析
四川农业大学硕士学位论文18图2.42个14-3-3蛋白的二级结构及三级结构预测Fig.2.4Predictionofsecondarystructureandtertiarystructureoftwo14-3-3proteins注：A:14-3-3a二级结构预测；B:14-3-3a三级结构预测；C:14-3-3b二级结构预测；D:14-3-3b三级结构预测；
四川农业大学硕士学位论文19Note:A:14-3-3asecondarystructureprediction;B:14-3-3atertiarystructureprediction;C:14-3-3bsecondarystructureprediction;D:14-3-3btertiarystructureprediction2.4.6信号肽预测蛋白质信号肽的分泌与蛋白质功能域划分及蛋白质在细胞中的定位有密切关系。信号肽通常是一段约由10-30个氨基酸残基组成的疏水性肽段。根据信号肽序列特征，对信号肽位置及剪切位点进行预测。对14-3-3a、14-3-3b、基因编码蛋白的信号肽进行预测，结果表明(如图2.5)，14-3-3a和14-3-3b预测结果中S平均值均小于0.5，表明它们都不能分泌，该蛋白自身没有信号肽。图2.52个14-3-3蛋白的信号肽预测Fig.2.5Signalpeptidepredictionoftwo14-3-3proteins注：A:14-3-3a信号肽预测；B:14-3-3b信号肽预测；红色、绿色和蓝色线条分别表示C-值、S-值和Y-值。Note:A:Signalpeptidepredictionof14-3-3a;B:Signalpeptidepredictionof14-3-3b;red,green,andbluelinesindicateC-score,S-scoreandY-score,respectively.2.4.7功能结构域分析利用预测的氨基酸序列，对其进行结构域分析，结果显示（图2.6），结果显示(如图5)，该14-3-3a、14-3-3b均属于14-3-3蛋白家族，并且均具有植物14-3-3蛋白典型结构域(Pfam00244)，说明它们可能属于植物14-3-3蛋白家族。AB
【参考文献】：
期刊论文
[1]烟草钾离子通道基因NtTPK的克隆及表达分析[J]. 许力,黄路平,鲁黎明,李立芹. 浙江农业学报. 2017(03)
[2]烟草重要基因篇:2.烟草钾吸收与转运相关基因[J]. 王倩,刘好宝. 中国烟草科学. 2014(02)
[3]林烟草钾离子通道基因NKT6的克隆与表达定位分析[J]. 靳义荣,宋毓峰,白岩,张良,董连红,刘朝科,冯祥国,胡晓明,王倩,刘好宝. 作物学报. 2013(09)
[4]植物14-3-3蛋白研究进展[J]. 崔娜,于志海,韩明利,董雪飞,曲波,李天来. 西北植物学报. 2012(04)
[5]14-3-3蛋白对植物发育的调控作用[J]. 周颖,李冰樱,李学宝. 植物学报. 2012(01)
[6]普通烟草K+通道基因NKT4的克隆、序列和表达分析[J]. 曲平治,刘贯山,刘好宝,司丛丛,胡晓明,冯祥国,刘朝科. 植物遗传资源学报. 2009(03)
[7]The role of calcium sensor-interacting protein kinases in plant adaptation to potassium-deficiency: new answers to old questions[J]. Anna Amtmann,Patrick Armengaud. Cell Research. 2007(06)
[8]14-3-3蛋白与植物细胞信号转导[J]. 肖强,郑海雷. 细胞生物学杂志. 2005(04)
[9]The crystal structure of the non-liganded 14-3-3σ protein: insights into determinants of isoform specific ligand binding and dimerization[J]. Anne BENZINGER,Grzegorz M. POPOWICZ,Joma K. JOY,Sudipta MAJUMDAR,Tad A. HOLAK,Heiko HERMEKING. Cell Research. 2005(04)
[10]番茄不同部位中糖含量和相关酶活性的研究[J]. 齐红岩,李天来,刘海涛,张洁. 园艺学报. 2005(02)
博士论文
[1]拟南芥转录因子ARF2响应低钾胁迫的分子机制研究[D]. 赵帅.中国农业大学 2016
硕士论文
[1]杉木14-3-3蛋白基因的克隆和表达分析[D]. 倪点乐.福建农林大学 2013
本文编号：3251126
本文链接：https://www.wllwen.com/kejilunwen/jiyingongcheng/3251126.html
最近更新
教材专著
