Toll样受体关键基因遗传变异与肺癌易感性关系的研究
发布时间：2021-06-29 14:16
目的Toll样受体（TLRs）是模式识别受体之一,TLR识别特定分子能够激活适应性免疫系统加剧炎症反应。慢性炎症反应与癌症的发生发展密切相关。位于TLRs启动子和3’非翻译区的单核苷酸多态性（Single nucleotide polymorphism,SNP）可能通过影响启动子的活性、调节mRNA与miRNA的结合来影响基因的表达。本研究旨在探讨TLRs基因遗传变异与肺癌易感性的关系。方法采用成组设计的病例对照研究,其中病例组700例,来自2012年至2014年自唐山市工人医院和唐山市人民医院治疗的肺癌病人,对照组700例是同期同地区健康体检的正常人。查阅相关文献,筛选出癌症相关的TLRs基因,包括TLR3,TLR4,TLR5和TLR7基因。利用dbSNP数据库以及Ensembl数据库,筛选出在中国汉族人群中次要等位基因的频率（minor allele frequency,MAF）大于0.05的上述基因的启动子区以及3’非翻译区（UTR）的SNP位点。利用TRANSFAC软件和SNPinfo Web Serve软件进行功能预测,最终筛选出来对转录因子结合或microRNA结合有影响的...
【文章来源】：华北理工大学河北省
【文章页数】：62 页
【学位级别】：硕士
【部分图文】：
TLR4基因rs1927914基因多态的PCR-RFLP及测序分析
- 9 -图 2 TLR4 基因 rs7869402 基因多态的 PCR-RFLP 及测序分析ig.2 Sequencing and PCR-RFLP analysis of TLR4 rs7869402 polymorphism4 rs7869402 基因分型结果：(泳道 1， 2，3， 5 为 CC 基因型，泳道 4 为 CT 基因。)；B：TLR4 rs7869402 各基因型测序结果man 探针法基因分型基因多态性 rs5743303 位点基因分型结果见图 3。根据赛默飞世体信息，A 碱基用 VIC 荧光基团标记，T 碱基用 FAM 荧光基团：只检测到 VIC 信号，为 AA 基因型，在图中显示为蓝色；只，为 TT 基因型在图中显示为红色；VIC 和 FAM 信号都能检测
图 3 TLR3 rs5743303 遗传变异基因分型图谱Fig.3 Genotyping of TLR4 rs5743303 polymorphism因多态性 rs11536891 位点基因分型结果见图 4。根据赛信息，C 碱基用 VIC 荧光基团标记，T 碱基用 FAM 荧只检测到 VIC 信号，为 CC 基因型，在图中显示为蓝为 TT 基因型在图中显示为红色；VIC 和 FAM 信号都在图中显示为绿色。三种颜色代表三种不同的基因型，者。
【参考文献】：
期刊论文
[1]Cancer incidence and mortality in China, 2014[J]. Wanqing Chen,Kexin Sun,Rongshou Zheng,Hongmei Zeng,Siwei Zhang,Changfa Xia,Zhixun Yang,He Li,Xiaonong Zou,Jie He. Chinese Journal of Cancer Research. 2018(01)
[2]TLR7基因rs3853839、rs179010多态性与EV71手足口病男性患儿易感性及病情严重程度相关[J]. 李亚萍,翟嵩,李梅,王媛,路彤,邓慧玲,张欣,党双锁. 细胞与分子免疫学杂志. 2017(07)
[3]TLR2 and TLR4 polymorphisms influence m RNA and protein expression in colorectal cancer[J]. Marcela Alcantara Proen?a,Juliana Garcia de Oliveira,Aline Cristina Targa Cadamuro,Maysa Succi,Jo?o Gomes Netinho,Eny Maria Goloni-Bertolo,érika Cristina Pavarino,Ana Elizabete Silva. World Journal of Gastroenterology. 2015(25)
[4]TLR3 gene polymorphisms in cancer:a systematic review and meta-analysis[J]. Ben-Gang Wang,De-Hui Yi,Yong-Feng Liu. Chinese Journal of Cancer. 2015(06)
[5]Toll样受体在肺癌中的研究进展[J]. 康宝丽,陆英,徐增光. 同济大学学报(医学版). 2015(03)
[6]沉默Toll样受体4表达对肺腺癌A549细胞凋亡及细胞周期的影响[J]. 郭隽馥,王艳杰,苗兰英,丛培玮. 肿瘤防治研究. 2015(03)
[7]Polymorphisms of the TLR2 and TLR4 genes are associated with risk of gastric cancer in a Brazilian population[J]. Juliana Garcia de Oliveira,Ana Elizabete Silva. World Journal of Gastroenterology. 2012(11)
[8]A 5’-flanking region polymorphism in toll-like receptor 4 is associated with gastric cancer in a Chinese population[J]. Hua Huanga, Juan Wua, Guangfu Jina, Hanze Zhanga, Yanbing Dingb, Zhaolai Huac, Yan Zhoud,Yan Xueb, Yan Lua, Zhibin Hua, Yaochu Xua, Hongbing Shena aDepartment of Epidemiology and Biostatistics, Cancer Center, Nanjing Medical University, Nanjing 210029, Jiangsu, China bDepartment of Gastroenterology, Yangzhou First People’s Hospital, Yangzhou 225009, Jiangsu, China cDepartment of Epidemiology, Yangzhong Cancer Institute, Yangzhong 212200, Jiangsu, China dDepartment of Oncology, Yixing People’s Hospital, Yixing 214200, Jiangsu, China. Journal of Biomedical Research. 2010(02)
本文编号：3256595
【文章来源】：华北理工大学河北省
【文章页数】：62 页
【学位级别】：硕士
【部分图文】：
TLR4基因rs1927914基因多态的PCR-RFLP及测序分析
- 9 -图 2 TLR4 基因 rs7869402 基因多态的 PCR-RFLP 及测序分析ig.2 Sequencing and PCR-RFLP analysis of TLR4 rs7869402 polymorphism4 rs7869402 基因分型结果：(泳道 1， 2，3， 5 为 CC 基因型，泳道 4 为 CT 基因。)；B：TLR4 rs7869402 各基因型测序结果man 探针法基因分型基因多态性 rs5743303 位点基因分型结果见图 3。根据赛默飞世体信息，A 碱基用 VIC 荧光基团标记，T 碱基用 FAM 荧光基团：只检测到 VIC 信号，为 AA 基因型，在图中显示为蓝色；只，为 TT 基因型在图中显示为红色；VIC 和 FAM 信号都能检测
图 3 TLR3 rs5743303 遗传变异基因分型图谱Fig.3 Genotyping of TLR4 rs5743303 polymorphism因多态性 rs11536891 位点基因分型结果见图 4。根据赛信息，C 碱基用 VIC 荧光基团标记，T 碱基用 FAM 荧只检测到 VIC 信号，为 CC 基因型，在图中显示为蓝为 TT 基因型在图中显示为红色；VIC 和 FAM 信号都在图中显示为绿色。三种颜色代表三种不同的基因型，者。
【参考文献】：
期刊论文
[1]Cancer incidence and mortality in China, 2014[J]. Wanqing Chen,Kexin Sun,Rongshou Zheng,Hongmei Zeng,Siwei Zhang,Changfa Xia,Zhixun Yang,He Li,Xiaonong Zou,Jie He. Chinese Journal of Cancer Research. 2018(01)
[2]TLR7基因rs3853839、rs179010多态性与EV71手足口病男性患儿易感性及病情严重程度相关[J]. 李亚萍,翟嵩,李梅,王媛,路彤,邓慧玲,张欣,党双锁. 细胞与分子免疫学杂志. 2017(07)
[3]TLR2 and TLR4 polymorphisms influence m RNA and protein expression in colorectal cancer[J]. Marcela Alcantara Proen?a,Juliana Garcia de Oliveira,Aline Cristina Targa Cadamuro,Maysa Succi,Jo?o Gomes Netinho,Eny Maria Goloni-Bertolo,érika Cristina Pavarino,Ana Elizabete Silva. World Journal of Gastroenterology. 2015(25)
[4]TLR3 gene polymorphisms in cancer:a systematic review and meta-analysis[J]. Ben-Gang Wang,De-Hui Yi,Yong-Feng Liu. Chinese Journal of Cancer. 2015(06)
[5]Toll样受体在肺癌中的研究进展[J]. 康宝丽,陆英,徐增光. 同济大学学报(医学版). 2015(03)
[6]沉默Toll样受体4表达对肺腺癌A549细胞凋亡及细胞周期的影响[J]. 郭隽馥,王艳杰,苗兰英,丛培玮. 肿瘤防治研究. 2015(03)
[7]Polymorphisms of the TLR2 and TLR4 genes are associated with risk of gastric cancer in a Brazilian population[J]. Juliana Garcia de Oliveira,Ana Elizabete Silva. World Journal of Gastroenterology. 2012(11)
[8]A 5’-flanking region polymorphism in toll-like receptor 4 is associated with gastric cancer in a Chinese population[J]. Hua Huanga, Juan Wua, Guangfu Jina, Hanze Zhanga, Yanbing Dingb, Zhaolai Huac, Yan Zhoud,Yan Xueb, Yan Lua, Zhibin Hua, Yaochu Xua, Hongbing Shena aDepartment of Epidemiology and Biostatistics, Cancer Center, Nanjing Medical University, Nanjing 210029, Jiangsu, China bDepartment of Gastroenterology, Yangzhou First People’s Hospital, Yangzhou 225009, Jiangsu, China cDepartment of Epidemiology, Yangzhong Cancer Institute, Yangzhong 212200, Jiangsu, China dDepartment of Oncology, Yixing People’s Hospital, Yixing 214200, Jiangsu, China. Journal of Biomedical Research. 2010(02)
本文编号：3256595
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