响应柑橘溃疡病菌侵染的枸橼C-05抗性基因PR4A的鉴定
发布时间：2021-07-04 00:54
柑橘溃疡病是一种危害全球所有商业化柑橘品种的世界性检疫性病害,感染柑橘溃疡病后,将导致柑橘树叶片提前脱落,使柑橘减产,是对柑橘产业最具毁灭性危害的病害之一。目前还未发现完全治愈柑橘溃疡病的方法,生产上通常采用铜制剂抑制柑橘溃疡病菌生长来控制柑橘溃疡病的传播,因此,抗病育种成为辅助柑橘产业抵抗柑橘溃疡病的关键方法。经全球对近百种柑橘种质的筛选,发现了部分耐柑橘溃疡病的种质,但未能得到抗病的资源,本课题组经近十年筛选,获得了对柑橘溃疡病具有稳定抗性的柑橘种质——枸橼C-05,为将其应用到柑橘的抗病育种中,需先探明其对柑橘溃疡病的抗性机制。本研究以抗病种质枸橼C-05为试验材料,不同的感病种质作为对照,筛选与枸橼C-05抗柑橘溃疡病相关的PR4基因,并分析其在枸橼C-05抗病反应中对柑橘溃疡病菌的响应机制。主要研究结论如下:1.通过冰糖橙及枸橼C-05的转录组数据对比分析,发现PR1-1、PR2-1、PR2-3、PR3-1和PR8-2基因可能参与枸橼C-05对Xcc的抗病反应,而PR4-5在枸橼C-05受Xcc侵染后具有特异的上调表达,且在接种Xcc后6 d-12 d一直处于高表达状态,初步...
【文章来源】：湖南农业大学湖南省
【文章页数】：93 页
【学位级别】：硕士
【部分图文】：
枸橼C-05转录组测序中PR基因的差异表达分析
湖南农业大学硕士学位论文20图2-3枸橼C-05及冰糖橙中PR基因的比较分析JYC-05：枸橼C-05转录组数据中该基因受Xcc诱导表达量变化；BTC：冰糖橙转录组数据中该基因受Xcc诱导表达量变化；JYC-05Xoo：枸橼C-05转录组数据中该基因受Xoo诱导表达量变化；BTCXoo：冰糖橙转录组数据中该基因受Xoo诱导表达量变化Figure2-3TranscriptomicprofilingofPRgenesbetweenCitronC-05and‘Bingtang’sweetorange
第三章柑橘PR4基因对柑橘溃疡病菌响应表达分析27表3-4甜橙基因组PR4基因Table3-4ThePR4genesofsweetorange基因Gene基因编号GeneID转录本数NumberofTranscripts内含子数NumberofIntrons外显子数NumberofExon蛋白大小ProteinSizePR4-1Cs8g13680112143aaPR4-2Cs8g13700112241aaPR4-3Cs8g13710112194aaPR4-4Cs8g13730112210aaPR4-5PR4ACs8g13740112200aa图3-1CsPR4基因染色体定位及基因结构Figure3-1LocalizationsofPR4genesonchromosomeandthestructureofPR4s5个不同的PR4基因均含有2个外显子和1个内含子（图3-1B，表3-4），甜橙中PR4-1、PR4-2、PR4-3、PR4-4和PR4A基因的gDNA总大小分别为524bp、523bp、1194bp、1082bp和602bp，5个PR4基因编码的PR4蛋白大小分别为143aa、141aa、194aa、194aa和144aa。其中PR4-3蛋白与PR4-4蛋白氨基酸序列间相似度有97.4%，PR4-1蛋白与PR4-2蛋白氨基酸序列间相似度有83.9%，而PR4A蛋白与PR4-1、PR4-2、PR4-3和PR4-4均有较大差异，相似度分别为71.5%、65.3%、49%和47.9%（图3-2）。PR4蛋白家族有两类蛋白，两类蛋白均含有参与植物防御反应的Barwin结构域。两类蛋白的差异在于是否含有Hevein结构域（几丁质结合域），第一类蛋白含有几丁AB
【参考文献】：
期刊论文
[1]根际促生解淀粉芽胞杆菌SQR9对香蕉根系分泌物响应的转录组分析[J]. 罗兴,冯海超,夏丽明,张瑞福,余光辉,沈其荣,张楠. 南京农业大学学报. 2019(01)
[2]青梗花椰菜和白梗花椰菜转录组分析[J]. 林珲,薛珠政,李永平,李大忠,刘建汀,朱海生,温庆放. 核农学报. 2018(09)
[3]柑橘溃疡病菌分化及防治研究进展[J]. 姚廷山,周彦,周常勇. 园艺学报. 2015(09)
硕士论文
[1]响应柑橘黄龙病的MAPK基因和PR基因鉴定及遗传转化[D]. 王苗苗.西南大学 2018
本文编号：3263695
【文章来源】：湖南农业大学湖南省
【文章页数】：93 页
【学位级别】：硕士
【部分图文】：
枸橼C-05转录组测序中PR基因的差异表达分析
湖南农业大学硕士学位论文20图2-3枸橼C-05及冰糖橙中PR基因的比较分析JYC-05：枸橼C-05转录组数据中该基因受Xcc诱导表达量变化；BTC：冰糖橙转录组数据中该基因受Xcc诱导表达量变化；JYC-05Xoo：枸橼C-05转录组数据中该基因受Xoo诱导表达量变化；BTCXoo：冰糖橙转录组数据中该基因受Xoo诱导表达量变化Figure2-3TranscriptomicprofilingofPRgenesbetweenCitronC-05and‘Bingtang’sweetorange
第三章柑橘PR4基因对柑橘溃疡病菌响应表达分析27表3-4甜橙基因组PR4基因Table3-4ThePR4genesofsweetorange基因Gene基因编号GeneID转录本数NumberofTranscripts内含子数NumberofIntrons外显子数NumberofExon蛋白大小ProteinSizePR4-1Cs8g13680112143aaPR4-2Cs8g13700112241aaPR4-3Cs8g13710112194aaPR4-4Cs8g13730112210aaPR4-5PR4ACs8g13740112200aa图3-1CsPR4基因染色体定位及基因结构Figure3-1LocalizationsofPR4genesonchromosomeandthestructureofPR4s5个不同的PR4基因均含有2个外显子和1个内含子（图3-1B，表3-4），甜橙中PR4-1、PR4-2、PR4-3、PR4-4和PR4A基因的gDNA总大小分别为524bp、523bp、1194bp、1082bp和602bp，5个PR4基因编码的PR4蛋白大小分别为143aa、141aa、194aa、194aa和144aa。其中PR4-3蛋白与PR4-4蛋白氨基酸序列间相似度有97.4%，PR4-1蛋白与PR4-2蛋白氨基酸序列间相似度有83.9%，而PR4A蛋白与PR4-1、PR4-2、PR4-3和PR4-4均有较大差异，相似度分别为71.5%、65.3%、49%和47.9%（图3-2）。PR4蛋白家族有两类蛋白，两类蛋白均含有参与植物防御反应的Barwin结构域。两类蛋白的差异在于是否含有Hevein结构域（几丁质结合域），第一类蛋白含有几丁AB
【参考文献】：
期刊论文
[1]根际促生解淀粉芽胞杆菌SQR9对香蕉根系分泌物响应的转录组分析[J]. 罗兴,冯海超,夏丽明,张瑞福,余光辉,沈其荣,张楠. 南京农业大学学报. 2019(01)
[2]青梗花椰菜和白梗花椰菜转录组分析[J]. 林珲,薛珠政,李永平,李大忠,刘建汀,朱海生,温庆放. 核农学报. 2018(09)
[3]柑橘溃疡病菌分化及防治研究进展[J]. 姚廷山,周彦,周常勇. 园艺学报. 2015(09)
硕士论文
[1]响应柑橘黄龙病的MAPK基因和PR基因鉴定及遗传转化[D]. 王苗苗.西南大学 2018
本文编号：3263695
本文链接：https://www.wllwen.com/kejilunwen/jiyingongcheng/3263695.html
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