DNA双链断裂修复基因BRCA1 3’UTR SNP影响结直肠癌易感的相关性研究

发布时间：2021-07-05 13:53

　　目的:在我国近年来的结直肠癌（colorectal carcinoma,CRC）发病率及死亡率逐年升高,减少结直肠癌CRC发病率及病死率的有效手段是早发现并早治疗。寻找意义确切的与结直肠癌易感性相关的易感性生物学标志对其早期预防有着重要意义。结直肠癌的发生发展是遗传因素和环境因素两者共同作用的结果。CRC分子病因学揭示出这种恶性肿瘤是由遗传损伤积累而发生发展的。DNA损伤如果没有正确修复,进而累积可导致基因组不稳定、细胞衰老或凋亡,并最终可能使生物体易患包括恶性肿瘤在内的多种疾病。双链断裂（double-strand breaks,DSBs）是最为严重的DNA损伤类型之一,对其有效的修复是保持基因组稳定性的重要机制。采用生物信息学技术开展本次研究以DSBR（DNA双链断裂修复）修复系统如HR（同源重组）修复中的RAD51和BRCA1等以及NHEJ（非同源末端链接）修复中的XRCC4、XRCC5等择取为靶目标基因,又以本次研究选取的CRC病例数以及MAF值（最小等位基因频率）选择靶目标基因3’UTR区位置的SNP。并依据结直肠癌病例-对照研究求证已选的SNP和CRC发病风险的联系,选用生... 

【文章来源】：中国医科大学辽宁省

【文章页数】：56 页

【学位级别】：硕士

【部分图文】：

DNA双链断裂修复中HR及NHEJ机制图

中国医科大学硕士学位论文113.2病例对照研究3.2.1结直肠癌病例与对照的匹配临床收集CRC病例202例，依据性别年龄1:1匹配正常健康对照202例：性别一致；年龄差低于2岁。病例组诊断时的平均年龄为62.18岁，对照组平均年龄为61.59岁，差异不具有统计学意义。表3.7病例对照的人口学特征变量CRC病例（n=202）对照（n=202）P年龄62.18±12.63761.59±13.1530.717男62.35±12.93761.22±13.8210.666女61.97±13.32262.06±12.3300.984性别1男113(55.5)113(55.5）女89(44.5)89(44.5)3.2.2结直肠癌病例性别与年龄分布特征我们的研究中，202名CRC病例的年龄主要集中于40-79岁；最大年龄者为84岁，最小年龄者为25岁。病例组发病年龄的分布描述见图3.1。图3.1病例组发病年龄分布

3.3 生物信息学预测与 rs12516 相关的 miRNA 与 LncRNA3.3.1 SNP 多态性对 BRCA1 的 m RNA 二级结构影响RNAfold 网站预测 rs12516 多态能否改变 BRCA1mRNA 二级结构。通过应用生物信息学方法对二级结构的预测，我们观察到了 G 等位基因与 A 等位基因相比结构特征发生变化（图 3.2）

【参考文献】：
期刊论文
[1]中国结直肠癌筛查的研究历史现状与展望[J]. 张政,李鹏,张澍田.  中国实用内科杂志. 2018(09)

硕士论文
[1]DNA修复基因XPD、XPC、XRCC4基因多态性与结直肠癌易感性的相关性研究[D]. 张莎.山东大学 2017



本文编号：3266193