红肉火龙果TST基因家族的生物信息学分析
发布时间:2021-07-11 12:25
为分离参与红肉火龙果果实可溶性糖积累的功能基因,基于转录组测序数据克隆液泡糖转运蛋白(Tonoplast sugar transporter,TST)基因家族,进行序列同源性、跨膜结构、亚细胞定位和系统发育等生物信息学分析。结果表明:红肉火龙果含有4个TST基因,开放读码框(open reading frame,ORF)长度为2 127~2 235bp,编码长度为708~744个氨基酸的序列。预测等电点为4.84~5.36,相对分子量为75.7~80.4kDa;红肉火龙果TST家族氨基酸序列与甜菜和藜麦TST家族具有74.9%~83.4%的相似性;红肉火龙果TST成员均含11~12个跨膜结构域,定位于质体、叶绿体、液泡或内质网等细胞器。系统进化分析表明HpTST1属于TST1类,HpTST2.1和HpTST2.2属于TST2类,HpTST3属于TST3类。
【文章来源】:贵州农业科学. 2020,48(07)
【文章页数】:4 页
【部分图文】:
TST基因家族的系统发育树
【参考文献】:
期刊论文
[1]园艺作物果实液泡糖、酸转运与转化研究进展[J]. 张绍铃,贾璐婷,王利斌,张臻. 南京农业大学学报. 2019(04)
[2]红肉火龙果(Hylocereus polyrhizus)果实与茎转录组测序分析[J]. 郑乾明,王壮,蔡永强,马玉华. 分子植物育种. 2019(01)
[3]苹果糖转运蛋白TMT基因的表达及其与糖积累的关系[J]. 马新立,秦源,魏晓钰,马锋旺,李明军. 园艺学报. 2014(07)
本文编号:3278092
【文章来源】:贵州农业科学. 2020,48(07)
【文章页数】:4 页
【部分图文】:
TST基因家族的系统发育树
【参考文献】:
期刊论文
[1]园艺作物果实液泡糖、酸转运与转化研究进展[J]. 张绍铃,贾璐婷,王利斌,张臻. 南京农业大学学报. 2019(04)
[2]红肉火龙果(Hylocereus polyrhizus)果实与茎转录组测序分析[J]. 郑乾明,王壮,蔡永强,马玉华. 分子植物育种. 2019(01)
[3]苹果糖转运蛋白TMT基因的表达及其与糖积累的关系[J]. 马新立,秦源,魏晓钰,马锋旺,李明军. 园艺学报. 2014(07)
本文编号:3278092
本文链接:https://www.wllwen.com/kejilunwen/jiyingongcheng/3278092.html
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