基质金属蛋白酶10和13基因单核苷酸多态性与慢性阻塞性肺病的相关性研究

发布时间：2021-07-14 06:27

　　目的:探究基质金属蛋白酶-10（matrix metalloproteinase-10,MMP-10）基因多态性位点rs17435959（C>G）和基质金属蛋白酶-13（matrix metalloproteinase-13,MMP-13）基因多态性位点rs2252070（G>A）与慢性阻塞性肺疾病（chronic obstructive pulmonary disease,COPD）的相关性,为筛选COPD易感候选基因提供依据。方法:应用碱基猝灭探针技术对性别、年龄和吸烟状况匹配的305例COPD病例和326例健康对照进行基因分型,分别检测多态性位点rs17435959和rs2252070在COPD患者和健康对照中的等位基因、基因型、单倍型频率的分布情况。结果:MMP-10等位基因分布在两组中无统计学差异（P=0.66,OR=0.90）,CG+GG基因型频率在两组中无统计学差异（P=0.74,OR=1.08）,在轻度至中度COPD、重度至极重度COPD和健康对照之间无统计学差异（等位基因P=0.89,显性模型基因型P=0.83）;MMP-13等位基因分布在两组中无统计学差... 

【文章来源】：苏州大学江苏省 211工程院校

【文章页数】：64 页

【学位级别】：硕士

【部分图文】：

注：a示人染色体11q22.3位置基质金属蛋白酶基因位点，共包含9个MMPs亚型，目前已有研究提示该区域MMP-1、MMP-3、MMP-12蛋白酶及其基因多态性与COPD易感性相关，箭头指示转录方向；

图 4），由于一个碱基的错配可导致其比完全配对的情况下在相对较低的温度下解链，即提前出现熔解谷，不同的探针及实验条件该温度差异波动在 5-7℃左右，而同一探针及位点，相同的反应体系下该温度的差异是稳定不变的。因此在熔解曲线上，单一的谷则提示为纯合子，两个不同温度出现的谷则提示杂合子，而相对应的基因型取决于探针的具体设计。该方法虽然具有简单、经济、可靠、污染少、快速检测等优点，但难点在于探针的建立。稳定可靠的探针建立需要注意以下问题：1）G 碱基自身对荧光有较强猝灭作用，FAM 荧光基团避免直接标记在 G 碱基；2）引物的解链温度（melting temperature，TM）值尽量偏高，接近 60℃，而探针的 TM 值则需低于引物的 TM 值，鉴于 LightCycler（version 480II，Roche）PCR 仪的熔解曲线温度一般为 40-70℃，且较低温度下容易形成错配，故探针的 TM 值往往在 55℃附近；3）实验中对杂合子的检测能力是探针建立的成功与否的最可靠评价标准。

图 3 rs17435959 多态性位点基因型熔解曲线图Fig3. The melting curve of rs17435959 for genotyping：MMP-10 多态性位点 rs17435959 G>C 为 CC 基因型时则对应较高温度时的熔解，TM 值约为 57.9℃，而 GG 基因型则由于一个碱基的错配导致解链温度降低，溶


本文编号：3283610