基于GEO数据库分析类风湿关节炎及骨关节炎的关键基因

发布时间：2021-07-15 11:06

　　目的:探讨类风湿关节炎及骨关节炎中的共同关键基因及其功能意义。方法:通过GEO数据库分析类风湿关节炎及骨关节炎的差异基因,并使用DAVID数据库对差异基因进行通路富集分析和功能注释,通过STRING数据库构建差异基因的蛋白-蛋白相互作用（PPI）网络,并下载结果进一步分析。结果:GEO数据库分析表达谱数据集GSE55235和GSE55457共得到112个差异基因,DAVID数据库富集分析表明,这些差异基因主要富集在免疫应答、整合在质膜、DNA序列特异性结合以及IgA生成的肠道免疫网络。STRING数据库分析显示,共有72个基因存在于PPI网络中,而JUN、MYC、VEGFA、ATF3、CD19、EGR1、CXCL10、TLR7、TLR8和NR4A1为网络中的关键基因。结论:JUN、MYC、VEGFA、ATF3、CD19、EGR1、CXCL10、TLR7、TLR8和NR4A1在类风湿关节炎及骨关节炎中表达失调,有望成为类风湿关节炎及骨关节炎的生物标志物及治疗靶点。 

【文章来源】：风湿病与关节炎. 2020,9(10)

【文章页数】：6 页

【部分图文】：

差异基因的筛选

差异基因的GO和KEGG通路富集分析

差异基因PPI网络构建及模块分析


本文编号：3285585