脊椎动物核糖体蛋白基因的生物信息学分析及其在硬骨鱼类中的表达研究
发布时间：2021-07-19 17:04
核糖体（ribosome）是执行蛋白质生物合成的分子机器,核糖体蛋白（ribosomal protein,RP）是组成核糖体的主要成分。核糖体蛋白除参与蛋白质合成,还与细胞其它生理进程和核糖体外功能相关。核糖体蛋白基因是核糖体蛋白的编码基因,近年来有关核糖体蛋白基因的结构和功能研究取得了较大的进展。随着越来越多的核糖体蛋白基因从不同物种中被鉴定出来,核糖体蛋白基因已成为比较基因组学、基因组进化和系统发育研究的重要分子标记。然而,由于核糖体蛋白基因数量繁多,大多数物种尚未进行基因组测序,使得了解其在不同物种中的完整序列信息和基因组分布非常困难,且在多数脊椎动物中还没有被全面鉴定过,其系统演化还不清晰。鱼类作为脊椎动物中种类最大的类群,过去由于基因组序列的缺乏,绝大多数鱼类的核糖体蛋白基因数量至今尚不清楚。有关核糖体蛋白基因在脊椎动物中的表达和功能研究大多集中在少数模式动物,且局限于单个基因的研究,大部分核糖体蛋白基因在硬骨鱼类中的表达模式和功能仍不清楚。那么,在不同分类地位的鱼类中,其核糖体蛋白基因数量及其在基因组中的分布规律如何?核糖体蛋白基因在硬骨鱼类不同组织中的表达模式如何?其表达...
【文章来源】：西南大学重庆市 211工程院校 教育部直属院校
【文章页数】：151 页
【学位级别】：博士
【部分图文】：
核糖体结构示意图（引自SchmeingandRamakrishnan,2009）
第1章文献综述3对于的氨基酸带入核糖体合成肽链。蛋白质的翻译过程分为翻译起始、翻译延伸和翻译终止三个阶段（图2）（SchmeingandRamakrishnan,2009）。图2核糖体的翻译过程流程图（引自SchmeingandRamakrishnan,2009）Figure2Thedutycycleofribosometranslationprocess(CitedfromSchmeingandRamakrishnan,2009）所有的核糖体都是由大亚基和小亚基构成，它们只有在以mRNA为模板合成蛋白质时结合在一起，肽链合成终止后，大小亚基会解离，重新游离于细胞质基质中。核糖体的整体结构在原核生物和真核生物上相似。小亚基可以被分为头部、喙部、平台部、主体部、肩部、左脚部和右脚部区域（Klingeetal.,2011）。大亚基在核心结构上也较保守，包括中央隆起部、两个茎和SRL（sarcin-ricinloop）。原核生物和真核生物核糖体结构上的差异主要体现在溶液面（图3和图4）。
西南大学博士学位论文4图3核糖体小亚基示意图（引自WilsonandDoudna,2012）A，B）细菌核糖体小亚基接触面（上图）和溶液面（下图）。A）用不同颜色区分16SrRNA结构域和相关核糖体蛋白：b，主体（蓝色）；h，头部（红色）；pt，平台（绿色）；h44，螺旋域44（黄色）。B）16SrRNA用灰色表示，核糖体蛋白用其它颜色并标注名称。C-E）真核生物核糖体小亚基的接触面和溶液面。C）红色表示真核生物特异的核糖体蛋白，粉红色表示rRNA，灰色表示保守的rRNA，蓝色表示核糖体蛋白；D，E）灰色表示18SrRNA，核糖体蛋白用其它颜色表示并标注名称。Figure3Thesmallribosomalsubunit（CitedfromWilsonandDoudna,2012）(A,B)Interface(upper)andsolvent(lower)viewsofthebacterial30Ssubunit.(A)16SrRNAdomainsandassociatedRPproteinscoloreddistinctly:b,body(blue);h,head(red);pt,platform(green);andh44,helix44(yellow).(B)16SrRNAcoloredgrayandRPproteinscoloreddistinctlyandlabeled.(C–E)Interfaceandsolventviewsoftheeukaryotic40Ssubunit,with(C)eukaryotic-specificRPproteins(red)andrRNA(pink)shownrelativetoconservedrRNA(gray)andRPproteins(blue),andwith(D,E)18SrRNAcoloredgrayandRPproteinscoloreddistinctlyandlabeled.
【参考文献】：
期刊论文
[1]The role of ribosomal proteins in the regulation of cell proliferation, tumorigenesis, and genomic integrity[J]. Xilong Xu,Xiufang Xiong,Yi Sun. Science China（Life Sciences）. 2016(07)
本文编号：3291081
【文章来源】：西南大学重庆市 211工程院校 教育部直属院校
【文章页数】：151 页
【学位级别】：博士
【部分图文】：
核糖体结构示意图（引自SchmeingandRamakrishnan,2009）
第1章文献综述3对于的氨基酸带入核糖体合成肽链。蛋白质的翻译过程分为翻译起始、翻译延伸和翻译终止三个阶段（图2）（SchmeingandRamakrishnan,2009）。图2核糖体的翻译过程流程图（引自SchmeingandRamakrishnan,2009）Figure2Thedutycycleofribosometranslationprocess(CitedfromSchmeingandRamakrishnan,2009）所有的核糖体都是由大亚基和小亚基构成，它们只有在以mRNA为模板合成蛋白质时结合在一起，肽链合成终止后，大小亚基会解离，重新游离于细胞质基质中。核糖体的整体结构在原核生物和真核生物上相似。小亚基可以被分为头部、喙部、平台部、主体部、肩部、左脚部和右脚部区域（Klingeetal.,2011）。大亚基在核心结构上也较保守，包括中央隆起部、两个茎和SRL（sarcin-ricinloop）。原核生物和真核生物核糖体结构上的差异主要体现在溶液面（图3和图4）。
西南大学博士学位论文4图3核糖体小亚基示意图（引自WilsonandDoudna,2012）A，B）细菌核糖体小亚基接触面（上图）和溶液面（下图）。A）用不同颜色区分16SrRNA结构域和相关核糖体蛋白：b，主体（蓝色）；h，头部（红色）；pt，平台（绿色）；h44，螺旋域44（黄色）。B）16SrRNA用灰色表示，核糖体蛋白用其它颜色并标注名称。C-E）真核生物核糖体小亚基的接触面和溶液面。C）红色表示真核生物特异的核糖体蛋白，粉红色表示rRNA，灰色表示保守的rRNA，蓝色表示核糖体蛋白；D，E）灰色表示18SrRNA，核糖体蛋白用其它颜色表示并标注名称。Figure3Thesmallribosomalsubunit（CitedfromWilsonandDoudna,2012）(A,B)Interface(upper)andsolvent(lower)viewsofthebacterial30Ssubunit.(A)16SrRNAdomainsandassociatedRPproteinscoloreddistinctly:b,body(blue);h,head(red);pt,platform(green);andh44,helix44(yellow).(B)16SrRNAcoloredgrayandRPproteinscoloreddistinctlyandlabeled.(C–E)Interfaceandsolventviewsoftheeukaryotic40Ssubunit,with(C)eukaryotic-specificRPproteins(red)andrRNA(pink)shownrelativetoconservedrRNA(gray)andRPproteins(blue),andwith(D,E)18SrRNAcoloredgrayandRPproteinscoloreddistinctlyandlabeled.
【参考文献】：
期刊论文
[1]The role of ribosomal proteins in the regulation of cell proliferation, tumorigenesis, and genomic integrity[J]. Xilong Xu,Xiufang Xiong,Yi Sun. Science China（Life Sciences）. 2016(07)
本文编号：3291081
本文链接：https://www.wllwen.com/kejilunwen/jiyingongcheng/3291081.html
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