基于新一代测序技术对不同物种的基因进行标准化及差异化表达分析

发布时间：2021-07-21 07:40

　　高通量技术作为一种革命性的测序技术,由于其高通量、高精度、低成本的特点,已经成为了可以替代基于杂交的微阵列技术进行生物学研究的一种工具。目前,以Roche公司的454技术、Illumina公司的Solexa技术以及ABI公司的SOLID技术为标志的新一代测序技术（Next generation sequencing,NGS）已经被广泛地应用于实际的生物学研究中。高通量测序技术在为基因组的研究提供了有利工具的同时也带来了统计上的挑战。由于基因长度、测序深度以及样本间片段分布的差异性,我们通常不能直接对原始数据进行处理。现有的文献提供了多种方法来进行相同物种RNA-Seq数据的标准化,并且利用标准化之后的数据进行基因的差异化表达分析。本文考虑针对不同物种的RNA-Seq数据进行标准化的问题。识别不同物种之间的差异化表达的基因能够有效地发现进化上保守的转录反应,而且对探索哺乳动物器官中基因表达水平的演变和研究医学中基因的表达水平具有重大影响。由于不同物种之间的基因个数、同源基因的长度以及测序深度的差异,对不同物种的RNA-seq数据的标准化更为复杂,过去所使用的针对相同物种的标准化方法不能直... 

【文章来源】：深圳大学广东省

【文章页数】：47 页

【学位级别】：硕士

【部分图文】：

Illumina测序技术的基本步骤

Roche454测序技术的基本步骤

离子洪流：质子/PGM测序技术的基本步骤


本文编号：3294610