玉米自交系雌穗授粉前后miRNA表达差异及相关调控基因研究

发布时间：2021-07-23 11:47

　　雌穗是玉米获得高产的关键部位,授粉后雌穗发育速度快,因此通过对玉米雌穗授粉前后基因表达差异变化及发育相关基因的研究,对雌穗在这一时期的生长发育调控和代谢机制有着重要意义。microRNA（miRNA）是一类小分子非编码单链RNA,长度约22个碱基,在植物的发育、代谢以及适应不同程度的胁迫反应过程中等都发挥重要作用。本研究基于HiSeq高通量测序技术并结合生物信息学方法对X178和掖478两种材料授粉前后雌穗转录组（RNA-seq）及小分子RNA（small RNA-seq）表达变化进行研究。通过差异表达倍数筛选出授粉前后差异表达的mRNA和miRNA,利用miRNA与靶点mRNA存在负调控的关系,建立miRNA-靶mRNA的对应关系,对靶点及其miRNA进行GO分析和KEGG通路分析。本研究最终得到8个候选基因,这些基因可能在授粉前后雌穗发育过程中起重要作用,为后续雌穗授粉前后发育过程的研究提供一些理论参考。研究结果如下:1.通过对RNA-seq分析,得到X178授粉前后差异表达基因11336个,掖478授粉前后差异表达基因8721个（FDR≤0.001,|log₂

【文章来源】：沈阳农业大学辽宁省

【文章页数】：67 页

【学位级别】：硕士

【部分图文】：

植物miRNA的生物合成过程（kidner，2005）

miRNA-RNAseq联合分析筛选步骤Fig.2ScreeningstepsformiRNA-RNAseqanalyse

图 6 X148 中授粉前后 RNA 运输路径情况 RNAtransport before and after pollination in注：xnnp-xnp，绿色代表上调，红色代表下调。: xnnp-xnp，Green means up regulated，Red means down regu

【参考文献】：
期刊论文
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博士论文
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硕士论文
[1]玉米穗发育对高温胁迫的响应[D]. 于康珂.河南农业大学 2016
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[4]白菜花粉发育与授粉受精相关基因BcAHA8的表达分析及BcSKS11的功能鉴定[D]. 邱琳.浙江大学 2012



本文编号：3299234