茶树隐花色素基因CsCRY1和CsCRY2的克隆及表达模式分析

发布时间：2021-08-03 16:46

　　通过同源比对茶树[Camellia sinensis（Linn.） Kuntze]基因组和转录组数据,获得2个茶树隐花色素（CRY）基因。利用PCR克隆技术,从茶树品种‘福鼎大白茶’（‘Fuding Dabaicha’）中克隆得到这2个隐花色素基因,分别命名为CsCRY1和CsCRY2。采用生物信息学方法,对茶树CsCRY1和CsCRY2基因编码蛋白的结构域、系统进化关系、二级结构和PHR结构域的三级结构进行分析,对CsCRY1和CsCRY2基因的启动子顺式作用元件及其功能进行了预测分析。结果显示:茶树CsCRY1基因开放阅读框长度为2 055 bp,编码684个氨基酸;CsCRY2基因开放阅读框长度为1 944 bp,编码647个氨基酸;CsCRY1和CsCRY2蛋白均在N端含有保守的PHR结构域,在C端含有保守的CCE结构域,这2个结构域在拟南芥[Arabidopsis thaliana（Linn.） Heynh.]中具有传导蓝光信号的功能。系统进化分析结果显示:CsCRY1和CsCRY2蛋白属于Plant CRY类隐花色素,其进化树分支距离与同目（杜鹃花目）植物滇山茶（Camel... 

【文章来源】：植物资源与环境学报. 2020,29(06)北大核心CSCD

【文章页数】：12 页

【部分图文】：

茶树CsCRY1和CsCRY2基因的PCR产物电泳图

以拟南芥AtCRY1的PHR晶体结构1u3d.1.A为参照模型,利用SWISS-MODEL在线软件预测茶树CsCRY1和CsCRY2蛋白PHR结构域的三级结构,结果(图5)显示:茶树CsCRY1和CsCRY2蛋白的PHR结构域与参照模型相似,主要由α螺旋、无规则卷曲和β折叠组成,且在N端具有α螺旋和β折叠结构域,与二级结构预测结果相吻合。图4 茶树Cs CRY1(A)和Cs CRY2(B)蛋白二级结构预测

茶树CsCRY1和CsCRY2蛋白PHR结构域的三级结构预测

【参考文献】：
期刊论文
[1]中国茶树遗传育种40年[J]. 王新超,王璐,郝心愿,曾建明,杨亚军.  中国茶叶. 2019(05)
[2]光对茶树生产与茶叶品质影响及其应用研究进展[J]. 俞少娟,王婷婷,陈寿松,林宏政,金心怡.  福建茶叶. 2016(05)
[3]拟南芥中光信号系统中关键基因CRY1、CRY2和COP1启动子的表达模式分析[J]. 汤淼,杨洪全.  植物生理学通讯. 2010(06)



本文编号：3319971