玉米幼胚胚性愈伤组织诱导能力候选基因GRMZM2G038183的功能初探
发布时间:2021-08-07 13:20
玉米基因功能研究是玉米品种改良的重要基础,系统地分析单个基因的功能或基因之间的功能互作,是未来几年研究的重点。植物遗传转化技术不仅被用于研究基因的功能,还被用于提升作物品质和抗性。玉米的遗传转化需要建立快速高效的玉米遗传转化体系,而目前玉米转化体系主要建立在18-599R、C01、B104、A188和HiII等少数能高效诱导胚性愈伤组织的优良转基因受体材料的基础上,我国的大多数骨干自交系由于胚性愈伤组织诱导率能力差仍不能直接作为转化的受体,这在很大程度上限制了我国转基因育种和功能基因研究的快速发展。因此研究玉米幼胚诱导胚性愈伤组织的功能基因、揭示其作用的分子机制具有重要意义。课题组前期利用全基因组关联分析和QTL定位共同检测到一个可能参与植物激素信号传导来调控玉米愈伤组织的形成的基因GRMZM2G038183,本研究进一步通过候选基因关联分析、拟南芥T-DNA插入突变体和玉米EMS突变体,拟南芥过表达等方式初步验证候选基因GRMZM2G038183在拟南芥和玉米幼胚胚性愈伤组织诱导过程中行使的生物学功能,旨在解析GRMZM2G038183基因和玉米幼胚胚性愈伤组织诱导能力的关系。主要研...
【文章来源】:四川农业大学四川省 211工程院校
【文章页数】:72 页
【学位级别】:硕士
【部分图文】:
GRMZM2G038183在植物中的的进化关系
本研究的技术路线
17图4总DNA琼脂糖凝胶电泳Fig.4TotalDNAagarosegelelectrophoresis(4)GRMZM2G038183的克隆与测序本研究通过PCR法在198份玉米自交系材料中克隆GRMZM2G038183。为了最大限度的减少人为误差,避免PCR导致的序列错误,扩增序列用高保真酶KOD进行扩增,每个样品重复三次,KOD酶的PCR扩增体系如下:PCR扩增体系为20μl:0.5μlKODFX,10μlKODbuffer,4μldNTPs,0.5μl上游引物F,0.5μl下游引物R,0.5μlDNA模板,4μlddH2O。PCR反应程序如下:预变性94℃2min变性98℃10s退火59℃30s35个循环延伸68℃3min20s再延伸68℃10min保存12℃Forever反应结束后,对PCR产物进行1%琼脂糖电泳检测,选取条带较亮且单一的片段进行切胶回收,回收纯化PCR片段直接送公司测序,为保证一致,对PCR片段进行双向测序,对于测序差异较大的,重新进行PCR扩增测序。利用SnapGene软件将反馈的测序结果与目标基因进行序列相似性比对,鉴定是否成功扩增目标基因。2.2.2GRMZM2G038183的序列多样性分析把测序成功的序列整理成FASTA格式,在BioEdit中将整理好的198条序列打开,使用AccessoryApplication中的clustalwMμltipealignment进行多序列比对,并将完成比对的序列保存为PHYLIP格式文件。用TASSEL5.2软件对GRMZM2G038183进行序列多样性分析,多样性分析采用SlidingWindow分析方法,Window设为300bp,
【参考文献】:
期刊论文
[1]玉米转基因受体材料的筛选研究[J]. 尚丽霞,于志晶,蔡勤安,孟凡钢,曾军,林秀峰,马瑞. 吉林农业科学. 2015(06)
[2]玉米幼胚和成熟胚愈伤组织诱导过程中内源激素的比较[J]. 贾小霞,王汉宁,孔维萍,梁慧光,张金文. 核农学报. 2009(04)
[3]玉米成熟胚胚性愈伤组织的诱导、高频再生及转化的研究[J]. 王世玉,郑用琏,刘亚,赵久然,张方东. 作物学报. 2008(03)
[4]玉米自交系幼胚高效再生系统的建立[J]. 马丽. 西北农业学报. 2007(06)
[5]玉米幼胚愈伤组织的诱导和植株再生的QTL分析[J]. 张红伟,刘亚娟,郭晓琳,张峰,李建生,陈刚,孙东发,谭振波. 作物学报. 2006(03)
[6]玉米幼胚培养能力性状QTL分析[J]. 潘光堂,张志明,魏昕,宋芸,赵茂俊,夏燕莉,荣廷昭. 作物学报. 2006(01)
[7]基因型及生长调节物质对玉米成熟胚培养的影响[J]. 曹俊梅,窦秉德,李生强,陈莉,杨晋彬,白光红. 淮阴师范学院学报(自然科学版). 2005(02)
[8]玉米离体花药培养体系的建立[J]. 付迎军. 延边大学农学学报. 2004(01)
[9]玉米幼胚培养胚性愈伤组织诱导力的遗传变异分析[J]. 潘光堂,夏燕莉,刘玉贞,荣廷昭. 作物学报. 2003(03)
[10]玉米基因型与幼胚培养胚性愈伤组织发生能力的初步研究[J]. 母贵琴,潘光堂,刘玉贞,夏燕莉. 四川农业大学学报. 2003(01)
博士论文
[1]玉米幼胚胚性愈伤组织诱导能力全基因组遗传解析及候选基因功能研究[D]. 罗旭.四川农业大学 2016
[2]玉米胚性愈伤组织形成相关基因克隆及功能分析[D]. 孙丽芳.吉林大学 2012
[3]玉米核心自交系群体结构及耐旱相关候选基因rab17的等位基因多样性分析[D]. 于永涛.中国农业科学院 2006
[4]玉米转基因工程育种优良受体筛选及遗传机理研究[D]. 潘光堂.四川农业大学 2004
硕士论文
[1]玉米再生候选基因ZmLEC1的序列变异及其与胚性愈伤形成能力的关联分析[D]. 李钊.东北农业大学 2013
[2]玉米耐旱相关候选基因dhn2与表型性状的关联分析[D]. 赵曦.中国农业科学院 2008
[3]农杆菌介导玉米自交系受体材料筛选及遗传转化体系的建立[D]. 王钰.四川农业大学 2006
本文编号:3327869
【文章来源】:四川农业大学四川省 211工程院校
【文章页数】:72 页
【学位级别】:硕士
【部分图文】:
GRMZM2G038183在植物中的的进化关系
本研究的技术路线
17图4总DNA琼脂糖凝胶电泳Fig.4TotalDNAagarosegelelectrophoresis(4)GRMZM2G038183的克隆与测序本研究通过PCR法在198份玉米自交系材料中克隆GRMZM2G038183。为了最大限度的减少人为误差,避免PCR导致的序列错误,扩增序列用高保真酶KOD进行扩增,每个样品重复三次,KOD酶的PCR扩增体系如下:PCR扩增体系为20μl:0.5μlKODFX,10μlKODbuffer,4μldNTPs,0.5μl上游引物F,0.5μl下游引物R,0.5μlDNA模板,4μlddH2O。PCR反应程序如下:预变性94℃2min变性98℃10s退火59℃30s35个循环延伸68℃3min20s再延伸68℃10min保存12℃Forever反应结束后,对PCR产物进行1%琼脂糖电泳检测,选取条带较亮且单一的片段进行切胶回收,回收纯化PCR片段直接送公司测序,为保证一致,对PCR片段进行双向测序,对于测序差异较大的,重新进行PCR扩增测序。利用SnapGene软件将反馈的测序结果与目标基因进行序列相似性比对,鉴定是否成功扩增目标基因。2.2.2GRMZM2G038183的序列多样性分析把测序成功的序列整理成FASTA格式,在BioEdit中将整理好的198条序列打开,使用AccessoryApplication中的clustalwMμltipealignment进行多序列比对,并将完成比对的序列保存为PHYLIP格式文件。用TASSEL5.2软件对GRMZM2G038183进行序列多样性分析,多样性分析采用SlidingWindow分析方法,Window设为300bp,
【参考文献】:
期刊论文
[1]玉米转基因受体材料的筛选研究[J]. 尚丽霞,于志晶,蔡勤安,孟凡钢,曾军,林秀峰,马瑞. 吉林农业科学. 2015(06)
[2]玉米幼胚和成熟胚愈伤组织诱导过程中内源激素的比较[J]. 贾小霞,王汉宁,孔维萍,梁慧光,张金文. 核农学报. 2009(04)
[3]玉米成熟胚胚性愈伤组织的诱导、高频再生及转化的研究[J]. 王世玉,郑用琏,刘亚,赵久然,张方东. 作物学报. 2008(03)
[4]玉米自交系幼胚高效再生系统的建立[J]. 马丽. 西北农业学报. 2007(06)
[5]玉米幼胚愈伤组织的诱导和植株再生的QTL分析[J]. 张红伟,刘亚娟,郭晓琳,张峰,李建生,陈刚,孙东发,谭振波. 作物学报. 2006(03)
[6]玉米幼胚培养能力性状QTL分析[J]. 潘光堂,张志明,魏昕,宋芸,赵茂俊,夏燕莉,荣廷昭. 作物学报. 2006(01)
[7]基因型及生长调节物质对玉米成熟胚培养的影响[J]. 曹俊梅,窦秉德,李生强,陈莉,杨晋彬,白光红. 淮阴师范学院学报(自然科学版). 2005(02)
[8]玉米离体花药培养体系的建立[J]. 付迎军. 延边大学农学学报. 2004(01)
[9]玉米幼胚培养胚性愈伤组织诱导力的遗传变异分析[J]. 潘光堂,夏燕莉,刘玉贞,荣廷昭. 作物学报. 2003(03)
[10]玉米基因型与幼胚培养胚性愈伤组织发生能力的初步研究[J]. 母贵琴,潘光堂,刘玉贞,夏燕莉. 四川农业大学学报. 2003(01)
博士论文
[1]玉米幼胚胚性愈伤组织诱导能力全基因组遗传解析及候选基因功能研究[D]. 罗旭.四川农业大学 2016
[2]玉米胚性愈伤组织形成相关基因克隆及功能分析[D]. 孙丽芳.吉林大学 2012
[3]玉米核心自交系群体结构及耐旱相关候选基因rab17的等位基因多样性分析[D]. 于永涛.中国农业科学院 2006
[4]玉米转基因工程育种优良受体筛选及遗传机理研究[D]. 潘光堂.四川农业大学 2004
硕士论文
[1]玉米再生候选基因ZmLEC1的序列变异及其与胚性愈伤形成能力的关联分析[D]. 李钊.东北农业大学 2013
[2]玉米耐旱相关候选基因dhn2与表型性状的关联分析[D]. 赵曦.中国农业科学院 2008
[3]农杆菌介导玉米自交系受体材料筛选及遗传转化体系的建立[D]. 王钰.四川农业大学 2006
本文编号:3327869
本文链接:https://www.wllwen.com/kejilunwen/jiyingongcheng/3327869.html
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