一株突破va基因型烟草抗性的PVY病毒分离物的鉴定
发布时间:2021-08-08 06:07
【背景和目的】近来,能突破va基因型抗性的马铃薯Y病毒(Potato virus Y,PVY)毒株在烟草上不断出现。2016年,我们分离到一株抗性突破的毒株PVY-CJ,本文对该病毒分离物进行了验证和鉴定。【方法】采用病毒重新接种、多重RT-PCR、RT-PCR分段扩增病毒全长基因组、PVY病毒分子进化分析及病毒蛋白VPg蛋白序列比对等方法对PVY-CJ毒株进行了验证和鉴定。【结果】三种重新接种了PVY-CJ的va基因型烟草品种均发病。多重RT-PCR结果将PVY-CJ鉴定为PVYNTN株系。序列分析表明,PVY-CJ全长基因组包含一个全长9180 nt的开放读框,其编码一个3060 AA的多聚蛋白。分子进化分析进一步验证了其归类于PVYNTN株系。相比其他PVYNTN株系毒株,PVY-CJ的VPg蛋白105位氨基酸出现了一个由赖氨酸到谷氨酸的替换,而这一氨基酸替换导致了其对va基因来源抗性的突破。【结论】我们首次报道并鉴定了国内一株能突破va基因型烟草抗性的PVY毒株—PVY-CJ。这为进一步研制PVY抗病烟草品种提供...
【文章来源】:中国烟草学报. 2020,26(04)北大核心CSCD
【文章页数】:6 页
【部分图文】:
PVY-CJ重新接种va基因型烟草
多重RT-PCR鉴定PVY-CJ株系
如图3所示,采用张帅等的分段RT-PCR方法[8]扩增PVY-CJ的全长基因组,所获得的条带大小均在3 kb~5 kb之间。对3段扩增产物进行测序,分别测通,因为3段产物的序列有重叠区域,故拼装3段序列最终得到长9614 nt的全长基因组(5′和3′非翻译区域不完整)。分析获得的基因组序列,发现PVY-CJ包含一个全长9180 nt的开放读框,开放读框编码一个长3060 AA的多聚蛋白。将该序列提交到Gen Bank,序列登录号为KY800342。如图4所示,参照Xiaojun Hu等PVY株系分子进化分析方法[10],对PVY-CJ进行分子进化分析。包括PVY-CJ在内的53个PVY毒株至少形成了7个簇,图示PVY-CJ归于PVYNTN株系,与前述多重RT-PCR结果一致。
【参考文献】:
期刊论文
[1]利用CRISPR-Cas9基因组编辑技术定向敲除烟草eIF4E-6基因[J]. 潘洪杏,刘侠,万秀清,乔婵,宋琳娜,郭兆奎,李若. 分子植物育种. 2017(02)
[2]贵州烟草上一株PVY坏死株系全序列测定与分析[J]. 张帅,杨金广,王凤龙,钱玉梅,申莉莉,王永. 中国烟草科学. 2011(01)
本文编号:3329382
【文章来源】:中国烟草学报. 2020,26(04)北大核心CSCD
【文章页数】:6 页
【部分图文】:
PVY-CJ重新接种va基因型烟草
多重RT-PCR鉴定PVY-CJ株系
如图3所示,采用张帅等的分段RT-PCR方法[8]扩增PVY-CJ的全长基因组,所获得的条带大小均在3 kb~5 kb之间。对3段扩增产物进行测序,分别测通,因为3段产物的序列有重叠区域,故拼装3段序列最终得到长9614 nt的全长基因组(5′和3′非翻译区域不完整)。分析获得的基因组序列,发现PVY-CJ包含一个全长9180 nt的开放读框,开放读框编码一个长3060 AA的多聚蛋白。将该序列提交到Gen Bank,序列登录号为KY800342。如图4所示,参照Xiaojun Hu等PVY株系分子进化分析方法[10],对PVY-CJ进行分子进化分析。包括PVY-CJ在内的53个PVY毒株至少形成了7个簇,图示PVY-CJ归于PVYNTN株系,与前述多重RT-PCR结果一致。
【参考文献】:
期刊论文
[1]利用CRISPR-Cas9基因组编辑技术定向敲除烟草eIF4E-6基因[J]. 潘洪杏,刘侠,万秀清,乔婵,宋琳娜,郭兆奎,李若. 分子植物育种. 2017(02)
[2]贵州烟草上一株PVY坏死株系全序列测定与分析[J]. 张帅,杨金广,王凤龙,钱玉梅,申莉莉,王永. 中国烟草科学. 2011(01)
本文编号:3329382
本文链接:https://www.wllwen.com/kejilunwen/jiyingongcheng/3329382.html
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