水母雪莲花青素合成相关基因的克隆及表达
发布时间：2021-08-10 04:19
为研究高山植物水母雪莲对强紫外辐射的分子适应机制,采用RT-PCR结合RACE技术从水母雪莲中克隆了参与调控花青素合成的相关基因（SmMYB1）,并采用hi-TAIL PCR方法扩增了该基因的启动子序列。结果表明:（1）序列分析显示,SmMYB1基因cDNA序列（GenBank登录号MT188353）全长1 011 bp,编码269个氨基酸,gDNA序列含有2个内含子和3个外显子。（2）生物信息学分析显示,SmMYB1基因编码蛋白和菊科MYB蛋白亲缘关系最近,含有保守的[DE]Lx（2）[RK] x（3）Lx（6）Lx（3）R和ANDV两个模体,属于拟南芥MYB第六亚族。SmMYB1基因启动子（GenBank登录号MT188354）全长1 407 bp,含有多个光响应元件。（3）荧光定量分析发现,SmMYB1基因在根、茎、叶和花中均表达,且在花中的表达量最高;在紫外胁迫下,SmMYB1基因的表达量在4 h达到最高,随后逐渐降低。研究推测SmMYB1基因可能参与调控水母雪莲花青素的合成以及对紫外辐射的响应过程。
【文章来源】：西北植物学报. 2020,40(11)北大核心CSCD
【文章页数】：7 页
【部分图文】：
SmMYB1基因的克隆
通过hiTAIL-PCR的办法扩增出1 407 bp(图1)的SmMYB1启动子序列(GenBank登录号为MT188354),与该基因mRNA的5′-UTR序列一致。PlantCREA在线预测均发现在启动子区域有大量光响应元件(AE-box、Box 4、G-Box和I-box),另外还存在应答低氧(ARE)、脱落酸(ABRE)、干旱(MBS)、病原菌(AT-rich sequence)等顺式作用元件(表2)。推测SmMYB1基因的表达主要受到了光信号的诱导。图3 菊科第六亚族MYB蛋白多序列比对
图2 不同物种MYB蛋白的进化关系分析表2 SmMYB1启动子中的顺式元件Table 2 The cis-acting elements in the SmMYB1 promoter 元件Element 功能Function 位置Position 序列Sequence 光应答 Light responsiveness AE-box 部分光应答组件 Part of a module for light response 485(+)、857(+) AGAAACAA I-box 部分光应答元件 Part of a light responsive element 820(-) CCATATCCAAT Box 4 部分光应答保守DNA组件 Part of a conserved DNA module involved in light responsiveness 1069(-)、1131(-) ATTAAT G-Box 光应答顺式作用元件 Cis-acting regulatory element involved in light responsiveness 1191(-)、1222(-)、1343(-) CACGTT/CACGTG/TACGTG 其他胁迫应答和发育相关Other stress response and development-related ARE 低氧诱导必需的顺式作用元件 Cis-acting regulatory element essential for the anaerobic induction 198(-)、503(+)、1333(+) AAACCA ABRE 脱落酸相应顺式作用元件 Cis-acting element involved in the abscisic acid responsiveness 1192(+)、1222(-)、1344(+) ACGTG MBS 干旱诱导MYB结合位点 MYB binding site involved in drought-inducibility 223(+) CAACTG AT-rich sequence 植物病原菌防御反应 Cis-acting regulatory element related to pathogen response 1112(-) TAAAATACT AT-rich element 富集AT的DNA结合蛋白(ATBP-1)作用元件 Binding site of AT-rich DNA binding protein (ATBP-1) 559(+)、619(+)、679(+) ATAGAAATCAA CAT-box 分生组织相关 Cis-acting regulatory element related to meristem expression 176(+)、1024(-) GCCACT
【参考文献】：
期刊论文
[1]UV-A和UV-B提高甘蓝幼苗花青素含量以及调控基因表达分析[J]. 齐艳,邢燕霞,郑禾,孙倩倩,李殿波,王晋芳,石锦,赵冰,郭仰东. 中国农业大学学报. 2014(02)
[2]紫外光源及太阳UV-B辐射的模拟实验[J]. 师生波,韩发. 生物技术通报. 2006(S1)
[3]海北高寒草甸地区太阳总辐射、植被反射辐射的有关特征[J]. 李英年,赵新全,曹广民,师生波. 草地学报. 2002(01)
本文编号：3333446
【文章来源】：西北植物学报. 2020,40(11)北大核心CSCD
【文章页数】：7 页
【部分图文】：
SmMYB1基因的克隆
通过hiTAIL-PCR的办法扩增出1 407 bp(图1)的SmMYB1启动子序列(GenBank登录号为MT188354),与该基因mRNA的5′-UTR序列一致。PlantCREA在线预测均发现在启动子区域有大量光响应元件(AE-box、Box 4、G-Box和I-box),另外还存在应答低氧(ARE)、脱落酸(ABRE)、干旱(MBS)、病原菌(AT-rich sequence)等顺式作用元件(表2)。推测SmMYB1基因的表达主要受到了光信号的诱导。图3 菊科第六亚族MYB蛋白多序列比对
图2 不同物种MYB蛋白的进化关系分析表2 SmMYB1启动子中的顺式元件Table 2 The cis-acting elements in the SmMYB1 promoter 元件Element 功能Function 位置Position 序列Sequence 光应答 Light responsiveness AE-box 部分光应答组件 Part of a module for light response 485(+)、857(+) AGAAACAA I-box 部分光应答元件 Part of a light responsive element 820(-) CCATATCCAAT Box 4 部分光应答保守DNA组件 Part of a conserved DNA module involved in light responsiveness 1069(-)、1131(-) ATTAAT G-Box 光应答顺式作用元件 Cis-acting regulatory element involved in light responsiveness 1191(-)、1222(-)、1343(-) CACGTT/CACGTG/TACGTG 其他胁迫应答和发育相关Other stress response and development-related ARE 低氧诱导必需的顺式作用元件 Cis-acting regulatory element essential for the anaerobic induction 198(-)、503(+)、1333(+) AAACCA ABRE 脱落酸相应顺式作用元件 Cis-acting element involved in the abscisic acid responsiveness 1192(+)、1222(-)、1344(+) ACGTG MBS 干旱诱导MYB结合位点 MYB binding site involved in drought-inducibility 223(+) CAACTG AT-rich sequence 植物病原菌防御反应 Cis-acting regulatory element related to pathogen response 1112(-) TAAAATACT AT-rich element 富集AT的DNA结合蛋白(ATBP-1)作用元件 Binding site of AT-rich DNA binding protein (ATBP-1) 559(+)、619(+)、679(+) ATAGAAATCAA CAT-box 分生组织相关 Cis-acting regulatory element related to meristem expression 176(+)、1024(-) GCCACT
【参考文献】：
期刊论文
[1]UV-A和UV-B提高甘蓝幼苗花青素含量以及调控基因表达分析[J]. 齐艳,邢燕霞,郑禾,孙倩倩,李殿波,王晋芳,石锦,赵冰,郭仰东. 中国农业大学学报. 2014(02)
[2]紫外光源及太阳UV-B辐射的模拟实验[J]. 师生波,韩发. 生物技术通报. 2006(S1)
[3]海北高寒草甸地区太阳总辐射、植被反射辐射的有关特征[J]. 李英年,赵新全,曹广民,师生波. 草地学报. 2002(01)
本文编号：3333446
本文链接：https://www.wllwen.com/kejilunwen/jiyingongcheng/3333446.html
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