南美白对虾肠道细菌抗生素抗性基因的研究

发布时间：2021-08-13 01:24

　　我国是水产养殖第一大国,对虾养殖是水产养殖的支柱产业。抗生素被广泛用于预防和治疗对虾易患的细菌性疾病。由于抗生素的滥用,对虾养殖环境和对虾体内抗生素污染严重,诱导了大量有抗生素抗性的细菌（Antibiotics resistance bacterium,ARB）及抗生素抗性基因（Antibiotics resistance genes,ARGs）的产生。ARGs普遍存在于养殖环境和养殖品体内,对虾肠道中ARGs污染所带来的食品安全性问题严重威胁着人类健康。因此研究ARGs在对虾肠道中的多样性,比较其在对虾养成期与成熟期的变化情况,分析其在健康对虾与患病对虾中的差异性,可以为对虾养殖合理用药提供指导并对市售对虾安全性评价提供重要参考。本课题采用传统分子生态学方法、传统微生物培养方法和宏质粒组高通量测序分析方法对对虾肠道ARGs多样性进行研究。以广州市4个水产市场所售南美白对虾为实验材料,提取肠道微生物总基因组DNA,用PCR和Q-PCR手段确定ARGs的种类和基因丰度。筛选纯化4类ARB并进行种属鉴定,确定ARB的抗生素抗性表现型和其所携带的ARGs基因型。建立了肠道微生物总质粒组提取方... 

【文章来源】：华南理工大学广东省 211工程院校 985工程院校 教育部直属院校

【文章页数】：97 页

【学位级别】：硕士

【部分图文】：

各样品肠道微生物总基因组DNA琼脂糖凝胶电泳结果

25图 2-2 30 个 ARGs 的 PCR 扩增电泳检测结果. 2-2 The agARGse gel electrophoresis results of 30 ARGs from genomic DNA(a:tracycline, from left to right,tetA, tetB, tetC, tetD, tetE, tetG, tetG′, tetK, tetL, tetMtetP, tetQ, tetS, tetX; b: ARGs of sulfonamides, 1, sulⅠ, 2, sulⅡ, 3, sulⅢ; c: ARGsquinolones, 1, qnrA, 3, qnrA′, 5, qnrB, 7, qnrS, 2, 4, 6, 8. blank control; d: ARGsolide, 1, ermB, 3, ermC, 5, ermF, 2, 4, 6, blank control; e: ARGs of β-lactams, 1, 2, blaSHV, 3, blaNDM,2, 4, 6, blank control)

第二章 对虾肠道中 ARGs 多样性分析M 1 2 3 4M 1 2 3 42.4.2.2 对 4 个样品的 tetA、tetB、tetC、tetE、sulⅠ、sulⅡ、qnrS、ermB 基因的 PCR 扩增结果对虾养殖中常用的抗生素有四环素类、磺胺类、喹诺酮类和大环内酯类。根据 30种 ARGs 的 PCR 初步检测结果，挑选检出率高，扩增效果好，引物特异性高，具有代表性的 4 类 ARGs(tetA、tetB、tetC、tetE、sulⅠ、sulⅡ、qnrS、ermB)共 8 个基因进行进步分析。分别以 4 个样品总基因组 DNA 为模板，对 8 个 ARGs 进行 PCR 扩增反应，PCR 产物电泳结果如图 2-3 所示。


本文编号：3339456