多芯片联合分析2型糖尿病发病相关基因及其与阿尔茨海默病的关系

发布时间：2021-08-15 01:56

　　目的利用生物信息学方法探索2型糖尿病发病的相关基因,并研究这些基因与阿尔茨海默病的关系。方法基因表达汇编（GEO）数据库下载GSE85192、GSE95849、GSE97760、GSE85426数据集,获得健康人和2型糖尿病患者外周血的差异基因,利用加权基因共表达网络（WGCNA）分析差异基因和临床性状的关系。使用DAVID数据库分析与2型糖尿病有关的差异基因的功能与相关通路,筛选关键蛋白。根据结果将Toll样受体4 （TLR4）作为关键基因,利用基因集富集分析（GSEA）分析GSE97760中与高表达TLR4基因相关的信号通路。通过GSE85426验证TLR4的表达量。结果富集分析显示,差异基因主要参与的生物学过程包括炎症反应、Toll样受体（TLR）信号通路、趋化因子产生的正向调节等。差异基因主要参与的信号通路有嘧啶代谢通路、TLR信号通路等。ILF2、TLR4、POLR2G、MMP9为2型糖尿病的关键基因。GSEA显示,TLR4上调可通过影响嘧啶代谢及TLR信号通路而导致2型糖尿病及阿尔茨海默病的发生。TLR4在阿尔茨海默病外周血中高表达。结论 ILF2、TLR4、POLR2G、... 

【文章来源】：中国医科大学学报. 2020,49(12)北大核心CSCD

【文章页数】：7 页

【部分图文】：

差异表达基因分层聚类树形图和热图

结果显示，差异基因主要参与的生物过程包括炎症反应，细胞对机械刺激的反应，Toll样受体（Tolllike receptor,TLR）信号通路，趋化因子、β干扰素产生的正向调节，组蛋白脱乙酰化等，见图4。图3 临床特征与模块特征相关性热图

TLR4高表达有关的KEGG通路


本文编号：3343610