棉花EIN3/EIL家族基因序列分析及GhEIL3基因克隆

发布时间：2021-08-18 18:25

　　该研究以拟南芥AtEIN3基因为探针,从陆地棉TM-1全基因组测序数据库中筛选其同源序列,序列分析得到16条具有EIN3结构域的基因序列。对陆地棉EIN3/EIL家族基因的基因结构、系统进化、序列相似性及结构域分布情况进行分析,发现它们与拟南芥EIN3/EIL家族基因在N端具有较高相似度,其中15条基因序列包含5个保守结构,1条包含4个保守结构。在此基础上,采用RT-PCR方法从抗枯萎病的陆地棉品种‘中棉所12’中克隆得到一个新的EIN3/EIL家族基因,命名为GhEIL3（GenBank登录号为KY072936）。序列分析表明:GhEIL3基因开放阅读框长1 092bp,编码363个氨基酸,含有一个EIN3结构域。实时荧光定量PCR（qRT-PCR）结果显示,GhEIL3基因在枯萎病菌诱导后呈上调表达,诱导后1h其相对表达量达到最大值,推测GhEIL3基因可能参与棉花对枯萎病菌的防御反应。 

【文章来源】：西北植物学报. 2017,37(03)北大核心CSCD

【文章页数】：8 页

【文章目录】：
1材料和方法
    1.1实验材料
    1.2方法
        1.2.1棉花EIN3/EIL基因家族生物信息学分析
        1.2.2棉花根部总RNA提取及cDNA合成
        1.2.3 GhEIL3基因克隆及序列分析
        1.2.4实时荧光定量PCR
2结果与分析
    2.1棉花EIN3/EIL基因家族生物信息学分析
        2.1.1棉花EIN3/EIL家族基因鉴定
        2.1.2拟南芥与棉花EIN3/EIL基因家族系统关系分析
        2.1.3棉花EIN3/EIL蛋白保守基序分析
        2.1.4拟南芥与棉花EIN3/EIL家族基因多序列比对
    2.2棉花GhEIL3基因克隆
    2.3棉花GhEIL3基因编码蛋白分析及结构预测
    2.4枯萎病菌诱导棉花GhEIL3表达模式分析
3讨论


【参考文献】：
期刊论文
[1]甜瓜EIN3/EILs基因家族全基因组鉴定与进化分析[J]. 马勇,莘少红,巴德仁贵,哈斯阿古拉.  基因组学与应用生物学. 2014(01)
[2]一种新的棉花黄、枯萎病快速接种方法的研究[J]. 彭姗,吕学莲,高峰,李国英,李晖.  棉花学报. 2008(03)
[3]利用改良的CTAB法提取棉花叶片总RNA[J]. 胡根海,喻树迅.  棉花学报. 2007(01)
[4]反义LeEIL2基因表达载体的构建及在番茄中的转化[J]. 薛印革,朱本忠,薛萍,田慧琴,罗云波.  河南农业科学. 2003(10)

博士论文
[1]拟南芥中EIN3EIL1通过抑制SA信号途径负调控植物的先天免疫反应[D]. 陈华民.上海交通大学 2008

硕士论文
[1]大豆疫霉根腐病抗性相关基因EIN3-1、EIN3-2的克隆及功能初步研究[D]. 方东鹏.东北农业大学 2014



本文编号：3350399