17α-乙炔基雌二醇对黄颡鱼稚鱼性逆转的诱导作用及关键基因筛选
发布时间:2021-08-20 00:30
鱼类的性别决定和分化受到遗传因素和环境因素的共同影响,环境中外源性类固醇激素往往可以彻底改变遗传因素决定的性别分化方向。本研究分别以粉碎的黄颡鱼饲料和卤虫作为激素载体,设置不同的EE2处理浓度,在稚鱼生长的不同时期对其进行处理,通过测定雌性率、性腺未发育个体占比以及成活率确定不同载体、不同生长时期和不同浓度处理对性别逆转的作用;并通过测定全雄黄颡鱼在处理后的增重率、特定生长率和肥满度以确定EE2(17α-乙炔基雌二醇)处理对雄性黄颡鱼稚鱼生长的影响;由此综合确定EE2处理黄颡鱼稚鱼性逆转的适宜载体、适宜处理浓度和适宜处理时期。以卤虫为载体使用浓度为200 μg/L的EE2连续处理9 dah全雄黄颡鱼40天,分别对处理0天、20天和40天的黄颡鱼性腺组织中的转录本进行转录组测序分析,并对处理0天、20天和40天时雄性黄颡鱼性腺中Cyp11b2、Cyp19a1a和Cyp17a的表达量通过荧光定量PCR检测,确定EE2诱导黄颡鱼稚鱼性逆转过程中可能的关键基因,为进一步研究黄颡鱼性别决定和性别维持的分子机制提供理论依据,为黄颡鱼的遗传育种提供理论和技术支持。结果如下:1.以饲料为载体的不同浓度...
【文章来源】:扬州大学江苏省
【文章页数】:80 页
【学位级别】:硕士
【部分图文】:
图1鱼性类固醇激素合成示意图(Nagahama,?1997)??Fig.l?Schematic?representation?of?synthesis?of?sex?steroids?of?fish?(Nagahama,?1997)??1.5.2鱼类性激素合成调控的重要基因??
图3建库测序流程图??Fig.3?Experiment?pipeline?of?sequencing??生物信息分析流程??)转录组测序原始数据的统计与拼接??测序产生的原始数据(Raw?data)进行预处理,通过cutadapt去除测序m过滤不合格的序列,得到有效数据(Cleandeta)。??本混合组装的策略,将所有样本最后进行归一化得到unigene?(unigen因进行去冗余去重复后得到的唯一),作为后续分析的参考序列。进行组装质量的评判,包括unigene的长度、GC含量和N50等。N50录组拼接结果好坏的一个判断标准,将所有组装出来的结果按照长度,当达到总长度一半时的长度为N50。??基因功能注释及分类??件DIAMOND对组装完的unigenes添加相应的功能注释。数据库来
扬州大学硕士论文。一般情况下,Q30大于80%就认为是可靠的。本试验所有样品的Q200都大于95%,因此认为本实验测序结果可靠。GC含量平均值为48.63布,GC含量过高(大于80%)或过低(小于20%)的unigenes不存在,成情况良好,测序质量较好。??OC?Content?DtftirK>uti〇n??
【参考文献】:
期刊论文
[1]转录组学技术在水产动物研究中的运用[J]. 罗辉,叶华,肖世俊,郑曙明,王晓清,王志勇. 水产学报. 2015(04)
[2]转录组与RNA-Seq技术[J]. 张春兰,秦孜娟,王桂芝,纪志宾,王建民. 生物技术通报. 2012(12)
[3]鱼类性别决定与分化相关基因研究进展[J]. 文爱韵,尤锋,徐永立,张培军. 海洋科学. 2008(01)
[4]从XY雌鱼雌核发育产生YY超雄黄颡鱼[J]. 刘汉勤,崔书勤,侯昌春,徐江,陈宏溪. 水生生物学报. 2007(05)
[5]鱼类免疫学研究进展[J]. 唐玫,马广智,徐军. 免疫学杂志. 2002(S1)
本文编号:3352443
【文章来源】:扬州大学江苏省
【文章页数】:80 页
【学位级别】:硕士
【部分图文】:
图1鱼性类固醇激素合成示意图(Nagahama,?1997)??Fig.l?Schematic?representation?of?synthesis?of?sex?steroids?of?fish?(Nagahama,?1997)??1.5.2鱼类性激素合成调控的重要基因??
图3建库测序流程图??Fig.3?Experiment?pipeline?of?sequencing??生物信息分析流程??)转录组测序原始数据的统计与拼接??测序产生的原始数据(Raw?data)进行预处理,通过cutadapt去除测序m过滤不合格的序列,得到有效数据(Cleandeta)。??本混合组装的策略,将所有样本最后进行归一化得到unigene?(unigen因进行去冗余去重复后得到的唯一),作为后续分析的参考序列。进行组装质量的评判,包括unigene的长度、GC含量和N50等。N50录组拼接结果好坏的一个判断标准,将所有组装出来的结果按照长度,当达到总长度一半时的长度为N50。??基因功能注释及分类??件DIAMOND对组装完的unigenes添加相应的功能注释。数据库来
扬州大学硕士论文。一般情况下,Q30大于80%就认为是可靠的。本试验所有样品的Q200都大于95%,因此认为本实验测序结果可靠。GC含量平均值为48.63布,GC含量过高(大于80%)或过低(小于20%)的unigenes不存在,成情况良好,测序质量较好。??OC?Content?DtftirK>uti〇n??
【参考文献】:
期刊论文
[1]转录组学技术在水产动物研究中的运用[J]. 罗辉,叶华,肖世俊,郑曙明,王晓清,王志勇. 水产学报. 2015(04)
[2]转录组与RNA-Seq技术[J]. 张春兰,秦孜娟,王桂芝,纪志宾,王建民. 生物技术通报. 2012(12)
[3]鱼类性别决定与分化相关基因研究进展[J]. 文爱韵,尤锋,徐永立,张培军. 海洋科学. 2008(01)
[4]从XY雌鱼雌核发育产生YY超雄黄颡鱼[J]. 刘汉勤,崔书勤,侯昌春,徐江,陈宏溪. 水生生物学报. 2007(05)
[5]鱼类免疫学研究进展[J]. 唐玫,马广智,徐军. 免疫学杂志. 2002(S1)
本文编号:3352443
本文链接:https://www.wllwen.com/kejilunwen/jiyingongcheng/3352443.html
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