结直肠癌关键基因突变对肿瘤进展的影响
发布时间:2021-08-21 07:01
结直肠癌仍然是世界范围内高发的恶性肿瘤之一。尽管结直肠癌的早期筛查和治疗技术不断发展进步,但晚期结直肠癌的总体生存率仍不尽如人意。而肿瘤转移(包括淋巴转移和远处转移)仍旧是绝大多数结直肠癌患者死亡的主要原因。目前已发现结直肠癌的发生发展过程中存在许多关键基因突变,然而仍未鉴定出结直肠癌进展尤其是转移的驱动突变。因此,本研究以此为切入点研究结直肠癌相关基因突变与其发生发展过程中的关系。1、结直肠癌关键基因变对肿瘤进展的影响从结直肠正常结肠上皮,腺瘤,恶性转化为癌,最后发展为肿瘤转移是结直肠癌发生发展的经典线性模型。在这个过程中一些关键基因会发生一系列突变。到目前为止,许多研究已经报道这些关键基因突变与结直肠癌转移的关系。但是由于单个研究的样本量小、人群差异等因素,不同研究得出的结论存在矛盾。我们通过生物信息学分析确定了 APC、KRAS、BRAF、PIK3CA、SAMD4、p53等6个关键基因。然后在PubMed、Embase、Cochrane Library和TCGA数据库中进行系统检索后(截至2017年11月30日),纳入发表的120篇文章,利用Meta分析的方法明确了这些关键基因突...
【文章来源】:浙江大学浙江省 211工程院校 985工程院校 教育部直属院校
【文章页数】:72 页
【学位级别】:硕士
【部分图文】:
p53的突变促进结直肠癌的远端转移
4.2.1?AMER1基因在结直肠癌中的突变情况??对上述数据集中的69例结直肠癌患者的测序样本进行分析后,得到若干存在??高频突变的基因,见图4-1。AMER1在69例样本中存在5例突变,其突变频率约??为9%
?AMER1文变对结ft肠癌进展的影响??同时,我们对AMER]出现的7例突变进行了位点分析,如图4-2所示,其中??6例均为截断突变,1例为错义突变。各突变位点如表4-3所示。????uousense?mutation??i?2????ousseusc?muiadoD????????????m??°?I?Hffn?ri? ̄"liniT11?■""r11?MlIII?II?II?■■I?Iin??0?200?400?600?800?1000?U3Sm??图4-2?AMER1基因的突变位点及突变类型??表4-3?AMER1基因的突变位点及突变类型??Sample?ID?Protein?Change?Mutation?Type??201007824?R631?*?Nonsense?Mutation??EV-074?R626*?Nonsense?Mutation??EV-061?R601?*?Nonsense?Mutation??201125366?P544fs?Nonsense?Mutation??EV-050?R531?*?Nonsense?Mutation??200729812?T455P?Missense?Mutation??EV-051?R358*?Nonsense?Mutation??4.2.3?AMERl基因在结直肠癌细胞系中的表达情况??本实验使用Western?Blot检测了结直肠癌细胞系中AMER1的表达水平。结果??如图4-3所示
【参考文献】:
期刊论文
[1]BRAF mutation in colorectal carcinomas with signet ring cell component[J]. Serap Yalcin,Onder Onguru. Cancer Biology & Medicine. 2017(03)
[2]Mutation analysis of 13 driver genes of colorectal cancer-related pathways in Taiwanese patients[J]. Yuli Christine Chang,Jan-Gowth Chang,Ta-Chih Liu,Chien-Yu Lin,Shu-Fen Yang,Cheng-Mao Ho,William Tzu-Liang Chen,Ya-Sian Chang. World Journal of Gastroenterology. 2016(07)
[3]KRAS and BRAF gene mutations and DNA mismatch repair status in Chinese colorectal carcinoma patients[J]. Ju-Xiang Ye,Yan Liu,Yun Qin,Hao-Hao Zhong,Wei-Ning Yi,Xue-Ying Shi. World Journal of Gastroenterology. 2015(05)
[4]Deficient DNA mismatch repair is associated with favorable prognosis in Thai patients with sporadic colorectal cancer[J]. Krittiya Korphaisarn,Ananya Pongpaibul,Chanin Limwongse,Ekkapong Roothumnong,Wipawi Klaisuban,Akarin Nimmannit,Artit Jinawath,Charuwan Akewanlop. World Journal of Gastroenterology. 2015(03)
本文编号:3355117
【文章来源】:浙江大学浙江省 211工程院校 985工程院校 教育部直属院校
【文章页数】:72 页
【学位级别】:硕士
【部分图文】:
p53的突变促进结直肠癌的远端转移
4.2.1?AMER1基因在结直肠癌中的突变情况??对上述数据集中的69例结直肠癌患者的测序样本进行分析后,得到若干存在??高频突变的基因,见图4-1。AMER1在69例样本中存在5例突变,其突变频率约??为9%
?AMER1文变对结ft肠癌进展的影响??同时,我们对AMER]出现的7例突变进行了位点分析,如图4-2所示,其中??6例均为截断突变,1例为错义突变。各突变位点如表4-3所示。????uousense?mutation??i?2????ousseusc?muiadoD????????????m??°?I?Hffn?ri? ̄"liniT11?■""r11?MlIII?II?II?■■I?Iin??0?200?400?600?800?1000?U3Sm??图4-2?AMER1基因的突变位点及突变类型??表4-3?AMER1基因的突变位点及突变类型??Sample?ID?Protein?Change?Mutation?Type??201007824?R631?*?Nonsense?Mutation??EV-074?R626*?Nonsense?Mutation??EV-061?R601?*?Nonsense?Mutation??201125366?P544fs?Nonsense?Mutation??EV-050?R531?*?Nonsense?Mutation??200729812?T455P?Missense?Mutation??EV-051?R358*?Nonsense?Mutation??4.2.3?AMERl基因在结直肠癌细胞系中的表达情况??本实验使用Western?Blot检测了结直肠癌细胞系中AMER1的表达水平。结果??如图4-3所示
【参考文献】:
期刊论文
[1]BRAF mutation in colorectal carcinomas with signet ring cell component[J]. Serap Yalcin,Onder Onguru. Cancer Biology & Medicine. 2017(03)
[2]Mutation analysis of 13 driver genes of colorectal cancer-related pathways in Taiwanese patients[J]. Yuli Christine Chang,Jan-Gowth Chang,Ta-Chih Liu,Chien-Yu Lin,Shu-Fen Yang,Cheng-Mao Ho,William Tzu-Liang Chen,Ya-Sian Chang. World Journal of Gastroenterology. 2016(07)
[3]KRAS and BRAF gene mutations and DNA mismatch repair status in Chinese colorectal carcinoma patients[J]. Ju-Xiang Ye,Yan Liu,Yun Qin,Hao-Hao Zhong,Wei-Ning Yi,Xue-Ying Shi. World Journal of Gastroenterology. 2015(05)
[4]Deficient DNA mismatch repair is associated with favorable prognosis in Thai patients with sporadic colorectal cancer[J]. Krittiya Korphaisarn,Ananya Pongpaibul,Chanin Limwongse,Ekkapong Roothumnong,Wipawi Klaisuban,Akarin Nimmannit,Artit Jinawath,Charuwan Akewanlop. World Journal of Gastroenterology. 2015(03)
本文编号:3355117
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