松墨天牛转录组研究及其生物防治相关基因鉴定与分析

发布时间：2021-08-21 21:07

　　松墨天牛是松材线虫病的主要传播媒介。利用病原微生物和寄生性天敌防治松墨天牛已是生产实践中常用的手段。然而,对于松墨天牛幼虫不同龄期的转录组信息仍知之甚少,阻碍了松墨天牛分子生物学研究的进一步深入和生物防治新技术的开发。本文利用第三代测序技术,测定了 1龄-4龄松墨天牛幼虫的转录组数据。在转录组中挖掘出了杀虫剂抗性相关基因、RNAi、Bt受体、肠道消化酶、潜在昆虫靶标、免疫相关分子、木质纤维素和嗅觉基因家族等相关基因,构建了肠道消化酶、木质纤维素和嗅觉基因家族的系统进化树。最后,分析了肠道消化酶的基因差异表达,并筛选出稳定表达的肠道消化酶进行生物信息学分析。本研究筛选出了大量与生物防治相关的基因,并获得了稳定表达的肠道消化酶,为后期开发新的分子工具和生物防治技术奠定了理论基础。 

【文章来源】：福建农林大学福建省

【文章页数】：68 页

【学位级别】：硕士

【部分图文】：

图１功能基因长度分布（Ｙ轴数值已被转换成对数比例）??３．２预测蛋白质的注释??

注释的ｕｎｉｇｅｎｅｓ有４０，?９４３个，Ｅ值分布显示５６．１４％的比对序列与其他物种具有??较强的同源性（小于１．（＾％），４３．８６％的序列同源性介于１．０￡＿５至１．｛＾４９之??间（图２Ａ）。以Ｅ值最小的结果为准，松墨天牛分别有４７．?７７％和１３．?８２％的序??列与同属銷翅目（Ｃｏｌｅｏｐｔｅｒａｎ）的赤拟谷盗（７＞／６〇／／膽ａｗ／ｃ／ｒｔｅｗｍ）和中欧山松??大小蠹如７Ｗ５７；ｗ？ｃ／ｅｍｒａ￡〇具有同源性，而比对到其他昆虫的序列所占比??例少于２３％?（图２）。??如图２所不，Ａ中每个独特序列的ＢＬＡＳＴ命中率的Ｅ值分布的截止Ｅ值为??１－０Ｅ－５；?Ｂ表示ＢＬＡＳＴＸ结果的物种分布。每个序列的第一个命中被用于进一步??的计算机分析。??１０??

?结果与分析???部分与质体和线粒体有关的基因治分子功能类别中，基因主要聚集在结合??（ｂｉｎｄｉｎｇ）?（４２．?００％）和催化活性（ｃａｔａｌｙｔｉｃ?ａｃｔｉｖｉｔｙ）?（３９．?６２％）；另夕卜也有??基因与转运蛋白活性（ｔｒａｎｓｐｏｒｔｅｒ?ａｃｔｉｖｉｔｙ）?（５．?２１％）和结构分子活性（ｓｔｒｕｃｔｕｒａｌ??ｍｏｌｅｃｕｌｅ?ａｃｔｉｖｉｔｙ）?（２．７８％）等有关。在云南切梢小蠢的转录组研究中也报道了??相似的涉及新陈代谢过程的基因分类。综上，ＧＯ注释描述了松墨天牛基因表达??基因总体表达的特征，阐述了多种结构蛋白，调节蛋白和应激蛋白的表达基因。??图３表示分配给松墨天牛转录组的ＧＯ类别的分布。功能基因被分为三类：??细胞组分、分子功能和生物过程。右ｙ轴表示一个类别中的基因数；左ｙ轴表示??特定基因的百分比。??ＧＯ?Ｃｌａｓｓｉｆｉｃａｔｉｏｎ??１Ｍ？??＇—：?＿?１?????—?２０２０９??

【参考文献】：
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本文编号：3356340