干酪乳杆菌LC2W胞外多糖生物合成基因簇启动子的鉴定
发布时间：2021-08-28 11:18
干酪乳杆菌LC2W是一株高产胞外多糖的益生乳酸菌,其胞外多糖具有独特的物化特性和益生活性,应用潜力巨大。但LC2W胞外多糖（EPS）生物合成的基因调控研究较少,其核心元件启动子尚未明确。为鉴定干酪乳杆菌LC2W中eps基因簇的启动子,本研究采用生物信息学方法预测得到8个潜在启动子区域,通过RT-PCR方法鉴定出6个启动子元件P2169-2170、P2172-2173、P2174-2175、P2175-2176、P2185-2186、P2189-2190,为干酪乳杆菌EPS合成的转录调控研究奠定基础。
【文章来源】：工业微生物. 2020,50(04)
【文章页数】：5 页
【部分图文】：
干酪乳杆菌LC2W中预测的eps基因簇及启动子预测
RT-PCR结果表明(图2)，干酪乳杆菌LC2W的eps基因簇中存在5个操纵子，其余2个基因皆为单基因转录单位。基因簇上存在个6个启动子区域，分别为P2169-2170、P2172-2173、P2174-2175、P2175-2176、P2185-2186、P2189-2190。与生物信息学方法预测的结果相比，有5个潜在启动子区域P2179-2180、P2180-2181、P2182-2183、P2183-2184和P2187-2188不存在启动子结构，而P2169-2170、P2185-2186、P2189-2190是3个正确的启动子。此外，基因簇上发现了3个未被预测到的启动子P2172-2173、P2174-2175、P2175-2176。不同细菌启动子基因的差异性会影响预测结果，这可能是造成本研究通过RT-PCR鉴定得到的启动子与生物信息学预测结果不同的重要原因[11]。3 结论
【参考文献】：
期刊论文
[1]肺炎链球菌cps操纵子的启动子序列点突变可导致细菌荚膜缺失[J]. 王建敏,徐绣宇,马峰,徐红梅,王丽滨,邢燕,粟玉凤,张雪梅. 微生物学报. 2015(06)
本文编号：3368416
【文章来源】：工业微生物. 2020,50(04)
【文章页数】：5 页
【部分图文】：
干酪乳杆菌LC2W中预测的eps基因簇及启动子预测
RT-PCR结果表明(图2)，干酪乳杆菌LC2W的eps基因簇中存在5个操纵子，其余2个基因皆为单基因转录单位。基因簇上存在个6个启动子区域，分别为P2169-2170、P2172-2173、P2174-2175、P2175-2176、P2185-2186、P2189-2190。与生物信息学方法预测的结果相比，有5个潜在启动子区域P2179-2180、P2180-2181、P2182-2183、P2183-2184和P2187-2188不存在启动子结构，而P2169-2170、P2185-2186、P2189-2190是3个正确的启动子。此外，基因簇上发现了3个未被预测到的启动子P2172-2173、P2174-2175、P2175-2176。不同细菌启动子基因的差异性会影响预测结果，这可能是造成本研究通过RT-PCR鉴定得到的启动子与生物信息学预测结果不同的重要原因[11]。3 结论
【参考文献】：
期刊论文
[1]肺炎链球菌cps操纵子的启动子序列点突变可导致细菌荚膜缺失[J]. 王建敏,徐绣宇,马峰,徐红梅,王丽滨,邢燕,粟玉凤,张雪梅. 微生物学报. 2015(06)
本文编号：3368416
本文链接：https://www.wllwen.com/kejilunwen/jiyingongcheng/3368416.html
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